23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2656 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2656  hypothetical protein  100 
 
 		 196 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3213  hypothetical protein  60.1 
 
 		 173 aa  216  2e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.052023 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3212  hypothetical protein  59.38 
 
 		 193 aa  212  2.9999999999999995e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0850  hypothetical protein  55.96 
 
 		 164 aa  202  3e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.272158  normal  0.0878547 
 
 
-
 
NC_003296  RS03903  hypothetical protein  51.88 
 
 		 115 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1252  hypothetical protein  31.8 
 
 		 225 aa  102  3e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0979226  normal  0.219751 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2751  hypothetical protein  32.59 
 
 		 225 aa  100  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0312385 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2053  hypothetical protein  31.84 
 
 		 224 aa  99  4e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113901  normal  0.0119007 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2581  hypothetical protein  32.33 
 
 		 233 aa  98.2  7e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.178484 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1320  hypothetical protein  31.47 
 
 		 233 aa  96.7  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825886 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2902  hypothetical protein  29.63 
 
 		 225 aa  95.9  4e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0615892  normal  0.938531 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2823  hypothetical protein  31.6 
 
 		 232 aa  95.1  5e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03902  hypothetical protein  80 
 
 		 56 aa  89  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3126  hypothetical protein  58.49 
 
 		 105 aa  74.3  0.0000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.095308  decreased coverage  0.00800037 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2070  hypothetical protein  52.94 
 
 		 127 aa  73.9  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.981444 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2943  hypothetical protein  52.31 
 
 		 136 aa  72.8  0.000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2334  hypothetical protein  41.76 
 
 		 108 aa  71.6  0.000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.777792 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1147  hypothetical protein  52.24 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1451  hypothetical protein  42.86 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0798  hypothetical protein  51.39 
 
 		 117 aa  61.2  0.000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.249703  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0838  hypothetical protein  41.05 
 
 		 117 aa  60.8  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.011638  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2529  hypothetical protein  42.11 
 
 		 70 aa  58.9  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1524  hypothetical protein  29.84 
 
 		 173 aa  53.1  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.545795 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>