111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2023 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_2023  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
166 aa  330  5e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2393  ISAfe5, transposase orfA  100 
 
 
151 aa  301  4.0000000000000003e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1534  transposase IS3/IS911 family protein  53.95 
 
 
162 aa  168  3e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.200633  normal  0.785426 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4442  transposase IS3/IS911 family protein  58.18 
 
 
166 aa  167  4e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.380307  normal  0.586119 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0253  transposase IS3/IS911 family protein  58.18 
 
 
166 aa  167  4e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0454  transposase IS3/IS911 family protein  58.18 
 
 
166 aa  167  4e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1096  transposase IS3/IS911 family protein  58.18 
 
 
166 aa  167  4e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1142  transposase IS3/IS911 family protein  58.18 
 
 
166 aa  167  4e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.646634  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1258  transposase IS3/IS911 family protein  58.18 
 
 
166 aa  167  4e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1264  transposase IS3/IS911 family protein  58.18 
 
 
166 aa  167  4e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1931  transposase IS3/IS911 family protein  58.18 
 
 
166 aa  167  4e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2048  transposase IS3/IS911 family protein  58.18 
 
 
166 aa  167  4e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2090  transposase IS3/IS911 family protein  58.18 
 
 
166 aa  167  4e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2333  transposase IS3/IS911 family protein  58.18 
 
 
166 aa  167  4e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2585  transposase IS3/IS911 family protein  58.18 
 
 
166 aa  167  4e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.664533  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2625  transposase IS3/IS911 family protein  58.18 
 
 
166 aa  167  4e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3062  transposase IS3/IS911 family protein  58.18 
 
 
166 aa  167  4e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3544  transposase IS3/IS911 family protein  58.18 
 
 
166 aa  167  4e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3682  transposase IS3/IS911 family protein  58.18 
 
 
166 aa  167  4e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4310  transposase IS3/IS911 family protein  58.18 
 
 
166 aa  167  4e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4319  transposase IS3/IS911 family protein  58.18 
 
 
166 aa  167  4e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01717  hypothetical protein  52.41 
 
 
145 aa  157  6e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02044  hypothetical protein  52.41 
 
 
145 aa  157  6e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02797  hypothetical protein  52.41 
 
 
145 aa  157  6e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02881  hypothetical protein  52.41 
 
 
145 aa  157  6e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04733  hypothetical protein  52.41 
 
 
145 aa  157  6e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04944  hypothetical protein  52.41 
 
 
145 aa  157  6e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05295  hypothetical protein  52.41 
 
 
145 aa  157  6e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05475  hypothetical protein  52.41 
 
 
145 aa  157  6e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05743  hypothetical protein  52.41 
 
 
145 aa  157  6e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05754  hypothetical protein  52.41 
 
 
145 aa  157  6e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06030  hypothetical protein  52.41 
 
 
145 aa  157  6e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06490  hypothetical protein  52.41 
 
 
145 aa  157  6e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06979  hypothetical protein  52.41 
 
 
145 aa  157  6e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07081  hypothetical protein  52.41 
 
 
145 aa  157  6e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2067  hypothetical protein  54.55 
 
 
166 aa  155  2e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2169  hypothetical protein  54.55 
 
 
166 aa  155  2e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01832  transposase IS3/IS911 family protein  51.23 
 
 
163 aa  154  5.0000000000000005e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01834  transposase IS3/IS911 family protein  51.23 
 
 
163 aa  154  5.0000000000000005e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02258  transposase IS3/IS911 family protein  51.23 
 
 
163 aa  154  5.0000000000000005e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02619  transposase IS3/IS911 family protein  51.23 
 
 
163 aa  154  5.0000000000000005e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1476  hypothetical protein  53.94 
 
 
166 aa  152  2e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4452  transposase IS3/IS911 family protein  46.58 
 
 
165 aa  149  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000855993  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0730  hypothetical protein  50.92 
 
 
166 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2330  hypothetical protein  51.57 
 
 
163 aa  139  1.9999999999999998e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.508693 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2336  hypothetical protein  50.94 
 
 
163 aa  139  1.9999999999999998e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0129  hypothetical protein  55 
 
 
166 aa  136  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0729  hypothetical protein  55 
 
 
166 aa  136  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0817  hypothetical protein  55 
 
 
166 aa  136  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1253  hypothetical protein  55 
 
 
166 aa  136  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1941  hypothetical protein  55 
 
 
166 aa  136  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3142  hypothetical protein  55 
 
 
166 aa  136  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.457423  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4351  hypothetical protein  55 
 
 
166 aa  136  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2064  hypothetical protein  46.1 
 
 
148 aa  136  1e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000338924  decreased coverage  0.0000208115 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4010  hypothetical protein  49.39 
 
 
193 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1540  transposase IS3/IS911 family protein  43.2 
 
 
174 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3820  transposase IS3/IS911 family protein  43.2 
 
 
174 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00160807  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1428  hypothetical protein  50.66 
 
 
163 aa  134  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3828  hypothetical protein  50.66 
 
 
163 aa  134  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.73032 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3415  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 
160 aa  134  5e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3393  transposase IS3/IS911 family protein  49.38 
 
 
167 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2567  transposase IS3/IS911 family protein  47.59 
 
 
160 aa  130  7.999999999999999e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3412  transposase IS3/IS911 family protein  47.59 
 
 
160 aa  130  7.999999999999999e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3125  transposase IS3/IS911 family protein  43.03 
 
 
165 aa  124  7e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000279784  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0370  transposase IS3/IS911 family protein  39.76 
 
 
157 aa  118  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.312687 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1035  transposase IS3/IS911 family protein  45.68 
 
 
163 aa  111  5e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3129  transposase IS3/IS911 family protein  45.68 
 
 
163 aa  111  5e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2333  hypothetical protein  53.4 
 
 
111 aa  110  6e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4150  transposase IS3/IS911 family protein  45.06 
 
 
163 aa  110  9e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0695  transposition helper protein  40.61 
 
 
157 aa  108  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0719  transposition helper protein  40.61 
 
 
157 aa  108  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1074  transposition helper protein  40.61 
 
 
157 aa  108  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1104  transposition helper protein  40.61 
 
 
157 aa  108  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.185893  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1518  transposition helper protein  40.61 
 
 
157 aa  108  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0440245  normal  0.353489 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1906  transposition helper protein  40.61 
 
 
157 aa  108  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.126399  hitchhiker  0.00245638 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2136  transposition helper protein  40.61 
 
 
157 aa  108  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.737465 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2426  transposition helper protein  40.61 
 
 
157 aa  108  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2774  transposition helper protein  40.61 
 
 
157 aa  108  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.499987  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2874  transposition helper protein  40.61 
 
 
157 aa  108  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3342  transposition helper protein  40.61 
 
 
157 aa  108  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3661  transposition helper protein  40.61 
 
 
157 aa  108  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.690061  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3764  transposition helper protein  40.61 
 
 
157 aa  108  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.988067  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3793  transposition helper protein  40.61 
 
 
157 aa  108  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4358  transposition helper protein  40.61 
 
 
157 aa  108  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3000  transposition helper protein  37.95 
 
 
157 aa  108  4.0000000000000004e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2307  transposition helper protein  38.96 
 
 
145 aa  105  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0301  transposase IS3/IS911 family protein  37.86 
 
 
147 aa  105  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.601541  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0375  putative transposase  37.27 
 
 
160 aa  95.1  4e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000100064  normal 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2535  putative transposase  37.5 
 
 
160 aa  94.4  6e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000152425  normal  0.735712 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3797  transposition helper protein  42.11 
 
 
125 aa  89.7  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.754875  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4152  transposition helper protein  50.54 
 
 
94 aa  85.5  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2501  hypothetical protein  35.47 
 
 
171 aa  83.2  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0646  transposase IS3/IS911 family protein  37.97 
 
 
161 aa  75.1  0.0000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000318322  normal  0.432227 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1099  transposase IS3/IS911 family protein  37.97 
 
 
161 aa  75.1  0.0000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00548564  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2336  transposase IS3/IS911 family protein  34.18 
 
 
161 aa  73.2  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2149  putative transposase  36.71 
 
 
161 aa  71.6  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.150452  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0317  hypothetical protein  32.37 
 
 
177 aa  68.2  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1239  hypothetical protein  32.37 
 
 
177 aa  68.2  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3317  hypothetical protein  32.37 
 
 
177 aa  68.2  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3927  hypothetical protein  32.37 
 
 
177 aa  68.2  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>