More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0470 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0470  YbaK/ebsC protein  100 
 
 		 166 aa  339  1e-92  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0228  hypothetical protein  64.6 
 
 		 169 aa  217  6e-56  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.822642  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1181  ybaK/ebsC protein  51.52 
 
 		 166 aa  158  4e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0675087  normal  0.344163 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10900  ybaK/ebsC protein  52.17 
 
 		 170 aa  155  2e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.882195 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1696  ybaK/ebsC protein  52.7 
 
 		 168 aa  151  4e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0180556 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3222  hypothetical protein  48.41 
 
 		 159 aa  144  5e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3047  ybaK/ebsC protein  49.7 
 
 		 163 aa  144  8.000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.326078  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1093  hypothetical protein  47.77 
 
 		 159 aa  143  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2376  ybaK/ebsC protein  52.26 
 
 		 169 aa  139  9.999999999999999e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1461  ybaK/ebsC protein  43.87 
 
 		 155 aa  136  2e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1664  ybaK/ebsC protein  51.22 
 
 		 170 aa  135  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.773078  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0573  hypothetical protein  46.5 
 
 		 159 aa  134  7.000000000000001e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3029  hypothetical protein  45.86 
 
 		 159 aa  134  7.000000000000001e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.480981  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1263  hypothetical protein  45.86 
 
 		 159 aa  134  8e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0125501 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1148  hypothetical protein  47.13 
 
 		 159 aa  133  9e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0654966  hitchhiker  0.000000339512 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00432  hypothetical protein  46.5 
 
 		 159 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.362307  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3129  ybaK/ebsC protein  46.5 
 
 		 159 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.393401  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2065  ybaK/ebsC protein  45.81 
 
 		 154 aa  133  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3167  hypothetical protein  45.86 
 
 		 159 aa  133  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.583041  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00437  hypothetical protein  46.5 
 
 		 159 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.34185  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3135  hypothetical protein  46.5 
 
 		 159 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.215151  unclonable  0.0000000116633 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0520  hypothetical protein  46.5 
 
 		 159 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0558  hypothetical protein  46.5 
 
 		 159 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0602  hypothetical protein  45.86 
 
 		 159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000350431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0021  YbaK/EbsC protein  47.74 
 
 		 155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000866016 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0543  hypothetical protein  45.86 
 
 		 159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.243871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0558  hypothetical protein  45.86 
 
 		 159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.743946  normal  0.562407 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0548  hypothetical protein  45.86 
 
 		 159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0135035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0525  hypothetical protein  46.5 
 
 		 159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0541  hypothetical protein  45.86 
 
 		 159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0960  hypothetical protein  45.86 
 
 		 159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0416  hypothetical protein  45.86 
 
 		 159 aa  131  3e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2906  YbaK/EbsC protein  42.07 
 
 		 166 aa  130  9e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0785  ybaK/ebsC protein  49.36 
 
 		 157 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1124  hypothetical protein  43.59 
 
 		 158 aa  128  3e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0955  ybaK/ebsC protein  43.59 
 
 		 158 aa  128  3e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0993  ybaK/ebsC protein  43.59 
 
 		 158 aa  128  3e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.206645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0957  ybaK/ebsC protein  43.59 
 
 		 158 aa  128  3e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3090  ybaK/ebsC protein  43.87 
 
 		 155 aa  127  6e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00342065  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2973  ybaK/ebsC protein  43.59 
 
 		 158 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0531  YbaK/EbsC protein  44.87 
 
 		 157 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.969939  normal  0.0653141 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5733  ybaK/ebsC protein  41.72 
 
 		 165 aa  126  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2187  hypothetical protein  49.36 
 
 		 156 aa  126  1.0000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3903  hypothetical protein  45.45 
 
 		 156 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.531772  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10700  ybaK/ebsC protein  40.85 
 
 		 172 aa  125  2.0000000000000002e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00787885  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3029  hypothetical protein  48.41 
 
 		 159 aa  124  4.0000000000000003e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0012  ybaK/ebsC protein  49.3 
 
 		 157 aa  124  5e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0187594 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1029  hypothetical protein  47.77 
 
 		 159 aa  124  9e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.648566  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30720  ybaK/ebsC protein  45.86 
 
 		 158 aa  123  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.685744  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1105  ybaK/ebsC protein  42.28 
 
 		 162 aa  123  1e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4166  ybaK/ebsC protein  47.48 
 
 		 156 aa  122  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1563  hypothetical protein  44.81 
 
 		 156 aa  122  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17990  hypothetical protein  44.81 
 
 		 156 aa  122  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.020982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3539  ybaK/ebsC protein  44.23 
 
 		 158 aa  122  3e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1040  ybaK/ebsC protein  43.59 
 
 		 158 aa  121  3e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0196148  hitchhiker  0.0000171099 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0113  ybaK/ebsC protein  42.21 
 
 		 155 aa  122  3e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3321  ybaK/ebsC protein  43.59 
 
 		 158 aa  121  4e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1777  ybaK/ebsC protein  47.92 
 
 		 178 aa  121  4e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.875874 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14010  hypothetical protein  44.81 
 
 		 155 aa  121  4e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0625  ybaK/ebsC protein  46.58 
 
 		 157 aa  120  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0361405 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2421  ybaK/ebsC protein  43.31 
 
 		 157 aa  119  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.332084 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6293  ybaK/ebsC protein  46.25 
 
 		 160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0146  hypothetical protein  42.5 
 
 		 162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14060  ybaK/ebsC protein  43.31 
 
 		 163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00161017  normal  0.469226 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3413  ybaK/ebsC protein  42.95 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0703981  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3195  ybaK/ebsC protein  41.51 
 
 		 161 aa  118  3e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.827708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4530  hypothetical protein  44.52 
 
 		 156 aa  119  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.666338  normal  0.145065 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0135  hypothetical protein  41.25 
 
 		 162 aa  117  4.9999999999999996e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.248182 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3039  hypothetical protein  41.94 
 
 		 156 aa  117  4.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.499163  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0016  ybaK/ebsC protein  48.3 
 
 		 154 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0587946  normal  0.636311 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02442  ybaK/ebsC protein  43.23 
 
 		 156 aa  117  7e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00512118  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1106  ybaK/ebsC protein  44.16 
 
 		 156 aa  117  7e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0092  ybaK/ebsC protein  46.75 
 
 		 156 aa  117  7.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0018  ybaK/ebsC protein  45.45 
 
 		 155 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00021851 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1431  ybaK/ebsC protein  44.16 
 
 		 164 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.867561 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1077  ybaK/ebsC protein  43.51 
 
 		 156 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.593377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2899  ybaK/ebsC protein  45.22 
 
 		 164 aa  115  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000923134  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1118  ybaK/ebsC protein  43.51 
 
 		 156 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.081988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4335  ybaK/ebsC protein  46.38 
 
 		 156 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.319378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3844  ybaK/ebsC protein  40.76 
 
 		 160 aa  115  3.9999999999999997e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0013  ybaK/ebsC protein  49.36 
 
 		 156 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2730  YbaK/EbsC protein  44.52 
 
 		 155 aa  113  8.999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1657  ybaK/ebsC protein  50 
 
 		 164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000366194 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4234  ybaK/ebsC protein  40.76 
 
 		 160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.253359  normal  0.089415 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4690  ybaK/ebsC protein  46.41 
 
 		 193 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.121488  normal  0.0399012 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1201  ybaK/ebsC protein  39.87 
 
 		 155 aa  111  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00297582  hitchhiker  0.00069795 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1012  ybaK/ebsC protein  39.35 
 
 		 157 aa  111  6e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3346  ybaK/ebsC protein  46.75 
 
 		 156 aa  110  6e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3407  ybaK/ebsC protein  43.87 
 
 		 158 aa  110  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0414  hypothetical protein  43.23 
 
 		 155 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2876  ybaK/ebsC protein  38.92 
 
 		 166 aa  108  4.0000000000000004e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.10674 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2425  ybaK/ebsC protein  39.01 
 
 		 157 aa  107  7.000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4290  ybaK/ebsC protein  38.85 
 
 		 157 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.780598 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1120  hypothetical protein  37.27 
 
 		 157 aa  106  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3507  ybaK/ebsC protein  40.56 
 
 		 157 aa  106  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01257  hypothetical protein  45.86 
 
 		 157 aa  106  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0861  ybaK/ebsC protein  45.07 
 
 		 154 aa  106  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.935106  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0153  ybaK/ebsC protein  41.55 
 
 		 157 aa  106  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.548766  normal  0.0477422 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3526  ybaK/ebsC protein  43.56 
 
 		 166 aa  106  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3183  ybaK/ebsC protein  42.35 
 
 		 166 aa  105  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.402075  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>