45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0328 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_0328  hypothetical protein  100 
 
 
512 aa  1006    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0953892  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0412  hypothetical protein  76.95 
 
 
510 aa  789    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.218055 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10290  hypothetical protein  60.73 
 
 
538 aa  585  1e-166  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.225236  normal  0.597294 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0360  hypothetical protein  62.91 
 
 
516 aa  585  1e-166  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0666092  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0371  hypothetical protein  62.72 
 
 
516 aa  583  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0381  hypothetical protein  62.72 
 
 
516 aa  583  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.646066 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5556  hypothetical protein  49.8 
 
 
504 aa  462  1e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5959  hypothetical protein  49.8 
 
 
504 aa  462  1e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11813  hypothetical protein  38.06 
 
 
506 aa  295  1e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.320654 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5778  hypothetical protein  36.44 
 
 
505 aa  280  4e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.981226  normal  0.352766 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0074  hypothetical protein  36.59 
 
 
491 aa  267  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447758  normal  0.155146 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0065  hypothetical protein  36.59 
 
 
491 aa  267  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0055  hypothetical protein  36.59 
 
 
491 aa  266  5e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00921629 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13904  hypothetical protein  38.09 
 
 
480 aa  264  3e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.784362 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3295  protein of unknown function DUF690  36.29 
 
 
496 aa  257  3e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.061282  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0772  hypothetical protein  37.25 
 
 
493 aa  257  3e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13930  hypothetical protein  36.46 
 
 
495 aa  250  5e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.906406  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0073  hypothetical protein  37.22 
 
 
495 aa  247  3e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0449137 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5462  hypothetical protein  35.34 
 
 
486 aa  240  4e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.309937  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1444  hypothetical protein  35.71 
 
 
461 aa  229  7e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.129092  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13487  hypothetical protein  35.07 
 
 
482 aa  217  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0376841  normal  0.0257137 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4962  hypothetical protein  37.08 
 
 
453 aa  200  5e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.250808  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3367  protein of unknown function DUF690  33.6 
 
 
472 aa  187  3e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1123  hypothetical protein  33.76 
 
 
485 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1150  hypothetical protein  33.76 
 
 
457 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.431987 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1140  hypothetical protein  33.76 
 
 
457 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6576  protein of unknown function DUF690  27.82 
 
 
540 aa  149  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.373249  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04350  Protein of unknown function (DUF690)  28.99 
 
 
519 aa  140  7e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1440  hypothetical protein  26.26 
 
 
467 aa  114  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.1984  normal  0.242396 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0396  hypothetical protein  27.63 
 
 
448 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.290872  normal  0.769323 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0941  hypothetical protein  26.64 
 
 
472 aa  110  6e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.15053  normal  0.447115 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1208  protein of unknown function DUF690  27.42 
 
 
481 aa  92  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.997125 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0477  hypothetical protein  24.65 
 
 
479 aa  90.5  6e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.022428 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8088  hypothetical protein  26.25 
 
 
483 aa  87.4  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2228  hypothetical protein  28.06 
 
 
458 aa  85.9  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.359411  normal  0.0897781 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0986  hypothetical protein  24.68 
 
 
453 aa  82.4  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0609  protein of unknown function DUF690  24.58 
 
 
467 aa  79.7  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8476  protein of unknown function DUF690  27.81 
 
 
470 aa  76.6  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3150  protein of unknown function DUF690  25.44 
 
 
488 aa  76.6  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4812  protein of unknown function DUF690  26.07 
 
 
459 aa  75.5  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0399688  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4839  hypothetical protein  27.27 
 
 
454 aa  72  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000509999 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0674  hypothetical protein  23.73 
 
 
464 aa  68.6  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.957662  normal  0.340047 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0690  hypothetical protein  23.36 
 
 
487 aa  63.2  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.335063  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7885  protein of unknown function DUF690  23.7 
 
 
465 aa  61.6  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0519943  normal  0.0107564 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3203  protein of unknown function DUF690  27.71 
 
 
459 aa  49.7  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.161915 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>