111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2307 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2307  transposition helper protein  100 
 
 		 145 aa  283  7e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3000  transposition helper protein  99.31 
 
 		 157 aa  281  1.0000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0695  transposition helper protein  71.72 
 
 		 157 aa  202  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0719  transposition helper protein  71.72 
 
 		 157 aa  202  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1074  transposition helper protein  71.72 
 
 		 157 aa  202  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1104  transposition helper protein  71.72 
 
 		 157 aa  202  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.185893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1518  transposition helper protein  71.72 
 
 		 157 aa  202  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0440245  normal  0.353489 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1906  transposition helper protein  71.72 
 
 		 157 aa  202  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.126399  hitchhiker  0.00245638 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2136  transposition helper protein  71.72 
 
 		 157 aa  202  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.737465 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2426  transposition helper protein  71.72 
 
 		 157 aa  202  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2774  transposition helper protein  71.72 
 
 		 157 aa  202  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.499987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2874  transposition helper protein  71.72 
 
 		 157 aa  202  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3342  transposition helper protein  71.72 
 
 		 157 aa  202  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3661  transposition helper protein  71.72 
 
 		 157 aa  202  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.690061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3764  transposition helper protein  71.72 
 
 		 157 aa  202  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.988067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3793  transposition helper protein  71.72 
 
 		 157 aa  202  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4358  transposition helper protein  71.72 
 
 		 157 aa  202  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0370  transposase IS3/IS911 family protein  67.59 
 
 		 157 aa  202  1e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.312687 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3797  transposition helper protein  74.4 
 
 		 125 aa  181  4.0000000000000006e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.754875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4152  transposition helper protein  72.04 
 
 		 94 aa  135  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3103  transposase IS3/IS911 family protein  52.25 
 
 		 116 aa  105  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00033  transposition helper protein  71.83 
 
 		 84 aa  104  4e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.216389  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4452  transposase IS3/IS911 family protein  40.52 
 
 		 165 aa  103  8e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000855993  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1534  transposase IS3/IS911 family protein  45.26 
 
 		 162 aa  99.4  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.200633  normal  0.785426 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0730  hypothetical protein  44.3 
 
 		 166 aa  94  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1540  transposase IS3/IS911 family protein  35.44 
 
 		 174 aa  89  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3820  transposase IS3/IS911 family protein  35.44 
 
 		 174 aa  89  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00160807  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2064  hypothetical protein  34.21 
 
 		 148 aa  88.6  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000338924  decreased coverage  0.0000208115 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0375  putative transposase  37.24 
 
 		 160 aa  88.2  3e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000100064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2535  putative transposase  37.24 
 
 		 160 aa  87.4  5e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000152425  normal  0.735712 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01717  hypothetical protein  36.96 
 
 		 145 aa  87.4  6e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02044  hypothetical protein  36.96 
 
 		 145 aa  87.4  6e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02797  hypothetical protein  36.96 
 
 		 145 aa  87.4  6e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02881  hypothetical protein  36.96 
 
 		 145 aa  87.4  6e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04733  hypothetical protein  36.96 
 
 		 145 aa  87.4  6e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04944  hypothetical protein  36.96 
 
 		 145 aa  87.4  6e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05295  hypothetical protein  36.96 
 
 		 145 aa  87.4  6e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05475  hypothetical protein  36.96 
 
 		 145 aa  87.4  6e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05743  hypothetical protein  36.96 
 
 		 145 aa  87.4  6e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05754  hypothetical protein  36.96 
 
 		 145 aa  87.4  6e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06030  hypothetical protein  36.96 
 
 		 145 aa  87.4  6e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06490  hypothetical protein  36.96 
 
 		 145 aa  87.4  6e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06979  hypothetical protein  36.96 
 
 		 145 aa  87.4  6e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07081  hypothetical protein  36.96 
 
 		 145 aa  87.4  6e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01832  transposase IS3/IS911 family protein  44.37 
 
 		 163 aa  84.3  6e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01834  transposase IS3/IS911 family protein  44.37 
 
 		 163 aa  84.3  6e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02258  transposase IS3/IS911 family protein  44.37 
 
 		 163 aa  84.3  6e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02619  transposase IS3/IS911 family protein  44.37 
 
 		 163 aa  84.3  6e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2023  transposase IS3/IS911 family protein  38.96 
 
 		 166 aa  82.8  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2393  ISAfe5, transposase orfA  39.74 
 
 		 151 aa  81.3  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1428  hypothetical protein  42.67 
 
 		 163 aa  81.6  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3828  hypothetical protein  42.67 
 
 		 163 aa  81.6  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.73032 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4010  hypothetical protein  40.97 
 
 		 193 aa  77.4  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1035  transposase IS3/IS911 family protein  41.22 
 
 		 163 aa  77.8  0.00000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3129  transposase IS3/IS911 family protein  41.22 
 
 		 163 aa  77.8  0.00000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4150  transposase IS3/IS911 family protein  41.22 
 
 		 163 aa  77.8  0.00000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4442  transposase IS3/IS911 family protein  36.84 
 
 		 166 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.380307  normal  0.586119 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0253  transposase IS3/IS911 family protein  36.84 
 
 		 166 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0454  transposase IS3/IS911 family protein  36.84 
 
 		 166 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1096  transposase IS3/IS911 family protein  36.84 
 
 		 166 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1142  transposase IS3/IS911 family protein  36.84 
 
 		 166 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.646634  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1258  transposase IS3/IS911 family protein  36.84 
 
 		 166 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1264  transposase IS3/IS911 family protein  36.84 
 
 		 166 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1931  transposase IS3/IS911 family protein  36.84 
 
 		 166 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2048  transposase IS3/IS911 family protein  36.84 
 
 		 166 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2090  transposase IS3/IS911 family protein  36.84 
 
 		 166 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2333  transposase IS3/IS911 family protein  36.84 
 
 		 166 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2585  transposase IS3/IS911 family protein  36.84 
 
 		 166 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.664533  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2625  transposase IS3/IS911 family protein  36.84 
 
 		 166 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3062  transposase IS3/IS911 family protein  36.84 
 
 		 166 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3544  transposase IS3/IS911 family protein  36.84 
 
 		 166 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3682  transposase IS3/IS911 family protein  36.84 
 
 		 166 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4310  transposase IS3/IS911 family protein  36.84 
 
 		 166 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4319  transposase IS3/IS911 family protein  36.84 
 
 		 166 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3125  transposase IS3/IS911 family protein  36.36 
 
 		 165 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000279784  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1476  hypothetical protein  36.6 
 
 		 166 aa  74.7  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2067  hypothetical protein  36.6 
 
 		 166 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2169  hypothetical protein  36.6 
 
 		 166 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2336  hypothetical protein  40.25 
 
 		 163 aa  73.2  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3412  transposase IS3/IS911 family protein  34.87 
 
 		 160 aa  72  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2567  transposase IS3/IS911 family protein  34.87 
 
 		 160 aa  72  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3415  transposase IS3/IS911 family protein  35.37 
 
 		 160 aa  72  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2330  hypothetical protein  39.62 
 
 		 163 aa  71.6  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.508693 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0129  hypothetical protein  34.67 
 
 		 166 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0729  hypothetical protein  34.67 
 
 		 166 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0817  hypothetical protein  34.67 
 
 		 166 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1253  hypothetical protein  34.67 
 
 		 166 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1941  hypothetical protein  34.67 
 
 		 166 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3142  hypothetical protein  34.67 
 
 		 166 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.457423  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4351  hypothetical protein  34.67 
 
 		 166 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3393  transposase IS3/IS911 family protein  34.69 
 
 		 167 aa  70.5  0.000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0301  transposase IS3/IS911 family protein  28.91 
 
 		 147 aa  67.4  0.00000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.601541  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2333  hypothetical protein  35.79 
 
 		 111 aa  61.2  0.000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2501  hypothetical protein  35.8 
 
 		 171 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2149  putative transposase  32.89 
 
 		 161 aa  53.9  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.150452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0646  transposase IS3/IS911 family protein  31.61 
 
 		 161 aa  52.8  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000318322  normal  0.432227 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1099  transposase IS3/IS911 family protein  31.61 
 
 		 161 aa  52.8  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00548564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0317  hypothetical protein  37.12 
 
 		 177 aa  51.2  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1239  hypothetical protein  37.12 
 
 		 177 aa  51.2  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2203  hypothetical protein  37.12 
 
 		 177 aa  51.2  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0499137  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>