76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0003 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0003  S4-like RNA binding protein  100 
 
 		 49 aa  101  4e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  4.31544e-26 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0003  S4-like RNA binding protein  59.09 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0003  RNA-binding S4  44.44 
 
 		 64 aa  50.4  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000218407  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5317  hypothetical protein  48.78 
 
 		 70 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0232645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0003  hypothetical protein  48.78 
 
 		 70 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000654454  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0003  hypothetical protein  46.34 
 
 		 74 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.239482  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0003  hypothetical protein  46.34 
 
 		 74 aa  48.9  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0003  hypothetical protein  46.34 
 
 		 74 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0003  hypothetical protein  46.34 
 
 		 70 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000693166  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0003  hypothetical protein  46.34 
 
 		 70 aa  48.5  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0881433  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0003  hypothetical protein  46.34 
 
 		 70 aa  48.9  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0002  RNA-binding S4 domain protein  44.68 
 
 		 70 aa  48.5  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000678168  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0003  S4 region YaaA family protein  46.34 
 
 		 70 aa  48.5  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0003  hypothetical protein  46.34 
 
 		 70 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.28946 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0003  hypothetical protein  46.34 
 
 		 70 aa  48.9  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.674518  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2642  RNA-binding S4 domain-containing protein  42.86 
 
 		 76 aa  48.1  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0497559  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0003  S4-like RNA binding protein  50 
 
 		 73 aa  48.1  0.00004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2155  hypothetical protein  42.55 
 
 		 117 aa  47.8  0.00005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.323809  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1672  RNA-binding S4 domain-containing protein  41.67 
 
 		 76 aa  47.4  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0473065  normal  0.414698 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1650  RNA-binding S4 domain-containing protein  41.67 
 
 		 76 aa  47.4  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.944903  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1635  RNA-binding S4 domain-containing protein  41.67 
 
 		 76 aa  47.4  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0673485  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2708  RNA-binding S4 domain protein  41.67 
 
 		 76 aa  47.4  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.368118  hitchhiker  0.000000707392 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0003  S4 domain protein YaaA  42.86 
 
 		 76 aa  47.4  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0313437  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0003  S4 domain protein YaaA  48.72 
 
 		 76 aa  47.4  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1835  hypothetical protein  41.67 
 
 		 50 aa  47  0.00008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0003  S4-like RNA binding protein  41.86 
 
 		 73 aa  47  0.00009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000208957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0003  RNA-binding S4 domain-containing protein  43.18 
 
 		 68 aa  46.6  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0003  S4 domain protein YaaA  45 
 
 		 73 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000126771  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0464  S4 domain-containing protein  45.45 
 
 		 71 aa  46.6  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0103248  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0003  S4 region, YaaA  44.19 
 
 		 73 aa  46.6  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3643  RNA-binding S4 domain-containing protein  48.78 
 
 		 80 aa  47  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.252029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0173  S4 domain protein YaaA  40.82 
 
 		 72 aa  45.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.563705  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1990  hypothetical protein  50 
 
 		 125 aa  46.2  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf004  hypothetical protein  35.42 
 
 		 76 aa  45.1  0.0003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3116  RNA-binding S4 domain-containing protein  45.24 
 
 		 72 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.147068  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2551  hypothetical protein  47.5 
 
 		 78 aa  45.1  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.28368  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3096  RNA-binding S4  45.24 
 
 		 72 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3156  RNA-binding S4 domain-containing protein  45.24 
 
 		 72 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.914223  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3069  RNA-binding S4 domain-containing protein  41.67 
 
 		 77 aa  44.7  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000897832  hitchhiker  0.000868663 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0342  RNA-binding S4 domain-containing protein  46.51 
 
 		 65 aa  44.7  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000486446  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2237  hypothetical protein  56.41 
 
 		 120 aa  44.3  0.0005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1437  RNA-binding S4 domain-containing protein  40.48 
 
 		 62 aa  44.3  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.614466  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0098  RNA-binding S4  42.86 
 
 		 65 aa  44.3  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000456096  normal  0.262898 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0972  RNA-binding S4  43.48 
 
 		 58 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2454  RNA-binding S4 domain-containing protein  39.58 
 
 		 76 aa  43.9  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000184888 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2524  RNA-binding S4 domain-containing protein  39.58 
 
 		 76 aa  43.9  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0627424  unclonable  0.0000273439 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2616  RNA-binding S4 domain-containing protein  39.58 
 
 		 76 aa  43.9  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000166621 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10421  S4 domain-containing protein  46.67 
 
 		 58 aa  43.9  0.0007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.507688  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2468  RNA-binding S4 domain-containing protein  42.86 
 
 		 76 aa  43.9  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000314319 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4907  RNA-binding S4  42.86 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.93545  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0831  hypothetical protein  47.62 
 
 		 91 aa  43.1  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.366919  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1365  RNA-binding S4 domain protein  35.42 
 
 		 77 aa  43.5  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000548467 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1527  RNA-binding S4 domain-containing protein  37.5 
 
 		 79 aa  42.7  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2373  RNA-binding S4  36.96 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09031  hypothetical protein  43.48 
 
 		 82 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10421  S4 domain-containing protein  41.3 
 
 		 58 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1647  RNA-binding S4  42.86 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.396094  normal  0.423975 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0081  RNA-binding S4  40.48 
 
 		 69 aa  43.5  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0003  S4 region YaaA family protein  48.72 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0799775  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0126  RNA-binding S4 domain protein  38.78 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.564525  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1824  RNA-binding S4  45.24 
 
 		 73 aa  42.4  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2293  RNA-binding S4 domain protein  36.17 
 
 		 70 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.26047 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0003  S4 region, YaaA  48.72 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0386838  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0366  hypothetical protein  41.3 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0618  RNA-binding S4 domain-containing protein  40.91 
 
 		 70 aa  42  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.109181  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0383  RNA-binding S4  38.64 
 
 		 72 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0053  RNA-binding S4 domain protein  42.22 
 
 		 74 aa  41.6  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.525969  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10651  S4 domain-containing protein  38.64 
 
 		 72 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0278753 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1550  S4 domain protein YaaA  43.18 
 
 		 71 aa  41.2  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.715034  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0086  hypothetical protein  38.3 
 
 		 56 aa  41.2  0.005  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06080  hypothetical protein  34.69 
 
 		 80 aa  41.2  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5767  hypothetical protein  38.3 
 
 		 72 aa  41.2  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.401314 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1328  RNA-binding S4 domain-containing protein  31.25 
 
 		 92 aa  40.8  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2770  RNA-binding S4 domain-containing protein  35.42 
 
 		 78 aa  40.8  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.013443  normal  0.790943 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3539  RNA-binding S4 domain-containing protein  39.13 
 
 		 67 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0130697 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2457  RNA-binding S4 domain-containing protein  36.17 
 
 		 77 aa  40  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>