37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0073 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_0073  disulphide bond formation protein DsbB  100 
 
 		 166 aa  325  2.0000000000000001e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2859  disulphide bond formation protein DsbB  46.27 
 
 		 162 aa  127  5.0000000000000004e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.387387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0468  disulphide bond formation protein DsbB  37.34 
 
 		 168 aa  68.2  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0356503  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5483  disulphide bond formation protein DsbB  31.13 
 
 		 183 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2653  disulphide bond formation protein DsbB  34.01 
 
 		 172 aa  62  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0734912  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6002  disulfide bond formation protein  31.11 
 
 		 163 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.154587  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1862  disulphide bond formation protein DsbB  31.58 
 
 		 166 aa  57.4  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0761  disulphide bond formation protein DsbB  29.93 
 
 		 168 aa  56.2  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02553  disulfide bond formation protein B  30.83 
 
 		 172 aa  54.3  0.0000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.240277  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0045  disulphide bond formation protein DsbB  29.71 
 
 		 171 aa  53.5  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1547  disulphide bond formation protein DsbB  28.15 
 
 		 167 aa  52.8  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2385  disulphide bond formation protein DsbB  27.41 
 
 		 168 aa  52.8  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.735405 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1033  disulphide bond formation protein DsbB  31.75 
 
 		 168 aa  52  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.194192  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2104  disulphide bond formation protein DsbB  33.33 
 
 		 174 aa  52.4  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.170796  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0284  disulphide bond formation protein DsbB  32.59 
 
 		 163 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09724  disulfide bond formation protein  27.74 
 
 		 165 aa  52  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69400  disulfide bond formation protein  30.67 
 
 		 163 aa  50.8  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47560  disulfide bond formation protein  34.4 
 
 		 163 aa  50.4  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.825757  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1882  disulfide bond formation protein B  27.4 
 
 		 173 aa  49.7  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0159786  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3059  disulfide bond formation protein B  33.33 
 
 		 164 aa  48.5  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3585  disulfide bond formation protein B  28.67 
 
 		 166 aa  47.4  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.711953  normal  0.299598 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0042  disulphide bond formation protein DsbB  32.26 
 
 		 176 aa  46.6  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0034  disulfide bond formation protein  32.26 
 
 		 176 aa  47  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2654  hypothetical protein  28.47 
 
 		 163 aa  47  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2957  Disulphide bond formation protein DsbB  32.09 
 
 		 171 aa  47  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1805  disulfide bond formation protein B  26.71 
 
 		 173 aa  46.2  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0937244  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1246  disulfide bond formation protein B  29.85 
 
 		 159 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.66054 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0870  disulphide bond formation protein DsbB  33.98 
 
 		 177 aa  43.5  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2599  disulphide bond formation protein DsbB  30.83 
 
 		 169 aa  43.5  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000270754  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2785  hypothetical protein  27.74 
 
 		 163 aa  42.7  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4377  disulfide bond formation protein B  36.11 
 
 		 168 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1373  disulfide bond formation protein B  27.85 
 
 		 159 aa  42.4  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.299022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1523  Disulphide bond formation protein DsbB  31.07 
 
 		 175 aa  42  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.292193  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0782  disulfide bond formation protein B  35 
 
 		 168 aa  42.4  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.136765  normal  0.0551075 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1312  disulfide bond formation protein B  32.67 
 
 		 159 aa  42  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.461088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0044  DsbB family disulfide bond formation protein  34.94 
 
 		 508 aa  40.8  0.008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.402218  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0017  DsbB family disulfide bond formation protein  34.94 
 
 		 508 aa  40.8  0.008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>