21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2415 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_2415  curlin-associated protein  100 
 
 		 190 aa  361  3e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.120235 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0032  hypothetical protein  35.68 
 
 		 214 aa  84.7  8e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0801235 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0865  hypothetical protein  30.47 
 
 		 502 aa  54.3  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0721  curlin-associated protein  30.47 
 
 		 502 aa  52  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000376706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2947  hypothetical protein  28.64 
 
 		 500 aa  52  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.424974  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0646  curlin-associated protein  24.86 
 
 		 143 aa  51.2  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000139477 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3499  curlin-associated protein  30.18 
 
 		 496 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.95975  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3413  curlin-associated protein  28.91 
 
 		 502 aa  47.8  0.00009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.602514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3136  curlin-associated protein  31.25 
 
 		 496 aa  47.8  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1558  cryptic curlin major subunit  37.5 
 
 		 149 aa  47  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0820633  normal  0.586693 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2946  minor curlin subunit CsgB, putative  30.77 
 
 		 144 aa  45.1  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.121135 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2365  curlin-associated protein  33.04 
 
 		 157 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0645  curlin-associated protein  32.71 
 
 		 503 aa  43.5  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.572248  unclonable  0.0000000277194 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3235  curlin-associated protein  31.93 
 
 		 627 aa  43.1  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2954  curlin-associated protein  30.36 
 
 		 156 aa  42.4  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.218501  normal  0.263199 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01503  putative secreted major subunit of curlin, may bind calcium  37.23 
 
 		 483 aa  42.4  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0865  Curlin associated repeat protein  32.71 
 
 		 139 aa  42.4  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3095  curlin associated  26.19 
 
 		 498 aa  41.6  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.33683  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2551  curlin-associated protein  29.84 
 
 		 157 aa  41.6  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0240208 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3398  curlin associated repeat protein  31.86 
 
 		 157 aa  41.2  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170694  normal  0.798817 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3135  curlin-associated protein  32.71 
 
 		 139 aa  41.2  0.01  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>