23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0030 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_0030  hypothetical protein  100 
 
 
347 aa  714    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0361636 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2904  hypothetical protein  47.43 
 
 
380 aa  245  6e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2868  hypothetical protein  35 
 
 
410 aa  160  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3842  hypothetical protein  34.02 
 
 
370 aa  155  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4245  hypothetical protein  34.64 
 
 
387 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0734914 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5114  hypothetical protein  32.49 
 
 
364 aa  134  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00719605 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0215  polysaccharide pyruvyl transferase  28.65 
 
 
366 aa  55.5  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1129  polysaccharide pyruvyl transferase  22.88 
 
 
428 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.904656  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3383  polysaccharide pyruvyl transferase  35.82 
 
 
408 aa  48.5  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0373  hypothetical protein  34.62 
 
 
413 aa  46.6  0.0007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0482859  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0431  hypothetical protein  34.62 
 
 
413 aa  46.2  0.0007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.645976  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3356  polysaccharide pyruvyl transferase  22.87 
 
 
435 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2379  polysaccharide pyruvyl transferase  28.57 
 
 
400 aa  45.1  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000108064  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0123  polysaccharide pyruvyl transferase  25.86 
 
 
356 aa  43.9  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000678569  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1063  CsaB protein  29.07 
 
 
367 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0713  polysaccharide pyruvyl transferase  29.07 
 
 
369 aa  43.5  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.67475  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4399  polysaccharide pyruvyl transferase CsaB  23.92 
 
 
362 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0391258  hitchhiker  0.00000000000323458 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0884  pyruvyl-transferase  29.07 
 
 
367 aa  43.5  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0973  CsaB protein  29.07 
 
 
367 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0112574 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0788  pyruvyl-transferase  29.07 
 
 
367 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.192045  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0786  pyruvyl-transferase  26.9 
 
 
375 aa  43.5  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00245875  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0840  CsaB protein  29.07 
 
 
367 aa  43.5  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2659  putative pyruvyl transferase  21.31 
 
 
426 aa  42.7  0.01  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.520792  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>