15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1748 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_1748  hypothetical protein  100 
 
 
219 aa  443  1.0000000000000001e-124  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.690123  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1808  hypothetical protein  29.73 
 
 
192 aa  89.7  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1606  type IV pilus assembly PilZ  35.36 
 
 
188 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.321815  normal  0.0962013 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3860  hypothetical protein  34.25 
 
 
193 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1694  type IV pilus assembly PilZ  32.57 
 
 
194 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.132383 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25420  hypothetical protein  33.7 
 
 
254 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2108  hypothetical protein  31.69 
 
 
195 aa  79  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1903  hypothetical protein  35.26 
 
 
195 aa  78.2  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.378219  hitchhiker  0.00133315 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2172  hypothetical protein  33.7 
 
 
199 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.849179  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1670  type IV pilus assembly PilZ  32.2 
 
 
194 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3589  type IV pilus assembly PilZ  31.03 
 
 
194 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.549929 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2153  type IV pilus assembly PilZ  31.03 
 
 
194 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00727048 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1901  hypothetical protein  23.04 
 
 
185 aa  46.2  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1947  type IV pilus assembly PilZ  29.69 
 
 
197 aa  45.4  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.803448  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1890  hypothetical protein  22.51 
 
 
185 aa  44.7  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>