63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2839 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2839  gas vesicle synthesis protein GvpA  100 
 
 		 72 aa  140  6e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0079  gas vesicle synthesis protein GvpA  81.94 
 
 		 71 aa  115  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0130989  normal  0.0117948 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0078  gas vesicle synthesis protein GvpA  80.56 
 
 		 71 aa  114  3.9999999999999997e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00750449  normal  0.0121047 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0689  gas vesicle synthesis protein GvpA  85.07 
 
 		 68 aa  110  5e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.021084  normal  0.764349 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0688  gas vesicle synthesis protein GvpA  85.07 
 
 		 68 aa  110  5e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0200953  normal  0.76733 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3016  gas vesicle protein GVPa  85.07 
 
 		 71 aa  110  6e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2325  gas vesicle synthesis protein GvpA  80.6 
 
 		 72 aa  110  9e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740835  unclonable  0.0000203995 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1821  gas vesicle synthesis protein GvpA  83.58 
 
 		 68 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00228865  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1818  gas vesicle synthesis protein GvpA  83.58 
 
 		 68 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0025131  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1819  gas vesicle synthesis protein GvpA  83.58 
 
 		 68 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00075778  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1820  gas vesicle synthesis protein GvpA  83.58 
 
 		 68 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000245848  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0686  gas vesicle synthesis protein GvpA  83.58 
 
 		 68 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0189096  normal  0.509379 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2324  gas vesicle synthesis protein GvpA  83.08 
 
 		 75 aa  108  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0000000112837  hitchhiker  0.000242369 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2404  gas vesicle protein GVPa  68.75 
 
 		 98 aa  99  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1253  gas vesicle synthesis protein GvpA  73.85 
 
 		 72 aa  98.6  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.13379 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3255  gas vesicle synthesis protein GvpA  76.56 
 
 		 70 aa  96.3  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0851861 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3573  gas vesicle synthesis protein GvpA  76.56 
 
 		 70 aa  96.3  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.862983  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1748  gas vesicle synthesis protein GvpA  69.23 
 
 		 72 aa  95.1  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1498  gas vesicle protein GVPa  68.18 
 
 		 75 aa  92.4  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.921273  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3114  gas vesicle protein GVPa  69.7 
 
 		 94 aa  91.7  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2374  gas vesicle protein GVPa  77.05 
 
 		 96 aa  91.3  4e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0334  gas vesicle protein GVPa  68.18 
 
 		 95 aa  90.9  5e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1499  gas vesicle protein GVPa  65.22 
 
 		 76 aa  91.3  5e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0327  gas vesicle synthesis protein GvpA  74.58 
 
 		 76 aa  90.5  7e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.516569 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0328  gas vesicle synthesis protein GvpA  74.58 
 
 		 76 aa  90.5  7e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.518273 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0326  gas vesicle synthesis protein GvpA  74.58 
 
 		 76 aa  90.5  7e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.52791 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0060  gas vesicle synthesis protein GvpA  73.68 
 
 		 76 aa  87  8e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.537884  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0063  gas vesicle synthesis protein GvpA  73.68 
 
 		 74 aa  86.3  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0062  gas vesicle synthesis protein GvpA  73.68 
 
 		 74 aa  86.3  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0061  gas vesicle synthesis protein GvpA  73.68 
 
 		 74 aa  86.3  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4706  gas vesicle protein GVPa  67.27 
 
 		 138 aa  77.8  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.783958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2381  gas vesicle synthesis-like protein  64.15 
 
 		 139 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.528325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2334  gas vesicle synthesis-like protein  64.15 
 
 		 139 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2375  gas vesicle synthesis-like protein  64.15 
 
 		 139 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.721458  normal  0.751022 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4008  gas vesicle synthesis-like protein  57.89 
 
 		 143 aa  73.9  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1006  gas vesicle synthesis-like protein  54.1 
 
 		 143 aa  73.9  0.0000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6855  hypothetical protein  69.39 
 
 		 137 aa  72.8  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.479937  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2356  gas vesicle protein GVPa  58.06 
 
 		 137 aa  72  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0939575 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3382  gas vesicle protein GVPa  72.92 
 
 		 133 aa  71.2  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0355765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2323  gas vesicle protein GVPa  64.44 
 
 		 54 aa  63.9  0.0000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.0000151045  hitchhiker  0.000256299 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2322  gas vesicle protein GVPa  66.67 
 
 		 62 aa  57.4  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.0000661358  hitchhiker  0.000258705 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3025  gas vesicle protein GVPa  50 
 
 		 123 aa  54.3  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.749024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2828  gas vesicle protein GVPa  49.15 
 
 		 121 aa  53.5  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2405  gas vesicle protein GVPa  41.94 
 
 		 119 aa  48.5  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0685  hypothetical protein  76.67 
 
 		 60 aa  48.1  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.056491  normal  0.511838 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0070  gas vesicle protein GVPa  43.1 
 
 		 126 aa  47.4  0.00007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.471557  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2825  gas vesicle protein GVPa  39.62 
 
 		 75 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3580  gas vesicle protein GVPa  54.55 
 
 		 104 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1489  gas vesicle protein GVPa  39.66 
 
 		 126 aa  45.1  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.510909  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6859  hypothetical protein  44.9 
 
 		 178 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.330028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3264  gas vesicle protein GVPa  52.27 
 
 		 104 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.800769  normal  0.701046 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2385  gas vesicle protein GVPa  43.75 
 
 		 126 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.14946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2338  gas vesicle protein GVPa  43.75 
 
 		 126 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2379  gas vesicle protein GVPa  43.75 
 
 		 126 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3386  gas vesicle protein GVPa  45.65 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.128813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0335  hypothetical protein  44 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.942024 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0071  gas vesicle protein GVPa  41.51 
 
 		 230 aa  42.4  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0463018  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2351  gas vesicle protein GVPa  45.65 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.152283 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1262  gas vesicle protein GVPa  40.91 
 
 		 101 aa  42  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.026389  normal  0.71927 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0339  hypothetical protein  31.25 
 
 		 181 aa  42  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.881514  normal  0.486472 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4702  gas vesicle protein GVPa  44.44 
 
 		 114 aa  41.6  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0339  gas vesicle protein GVPa  33.33 
 
 		 152 aa  41.2  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1485  gas vesicle protein GVPa  36 
 
 		 116 aa  40.4  0.008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0249757  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>