29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0471 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008309  HS_0471  hypothetical protein  100 
 
 
147 aa  295  2e-79  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.503615  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0011  hypothetical protein  41.84 
 
 
149 aa  84.7  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0232  hypothetical protein  37.18 
 
 
163 aa  82.4  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.203963  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3910  hypothetical protein  36.05 
 
 
155 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.518185  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4115  hypothetical protein  36.05 
 
 
155 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4350  hypothetical protein  37.82 
 
 
155 aa  77  0.00000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.488502  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0097  hypothetical protein  34.03 
 
 
155 aa  77  0.00000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4492  hypothetical protein  37.82 
 
 
155 aa  77  0.00000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.158195 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4002  hypothetical protein  36.05 
 
 
155 aa  77  0.00000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.224302 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4295  hypothetical protein  37.82 
 
 
155 aa  77  0.00000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.617343  unclonable  0.00000000000376809 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0048  hypothetical protein  37.82 
 
 
155 aa  76.6  0.00000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.125105  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0088  hypothetical protein  33.33 
 
 
155 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000738017  normal  0.173427 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3948  hypothetical protein  31.13 
 
 
155 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0054  hypothetical protein  34.01 
 
 
155 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.806166  normal  0.044221 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3912  hypothetical protein  34.67 
 
 
155 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0208  hypothetical protein  31.82 
 
 
159 aa  72.4  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.294068  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4729  hypothetical protein  36.05 
 
 
155 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00011  hypothetical protein  33.33 
 
 
155 aa  70.9  0.000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001912  hypothetical protein  36.88 
 
 
162 aa  66.6  0.00000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0091  hypothetical protein  35.37 
 
 
159 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.156914  hitchhiker  0.000348756 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3719  hypothetical protein  38.82 
 
 
155 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.144984  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2403  hypothetical protein  33.8 
 
 
163 aa  63.5  0.0000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3625  hypothetical protein  36.63 
 
 
155 aa  60.8  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.638211  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4824  hypothetical protein  34.62 
 
 
162 aa  55.5  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00580  hypothetical protein  36.21 
 
 
162 aa  53.9  0.0000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1415  hypothetical protein  31.96 
 
 
154 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.303637  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1796  hypothetical protein  29.66 
 
 
153 aa  49.3  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.44789  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0642  hypothetical protein  31.06 
 
 
152 aa  46.6  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19350  hypothetical protein  28.16 
 
 
151 aa  40.8  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.545788  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>