12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3842 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3842  hypothetical protein  100 
 
 		 370 aa  756    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2868  hypothetical protein  46.28 
 
 		 410 aa  298  8e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4245  hypothetical protein  48.6 
 
 		 387 aa  280  3e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0734914 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5114  hypothetical protein  34.8 
 
 		 364 aa  163  6e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00719605 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0030  hypothetical protein  34.02 
 
 		 347 aa  155  1e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0361636 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2904  hypothetical protein  37.1 
 
 		 380 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3356  polysaccharide pyruvyl transferase  24.43 
 
 		 435 aa  58.9  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1129  polysaccharide pyruvyl transferase  23.61 
 
 		 428 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.904656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2981  hypothetical protein  21.37 
 
 		 387 aa  47  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2659  putative pyruvyl transferase  22.83 
 
 		 426 aa  45.4  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.520792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1706  polysaccharide pyruvyl transferase  25.1 
 
 		 348 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1731  polysaccharide pyruvyl transferase  25.1 
 
 		 348 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>