48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1412 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1412  polysaccharide biosynthesis protein (putative)  100 
 
 
343 aa  691    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.536858  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1368  acyltransferase 3  33.33 
 
 
355 aa  149  6e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.79899  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5136  hypothetical protein  27.37 
 
 
343 aa  116  6e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.291325  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5308  hypothetical protein  27.37 
 
 
343 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5704  hypothetical protein  27.37 
 
 
343 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5549  hypothetical protein  27.09 
 
 
343 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5150  hypothetical protein  26.82 
 
 
343 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.591493  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0873  acyltransferase 3  35.44 
 
 
376 aa  109  8.000000000000001e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.128696 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3292  hypothetical protein  21.02 
 
 
336 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.630097 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2117  acyltransferase 3  26.96 
 
 
334 aa  77.4  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00661626  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0422  membrane protein  24.92 
 
 
337 aa  73.9  0.000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002129  hypothetical protein  23.87 
 
 
337 aa  72.8  0.000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00291  hypothetical protein  22.11 
 
 
337 aa  72  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20920  hypothetical protein  23.9 
 
 
357 aa  72.4  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0003  hypothetical protein  25.91 
 
 
339 aa  62.8  0.000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00165442 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06310  hypothetical protein  25 
 
 
371 aa  58.5  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4439  acyltransferase 3  24.35 
 
 
330 aa  57.4  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1382  hypothetical protein  23.4 
 
 
375 aa  57.4  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4157  acyltransferase 3  24.03 
 
 
330 aa  57  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4937  acyltransferase family protein  24.62 
 
 
331 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.125366 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4057  acyltransferase family protein  25.76 
 
 
331 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0153  acyltransferase 3  24.32 
 
 
331 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.73773  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03364  hypothetical protein  24.32 
 
 
331 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03413  conserved inner membrane protein  24.32 
 
 
331 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0149  acyltransferase 3  26.36 
 
 
331 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3764  acyltransferase family protein  24.02 
 
 
331 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.748321  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3884  acyltransferase family protein  25.76 
 
 
331 aa  53.5  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2465  acyltransferase 3  28.38 
 
 
362 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2065  acyltransferase 3  22.56 
 
 
384 aa  51.2  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.393482  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1879  hypothetical protein  22.02 
 
 
373 aa  50.8  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3111  acyltransferase 3  23.77 
 
 
362 aa  51.2  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0360298  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3041  hypothetical protein  24.5 
 
 
374 aa  50.4  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0817  acyltransferase 3  24.18 
 
 
352 aa  50.1  0.00006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.923925  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3935  acyltransferase 3  24.6 
 
 
331 aa  49.7  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.876763 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3872  acyltransferase 3  23.62 
 
 
331 aa  49.7  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3981  acyltransferase 3  23.62 
 
 
331 aa  49.3  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4040  acyltransferase 3  24.6 
 
 
331 aa  49.3  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.058021 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3853  acyltransferase 3  23.62 
 
 
331 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2581  acyltransferase 3  21.13 
 
 
358 aa  48.1  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0275652 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0160  acyltransferase 3  25.57 
 
 
331 aa  47.8  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3645  hypothetical protein  30.19 
 
 
387 aa  47  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.110018  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1429  hypothetical protein  28.28 
 
 
379 aa  45.1  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.715682  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4169  hypothetical protein  24.76 
 
 
330 aa  45.1  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273033 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0050  acyltransferase 3  24.76 
 
 
330 aa  45.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.490753  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4108  putative acyltransferase  30.28 
 
 
330 aa  44.3  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1862  hypothetical protein  20.94 
 
 
321 aa  44.3  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.378976  normal  0.0201885 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2961  hypothetical protein  20.94 
 
 
321 aa  43.9  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3034  hypothetical protein  20.94 
 
 
321 aa  43.9  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.209645  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>