More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0635 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00611  leucyl-tRNA synthetase  40.78 
 
 
860 aa  654    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.197817  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2984  leucyl-tRNA synthetase  40.9 
 
 
860 aa  657    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00147705  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0481  leucyl-tRNA synthetase  49.29 
 
 
819 aa  824    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.772871  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0194  leucyl-tRNA synthetase  46.59 
 
 
813 aa  729    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.159225  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2209  leucyl-tRNA synthetase  45.36 
 
 
824 aa  726    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4794  leucyl-tRNA synthetase  40.98 
 
 
868 aa  673    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.232287 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2339  leucyl-tRNA synthetase  53.48 
 
 
858 aa  916    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000153257  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1318  leucyl-tRNA synthetase  66.29 
 
 
804 aa  1153    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1453  leucyl-tRNA synthetase  40.38 
 
 
887 aa  657    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.721273  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2929  leucyl-tRNA synthetase  42.07 
 
 
863 aa  670    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.010661 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4882  leucyl-tRNA synthetase  67.53 
 
 
802 aa  1179    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1722  leucyl-tRNA synthetase  41.31 
 
 
863 aa  664    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2057  leucyl-tRNA synthetase  64.29 
 
 
833 aa  1128    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00764641  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41128  predicted protein  50.63 
 
 
879 aa  845    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.780375  normal  0.100817 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1174  leucyl-tRNA synthetase  41.92 
 
 
859 aa  673    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4812  leucyl-tRNA synthetase  40.59 
 
 
868 aa  671    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4637  leucyl-tRNA synthetase  67.91 
 
 
802 aa  1183    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.802633  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4472  leucyl-tRNA synthetase  68.03 
 
 
802 aa  1184    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.947334  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl490  leucyl-tRNA synthetase  52.63 
 
 
801 aa  850    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4490  leucyl-tRNA synthetase  67.91 
 
 
802 aa  1183    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2515  leucyl-tRNA synthetase  46.7 
 
 
827 aa  751    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000585626  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1302  leucyl-tRNA synthetase  43.4 
 
 
823 aa  682    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1301  leucyl-tRNA synthetase  43.16 
 
 
823 aa  679    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4352  leucyl-tRNA synthetase  40.14 
 
 
868 aa  666    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.964178  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3786  leucyl-tRNA synthetase  41.22 
 
 
906 aa  677    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.731933 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1813  leucyl-tRNA synthetase  67.66 
 
 
805 aa  1127    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.682245  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2156  leucyl-tRNA synthetase  44.55 
 
 
830 aa  719    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0321  leucyl-tRNA synthetase  40.16 
 
 
862 aa  671    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.955307  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15061  leucyl-tRNA synthetase  40.16 
 
 
878 aa  639    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.136372 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1295  leucyl-tRNA synthetase  69.93 
 
 
806 aa  1205    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000279205  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4936  leucyl-tRNA synthetase  42.81 
 
 
872 aa  695    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.130078 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2863  leucyl-tRNA synthetase  41.57 
 
 
859 aa  662    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.140087  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2665  leucyl-tRNA synthetase  43.36 
 
 
819 aa  692    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.364748  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4957  leucyl-tRNA synthetase  41.43 
 
 
868 aa  672    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1176  leucyl-tRNA synthetase  39.6 
 
 
894 aa  638    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.191907 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1413  leucyl-tRNA synthetase  43.16 
 
 
851 aa  711    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000816015  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1636  leucyl-tRNA synthetase  57.13 
 
 
805 aa  935    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.494326  normal  0.491966 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1106  leucyl-tRNA synthetase  41.4 
 
 
884 aa  660    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.629487  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1688  leucyl-tRNA synthetase  53.81 
 
 
805 aa  900    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1380  leucyl-tRNA synthetase  42.21 
 
 
875 aa  653    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.922349  normal  0.216701 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2300  leucyl-tRNA synthetase  44.51 
 
 
824 aa  724    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.284228  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2439  leucyl-tRNA synthetase  45.17 
 
 
829 aa  729    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0479  leucyl-tRNA synthetase  42.79 
 
 
877 aa  676    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4991  leucyl-tRNA synthetase  67.91 
 
 
802 aa  1183    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0159  leucyl-tRNA synthetase  45.85 
 
 
813 aa  728    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1920  leucyl-tRNA synthetase  44.21 
 
 
865 aa  721    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4535  leucyl-tRNA synthetase  41.36 
 
 
904 aa  665    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0659  leucyl-tRNA synthetase  51.53 
 
 
804 aa  867    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4669  leucyl-tRNA synthetase  40.98 
 
 
906 aa  674    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0568  leucyl-tRNA synthetase  45.84 
 
 
829 aa  768    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0853  leucyl-tRNA synthetase  45.26 
 
 
949 aa  757    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0292771 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2727  leucyl-tRNA synthetase  41.85 
 
 
858 aa  673    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.354364  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09721  leucyl-tRNA synthetase  41.29 
 
 
856 aa  640    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.90709  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4197  leucyl-tRNA synthetase  44.35 
 
 
859 aa  711    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2145  leucyl-tRNA synthetase  44.05 
 
 
817 aa  703    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.736456  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3308  leucyl-tRNA synthetase  44.57 
 
 
819 aa  694    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0417159 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2155  leucyl-tRNA synthetase  43.77 
 
 
817 aa  693    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3134  leucyl-tRNA synthetase  44.15 
 
 
824 aa  715    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0797  leucyl-tRNA synthetase  41.38 
 
 
872 aa  670    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.749816  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2344  leucyl-tRNA synthetase  41.41 
 
 
856 aa  659    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.633045  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0478  leucyl-tRNA synthetase  41.34 
 
 
894 aa  643    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0757  leucyl-tRNA synthetase  46.27 
 
 
824 aa  728    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0232  leucyl-tRNA synthetase  40.18 
 
 
861 aa  660    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1328  leucyl-tRNA synthetase  43.09 
 
 
856 aa  661    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0567  leucyl-tRNA synthetase  45.42 
 
 
819 aa  714    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0791746  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1861  leucyl-tRNA synthetase  44.68 
 
 
829 aa  723    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.911399  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3225  leucyl-tRNA synthetase  44.66 
 
 
954 aa  753    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.14755  normal  0.0283865 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5389  leucyl-tRNA synthetase  45.81 
 
 
971 aa  778    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.852911  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3202  leucyl-tRNA synthetase  43.64 
 
 
817 aa  701    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1566  leucyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 
870 aa  691    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.408978  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0657  leucyl-tRNA synthetase  45.71 
 
 
816 aa  728    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0645  leucyl-tRNA synthetase  45.59 
 
 
816 aa  742    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1557  leucyl-tRNA synthetase  41.3 
 
 
860 aa  669    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3269  leucyl-tRNA synthetase  41.45 
 
 
874 aa  667    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0997  leucyl-tRNA synthetase  41.57 
 
 
859 aa  670    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.248445  normal  0.169991 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1062  leucyl-tRNA synthetase  41.57 
 
 
859 aa  674    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0109864 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0400  leucyl-tRNA synthetase  41.54 
 
 
864 aa  655    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.8894  normal  0.692139 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0705  leucyl-tRNA synthetase  41.72 
 
 
872 aa  667    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.173652  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1599  leucyl-tRNA synthetase  46.19 
 
 
824 aa  760    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000190725  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5765  leucyl-tRNA synthetase  45.81 
 
 
971 aa  778    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.351208  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1237  leucyl-tRNA synthetase  45.5 
 
 
825 aa  754    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12230  leucyl-tRNA synthetase  40.11 
 
 
873 aa  649    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.726587  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0875  leucyl-tRNA synthetase  65.04 
 
 
829 aa  1120    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0839  leucyl-tRNA synthetase  74.17 
 
 
829 aa  1281    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.435731  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0459  leucyl-tRNA synthetase  64.73 
 
 
804 aa  1111    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0456991  normal  0.0638031 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0635  leucyl-tRNA synthetase  100 
 
 
808 aa  1668    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.578489  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0268  leucyl-tRNA synthetase  65.48 
 
 
833 aa  1145    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2247  leucyl-tRNA synthetase  43.46 
 
 
843 aa  702    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09941  leucyl-tRNA synthetase  39.98 
 
 
862 aa  669    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.880556  normal  0.45126 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2084  leucyl-tRNA synthetase  42.53 
 
 
829 aa  666    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.276133  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0432  leucyl-tRNA synthetase  40.97 
 
 
859 aa  640    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0302206  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1001  leucyl-tRNA synthetase  41.57 
 
 
859 aa  673    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.355839  normal  0.124376 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0771  leucyl-tRNA synthetase  41.99 
 
 
832 aa  677    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.286234  normal  0.18971 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1731  leucyl-tRNA synthetase  44.2 
 
 
823 aa  721    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.308382  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0551  leucyl-tRNA synthetase  54.46 
 
 
816 aa  889    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1884  leucyl-tRNA synthetase  42.05 
 
 
848 aa  657    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.439942  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2582  leucyl-tRNA synthetase  42.15 
 
 
864 aa  678    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.60297 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5478  leucyl-tRNA synthetase  45.81 
 
 
971 aa  778    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.81609  normal  0.704935 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1191  leucyl-tRNA synthetase  42.1 
 
 
859 aa  682    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.663748 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6054  leucyl-tRNA synthetase  44.61 
 
 
968 aa  753    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.110636  normal  0.47008 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>