50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3457 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3457  putative nucleotidyltransferase  100 
 
 		 203 aa  411  1e-114  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.270829  normal  0.100357 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2093  putative nucleotidyltransferase  60.82 
 
 		 201 aa  250  1e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2088  putative nucleotidyltransferase  51.49 
 
 		 204 aa  221  4.9999999999999996e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1018  putative nucleotidyltransferase  48.72 
 
 		 200 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.602577  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1407  5-deoxyadenosylcobinamide phosphate nucleotidyltransferase  33.5 
 
 		 201 aa  120  9.999999999999999e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000635421  normal  0.360925 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0746  hypothetical protein  34.38 
 
 		 200 aa  117  9e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0939  5-deoxyadenosylcobinamide phosphate nucleotidyltransferase  36 
 
 		 197 aa  115  3e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.420308  normal  0.929646 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2150  5-deoxyadenosylcobinamide phosphate nucleotidyltransferase  33.83 
 
 		 209 aa  115  6e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.78489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1446  5-deoxyadenosylcobinamide phosphate nucleotidyltransferase  36.92 
 
 		 196 aa  111  6e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.95951  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0142  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  34.69 
 
 		 181 aa  103  2e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.854914 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2497  GTP:adenosylcobinamide- phosphateguanylyltransfer ase  33.16 
 
 		 184 aa  97.4  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0101489  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0234  GTP:adenosylcobinamide-phosphate guanylyltransferase  30.29 
 
 		 217 aa  93.6  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.453209 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0162  nucleotidyl transferase  34.34 
 
 		 202 aa  92.4  4e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.998873  normal  0.168869 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0722  nucleotidyl transferase  39.2 
 
 		 202 aa  89.4  3e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.233715  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0989  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  27.4 
 
 		 243 aa  89  4e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0202  hypothetical protein  31.88 
 
 		 202 aa  85.9  4e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.361982  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2835  GTP:adenosylcobinamide-phosphateguanylyl transferase-like protein  31.28 
 
 		 202 aa  84.7  9e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0006  5'-deoxyadenosylcobinamide phosphate nucleotidyltransferase  31.46 
 
 		 201 aa  84  0.000000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.318315  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1581  5-deoxyadenosylcobinamide phosphate nucleotidyltransferase  27.46 
 
 		 194 aa  82.4  0.000000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1725  nucleoside triphosphate  29.37 
 
 		 177 aa  56.2  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0559  GTP:adenosylcobinamide-phosphate guanylyltransferase-like protein  25.89 
 
 		 166 aa  54.3  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1417  nucleotidyl transferase, putative  32.59 
 
 		 240 aa  51.6  0.000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.572414  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12400  4-diphosphocytidyl-2-methyl-D-erythritol synthase  27.52 
 
 		 242 aa  49.7  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0601  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A-like protein  27.87 
 
 		 242 aa  48.5  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4563  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  27.74 
 
 		 575 aa  48.5  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1118  2-C-methyl-D-erythritol 4-phosphate cytidylyltransferase  29.57 
 
 		 249 aa  48.1  0.00009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21940  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase /glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase  30.33 
 
 		 470 aa  47.4  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00311649 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1117  2-C-methyl-D-erythritol 4-phosphate cytidylyltransferase  29.57 
 
 		 249 aa  47  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0133813  normal  0.923031 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1165  2-C-methyl-D-erythritol 4-phosphate cytidylyltransferase  27.48 
 
 		 382 aa  45.8  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1973  2-C-methyl-D-erythritol 4-phosphate cytidylyltransferase  35.9 
 
 		 228 aa  45.8  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.278739 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1188  2-C-methyl-D-erythritol 4-phosphate cytidylyltransferase  29.57 
 
 		 249 aa  45.4  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.340354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0360  hypothetical protein  29.08 
 
 		 190 aa  45.1  0.0007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000717889  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003507  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  25.62 
 
 		 195 aa  43.9  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.8361  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2295  molybdenum cofactor guanylyltransferase  24 
 
 		 192 aa  44.3  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.858852  normal  0.171843 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3971  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein MobA  23.76 
 
 		 192 aa  44.3  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000316964  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0706  2-C-methyl-D-erythritol 4-phosphate cytidylyltransferase  28.57 
 
 		 474 aa  43.1  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.266926  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1003  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  24.19 
 
 		 233 aa  42.7  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0351044  normal  0.0384577 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3494  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein MobA  54.29 
 
 		 210 aa  42.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.566282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2601  molybdopterin binding domain-containing protein  23.53 
 
 		 534 aa  43.1  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.205872  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0076  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  25.12 
 
 		 195 aa  42.7  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0084  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  28.24 
 
 		 196 aa  43.1  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2953  nucleotidyl transferase  24.04 
 
 		 221 aa  42.7  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.295776  normal  0.0446833 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1133  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein MobA  28.23 
 
 		 203 aa  42  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2230  acylneuraminate cytidylyltransferase  27.52 
 
 		 246 aa  42  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0057  hypothetical protein  24.3 
 
 		 261 aa  42  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2755  2-C-methyl-D-erythritol 4-phosphate cytidylyltransferase  31.03 
 
 		 253 aa  42  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.312562  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1415  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  25.53 
 
 		 204 aa  42  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1038  2-C-methyl-D-erythritol 4-phosphate cytidylyltransferase  32.58 
 
 		 238 aa  41.6  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.898769 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02261  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein MobA  25.12 
 
 		 195 aa  42  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1132  acylneuraminate cytidylyltransferase  27.94 
 
 		 229 aa  41.2  0.01  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>