16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1287 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1287  hypothetical protein  100 
 
 		 141 aa  272  1.0000000000000001e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000342569 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2525  hypothetical protein  41.94 
 
 		 129 aa  93.2  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.197599  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0270  hypothetical protein  38.71 
 
 		 125 aa  87.8  4e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  3.57996e-16  n/a   
 
 
 
NC_011901  Tgr7_0296  hypothetical protein  38.74 
 
 		 132 aa  81.3  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0908189  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03119  hypothetical protein  41.82 
 
 		 126 aa  79.3  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0531  hypothetical protein  41.9 
 
 		 141 aa  71.2  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.499812  normal  0.721524 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1973  hypothetical protein  36.54 
 
 		 135 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.182667  normal  0.0517042 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1827  hypothetical protein  43.16 
 
 		 119 aa  65.1  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1111  hypothetical protein  40.46 
 
 		 131 aa  62.4  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.247105  normal  0.803312 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28140  hypothetical protein  36.89 
 
 		 132 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00031566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2156  hypothetical protein  28.8 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.862902  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2453  hypothetical protein  35.92 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0386558  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0295  hypothetical protein  31.78 
 
 		 130 aa  53.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0254657  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4195  hypothetical protein  36.47 
 
 		 150 aa  47.8  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1042  hypothetical protein  33.33 
 
 		 126 aa  47  0.00008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0088  hypothetical protein  35.58 
 
 		 139 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>