48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4700 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4700  integrase, catalytic region  100 
 
 		 65 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.454962 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1515  integrase catalytic region  64.29 
 
 		 178 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.60322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5447  Integrase catalytic region  62.86 
 
 		 277 aa  84.7  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.681137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0142  integrase, catalytic region  55.71 
 
 		 111 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0308  integrase, catalytic region  57.14 
 
 		 316 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2918  integrase, catalytic region  57.14 
 
 		 316 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2818  integrase, catalytic region  57.14 
 
 		 316 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2225  integrase, catalytic region  57.14 
 
 		 316 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00213091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1296  integrase, catalytic region  57.14 
 
 		 316 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1293  integrase, catalytic region  57.14 
 
 		 329 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.345302  normal  0.407109 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1097  integrase, catalytic region  57.14 
 
 		 316 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.495543  normal  0.303219 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0838  integrase, catalytic region  57.14 
 
 		 286 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.204021  hitchhiker  0.00436144 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0366  integrase, catalytic region  57.14 
 
 		 329 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.680873 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1717  integrase, catalytic region  57.14 
 
 		 316 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0171721  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0481  integrase, catalytic region  57.14 
 
 		 316 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.791017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2850  integrase, catalytic region  57.14 
 
 		 329 aa  74.3  0.0000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2899  integrase, catalytic region  57.14 
 
 		 327 aa  74.3  0.0000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0219368 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7134  Integrase catalytic core  57.14 
 
 		 303 aa  73.9  0.0000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2557  integrase, catalytic region  54.29 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.805017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2422  Integrase catalytic region  52.86 
 
 		 330 aa  72.4  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0481  integrase catalytic region  52.86 
 
 		 463 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0692  Integrase catalytic region  52.86 
 
 		 330 aa  72.8  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.229145  normal  0.133209 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1668  Integrase catalytic region  52.86 
 
 		 330 aa  72.8  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.412192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2721  Integrase catalytic region  52.86 
 
 		 330 aa  72.4  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.562875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3258  Integrase catalytic region  52.86 
 
 		 330 aa  72.8  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0122  integrase, catalytic region  52.86 
 
 		 221 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0176  transposase, putative  52.86 
 
 		 320 aa  71.2  0.000000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3743  hypothetical protein  50 
 
 		 319 aa  70.9  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3839  hypothetical protein  50 
 
 		 319 aa  70.9  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.247548  normal  0.0595051 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1814  integrase catalytic subunit  50 
 
 		 319 aa  70.9  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0485004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0053  integrase catalytic subunit  50 
 
 		 319 aa  70.9  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.142705  normal  0.776199 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3474  hypothetical protein  50 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.180544 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2291  Integrase catalytic region  51.43 
 
 		 348 aa  68.9  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.152349 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1875  Integrase catalytic region  51.43 
 
 		 355 aa  68.6  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0702445 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2917  integrase, catalytic region  50 
 
 		 321 aa  68.2  0.00000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.437302 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0952  hypothetical protein  50.7 
 
 		 320 aa  61.6  0.000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1176  hypothetical protein  49.3 
 
 		 284 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.118975 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1273  hypothetical protein  49.3 
 
 		 314 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0999856 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0554  hypothetical protein  47.89 
 
 		 314 aa  56.2  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000279647 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25530  Integrase, catalytic domain-containing protein  50 
 
 		 265 aa  55.5  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1767  integrase catalytic subunit  47.06 
 
 		 316 aa  50.1  0.000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.417793 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0224  integrase catalytic subunit  47.06 
 
 		 316 aa  50.1  0.000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1780  integrase catalytic subunit  47.06 
 
 		 316 aa  50.1  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0228632  normal  0.851382 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2400  integrase catalytic subunit  47.06 
 
 		 316 aa  50.1  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.61618  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1353  integrase catalytic subunit  47.06 
 
 		 316 aa  50.1  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.4232  normal  0.0729626 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1054  integrase catalytic subunit  47.06 
 
 		 316 aa  50.1  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.161609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0529  integrase, catalytic core  45.59 
 
 		 259 aa  44.3  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3372  integrase catalytic region  41.43 
 
 		 321 aa  41.6  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>