26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_4114 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_4114  hypothetical protein  100 
 
 		 186 aa  389  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0840  hypothetical protein  59.77 
 
 		 606 aa  220  8e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.135812 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1116  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  43.5 
 
 		 679 aa  161  5.0000000000000005e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1826  ATPase  32.74 
 
 		 583 aa  87  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1016  5-methylcytosine-specific restriction related enzyme  38.21 
 
 		 792 aa  79  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0873  hypothetical protein  37.4 
 
 		 847 aa  77  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373833  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0927  hypothetical protein  37.4 
 
 		 843 aa  77  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1096  hypothetical protein  37.4 
 
 		 844 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0970  ATPase, AAA family  38.21 
 
 		 844 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1291  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  36.97 
 
 		 559 aa  75.9  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.902776  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2172  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  36.49 
 
 		 559 aa  74.3  0.0000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1013  hypothetical protein  38.33 
 
 		 393 aa  70.5  0.00000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0132535  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1872  hypothetical protein  32.89 
 
 		 201 aa  64.7  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.155609  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2758  hypothetical protein  30.82 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.13362 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5841  hypothetical protein  35.34 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0796371  normal  0.223899 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3215  hypothetical protein  38.27 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.144427 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3173  hypothetical protein  34.04 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2989  hypothetical protein  30.86 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0025  hypothetical protein  27.54 
 
 		 418 aa  55.1  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000254674  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0025  hypothetical protein  27.54 
 
 		 418 aa  55.1  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000509485  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2528  hypothetical protein  27.54 
 
 		 431 aa  55.1  0.0000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000441271  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6283  hypothetical protein  30.89 
 
 		 367 aa  52.4  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.345992  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04212  5-methylcytosine-specific restriction enzyme McrBC, subunit McrB  27.78 
 
 		 459 aa  42.7  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04176  hypothetical protein  27.78 
 
 		 459 aa  42.7  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0004  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  37.5 
 
 		 914 aa  42  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0928262  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3651  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.27 
 
 		 465 aa  41.6  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>