99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4152 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_4152  transposition helper protein  100 
 
 		 94 aa  187  5.999999999999999e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3000  transposition helper protein  72.04 
 
 		 157 aa  135  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2307  transposition helper protein  72.04 
 
 		 145 aa  135  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2136  transposition helper protein  72.04 
 
 		 157 aa  130  6e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.737465 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4358  transposition helper protein  72.04 
 
 		 157 aa  130  6e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3797  transposition helper protein  72.04 
 
 		 125 aa  130  6e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.754875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3793  transposition helper protein  72.04 
 
 		 157 aa  130  6e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3764  transposition helper protein  72.04 
 
 		 157 aa  130  6e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.988067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3661  transposition helper protein  72.04 
 
 		 157 aa  130  6e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.690061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3342  transposition helper protein  72.04 
 
 		 157 aa  130  6e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2874  transposition helper protein  72.04 
 
 		 157 aa  130  6e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2774  transposition helper protein  72.04 
 
 		 157 aa  130  6e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.499987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2426  transposition helper protein  72.04 
 
 		 157 aa  130  6e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1906  transposition helper protein  72.04 
 
 		 157 aa  130  6e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.126399  hitchhiker  0.00245638 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1518  transposition helper protein  72.04 
 
 		 157 aa  130  6e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0440245  normal  0.353489 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1104  transposition helper protein  72.04 
 
 		 157 aa  130  6e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.185893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1074  transposition helper protein  72.04 
 
 		 157 aa  130  6e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0719  transposition helper protein  72.04 
 
 		 157 aa  130  6e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0695  transposition helper protein  72.04 
 
 		 157 aa  130  6e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0370  transposase IS3/IS911 family protein  64.52 
 
 		 157 aa  123  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.312687 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1534  transposase IS3/IS911 family protein  50.63 
 
 		 162 aa  75.1  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.200633  normal  0.785426 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06030  hypothetical protein  43.33 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05754  hypothetical protein  43.33 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02797  hypothetical protein  43.33 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05743  hypothetical protein  43.33 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05475  hypothetical protein  43.33 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05295  hypothetical protein  43.33 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04944  hypothetical protein  43.33 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04733  hypothetical protein  43.33 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02881  hypothetical protein  43.33 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06490  hypothetical protein  43.33 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06979  hypothetical protein  43.33 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07081  hypothetical protein  43.33 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02044  hypothetical protein  43.33 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01717  hypothetical protein  43.33 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01832  transposase IS3/IS911 family protein  51.06 
 
 		 163 aa  70.9  0.000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01834  transposase IS3/IS911 family protein  51.06 
 
 		 163 aa  70.9  0.000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02258  transposase IS3/IS911 family protein  51.06 
 
 		 163 aa  70.9  0.000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02619  transposase IS3/IS911 family protein  51.06 
 
 		 163 aa  70.9  0.000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0375  putative transposase  41.49 
 
 		 160 aa  68.2  0.00000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000100064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0730  hypothetical protein  48.94 
 
 		 166 aa  67.8  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4452  transposase IS3/IS911 family protein  42.11 
 
 		 165 aa  67.4  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000855993  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3820  transposase IS3/IS911 family protein  38.04 
 
 		 174 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00160807  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1540  transposase IS3/IS911 family protein  38.04 
 
 		 174 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2535  putative transposase  41.49 
 
 		 160 aa  67  0.00000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000152425  normal  0.735712 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2064  hypothetical protein  37.23 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000338924  decreased coverage  0.0000208115 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2393  ISAfe5, transposase orfA  46.74 
 
 		 151 aa  61.2  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2023  transposase IS3/IS911 family protein  46.74 
 
 		 166 aa  60.8  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1428  hypothetical protein  48.84 
 
 		 163 aa  58.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3828  hypothetical protein  48.84 
 
 		 163 aa  58.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.73032 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1941  hypothetical protein  42 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1253  hypothetical protein  42 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0817  hypothetical protein  42 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0729  hypothetical protein  42 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3142  hypothetical protein  42 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.457423  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0129  hypothetical protein  42 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4010  hypothetical protein  48.81 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4351  hypothetical protein  42 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4150  transposase IS3/IS911 family protein  42.55 
 
 		 163 aa  53.1  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3129  transposase IS3/IS911 family protein  42.55 
 
 		 163 aa  53.1  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1035  transposase IS3/IS911 family protein  42.55 
 
 		 163 aa  53.1  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3103  transposase IS3/IS911 family protein  42.11 
 
 		 116 aa  52  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2336  hypothetical protein  44.68 
 
 		 163 aa  50.8  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0253  transposase IS3/IS911 family protein  39.36 
 
 		 166 aa  50.4  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0454  transposase IS3/IS911 family protein  39.36 
 
 		 166 aa  50.4  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4442  transposase IS3/IS911 family protein  39.36 
 
 		 166 aa  50.4  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.380307  normal  0.586119 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1096  transposase IS3/IS911 family protein  39.36 
 
 		 166 aa  50.4  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1142  transposase IS3/IS911 family protein  39.36 
 
 		 166 aa  50.4  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.646634  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1258  transposase IS3/IS911 family protein  39.36 
 
 		 166 aa  50.4  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1264  transposase IS3/IS911 family protein  39.36 
 
 		 166 aa  50.4  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4319  transposase IS3/IS911 family protein  39.36 
 
 		 166 aa  50.4  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2048  transposase IS3/IS911 family protein  39.36 
 
 		 166 aa  50.4  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2090  transposase IS3/IS911 family protein  39.36 
 
 		 166 aa  50.4  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2333  transposase IS3/IS911 family protein  39.36 
 
 		 166 aa  50.4  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2585  transposase IS3/IS911 family protein  39.36 
 
 		 166 aa  50.4  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.664533  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2625  transposase IS3/IS911 family protein  39.36 
 
 		 166 aa  50.4  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3062  transposase IS3/IS911 family protein  39.36 
 
 		 166 aa  50.4  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1931  transposase IS3/IS911 family protein  39.36 
 
 		 166 aa  50.4  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4310  transposase IS3/IS911 family protein  39.36 
 
 		 166 aa  50.4  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3682  transposase IS3/IS911 family protein  39.36 
 
 		 166 aa  50.4  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3544  transposase IS3/IS911 family protein  39.36 
 
 		 166 aa  50.4  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2330  hypothetical protein  43.62 
 
 		 163 aa  48.9  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.508693 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1476  hypothetical protein  38.3 
 
 		 166 aa  47.8  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2067  hypothetical protein  38.3 
 
 		 166 aa  47.8  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2169  hypothetical protein  38.3 
 
 		 166 aa  47.8  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3415  transposase IS3/IS911 family protein  37.23 
 
 		 160 aa  47  0.00009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3393  transposase IS3/IS911 family protein  36.17 
 
 		 167 aa  46.6  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1239  hypothetical protein  39.51 
 
 		 177 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0317  hypothetical protein  39.51 
 
 		 177 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2203  hypothetical protein  39.51 
 
 		 177 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0499137  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3026  hypothetical protein  39.51 
 
 		 177 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3317  hypothetical protein  39.51 
 
 		 177 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3927  hypothetical protein  39.51 
 
 		 177 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4344  hypothetical protein  39.51 
 
 		 177 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4366  hypothetical protein  39.51 
 
 		 177 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2567  transposase IS3/IS911 family protein  37.23 
 
 		 160 aa  42  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3412  transposase IS3/IS911 family protein  37.23 
 
 		 160 aa  42  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3125  transposase IS3/IS911 family protein  38.3 
 
 		 165 aa  40.8  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000279784  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0786  hypothetical protein  30 
 
 		 127 aa  40.4  0.009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.795214  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>