40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00033 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_00033  transposition helper protein  100 
 
 		 84 aa  162  2.0000000000000002e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.216389  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2307  transposition helper protein  71.83 
 
 		 145 aa  104  4e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3000  transposition helper protein  70.42 
 
 		 157 aa  102  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2774  transposition helper protein  66.2 
 
 		 157 aa  96.7  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.499987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4358  transposition helper protein  66.2 
 
 		 157 aa  96.7  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3793  transposition helper protein  66.2 
 
 		 157 aa  96.7  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3764  transposition helper protein  66.2 
 
 		 157 aa  96.7  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.988067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3661  transposition helper protein  66.2 
 
 		 157 aa  96.7  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.690061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3342  transposition helper protein  66.2 
 
 		 157 aa  96.7  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2874  transposition helper protein  66.2 
 
 		 157 aa  96.7  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2426  transposition helper protein  66.2 
 
 		 157 aa  96.7  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2136  transposition helper protein  66.2 
 
 		 157 aa  96.7  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.737465 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1906  transposition helper protein  66.2 
 
 		 157 aa  96.7  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.126399  hitchhiker  0.00245638 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1518  transposition helper protein  66.2 
 
 		 157 aa  96.7  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0440245  normal  0.353489 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1104  transposition helper protein  66.2 
 
 		 157 aa  96.7  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.185893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1074  transposition helper protein  66.2 
 
 		 157 aa  96.7  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0719  transposition helper protein  66.2 
 
 		 157 aa  96.7  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0695  transposition helper protein  66.2 
 
 		 157 aa  96.7  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0370  transposase IS3/IS911 family protein  56.16 
 
 		 157 aa  89  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.312687 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3103  transposase IS3/IS911 family protein  52.11 
 
 		 116 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3797  transposition helper protein  68.63 
 
 		 125 aa  72.4  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.754875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4452  transposase IS3/IS911 family protein  40.51 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000855993  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3125  transposase IS3/IS911 family protein  34.48 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000279784  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0301  transposase IS3/IS911 family protein  34.48 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.601541  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2064  hypothetical protein  35.9 
 
 		 148 aa  49.7  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000338924  decreased coverage  0.0000208115 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3415  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 		 160 aa  48.9  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3393  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 		 167 aa  48.5  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3412  transposase IS3/IS911 family protein  34.62 
 
 		 160 aa  48.1  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2023  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 		 166 aa  47.8  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2567  transposase IS3/IS911 family protein  34.62 
 
 		 160 aa  48.1  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2393  ISAfe5, transposase orfA  34.67 
 
 		 151 aa  46.2  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4149  transposition helper protein  51.35 
 
 		 54 aa  44.7  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3828  hypothetical protein  32.05 
 
 		 163 aa  43.9  0.0009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.73032 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1428  hypothetical protein  32.05 
 
 		 163 aa  43.9  0.0009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0730  hypothetical protein  32.05 
 
 		 166 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4010  hypothetical protein  33.33 
 
 		 193 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1699  transposase IS3/IS911 family protein  28.21 
 
 		 161 aa  40.8  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000000451085  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0650  transposase IS3/IS911 family protein  28.21 
 
 		 161 aa  40.8  0.007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.124888  normal  0.267148 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1099  transposase IS3/IS911 family protein  26.92 
 
 		 161 aa  40.4  0.008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00548564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0646  transposase IS3/IS911 family protein  26.92 
 
 		 161 aa  40.4  0.008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000318322  normal  0.432227 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>