15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2842 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2842  hypothetical protein  100 
 
 		 675 aa  1382    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00272449  normal  0.0507641 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1844  membrane protein-like protein  25.56 
 
 		 598 aa  141  4.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.478995  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0361  hypothetical protein  28.66 
 
 		 607 aa  97.4  7e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0721  membrane protein-like protein  23.96 
 
 		 573 aa  86.7  0.000000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1023  membrane protein-like protein  21.63 
 
 		 660 aa  70.9  0.00000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27530  predicted membrane protein  21.17 
 
 		 669 aa  64.3  0.000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00352231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0093  membrane protein-like protein  23.23 
 
 		 667 aa  57  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0735  hypothetical protein  20.35 
 
 		 598 aa  52.8  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0169011 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2446  hypothetical protein  34.29 
 
 		 613 aa  50.8  0.00009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.767851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0789  hypothetical protein  26.03 
 
 		 616 aa  48.5  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.685976  normal  0.296699 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2259  membrane protein  26.36 
 
 		 632 aa  46.6  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.158397  hitchhiker  0.00085756 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12710  predicted membrane protein  28.33 
 
 		 662 aa  45.8  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.942677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0605  hypothetical protein  28.77 
 
 		 606 aa  45.8  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.307495 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2464  hypothetical protein  34.92 
 
 		 608 aa  45.8  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0119  hypothetical protein  29.51 
 
 		 567 aa  44.3  0.008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00804511  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>