58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0071 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0071  gas vesicle protein GVPa  100 
 
 		 230 aa  477  1e-134  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0463018  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0339  hypothetical protein  40 
 
 		 181 aa  128  9.000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.881514  normal  0.486472 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1485  gas vesicle protein GVPa  58.67 
 
 		 116 aa  95.9  5e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0249757  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3022  gas vesicle protein GVPa  60.26 
 
 		 78 aa  87.8  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2825  gas vesicle protein GVPa  57.35 
 
 		 75 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2366  gas vesicle protein GVPa  53.73 
 
 		 142 aa  75.5  0.0000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0342  gas vesicle protein GVPa  50.72 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.842156  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0070  gas vesicle protein GVPa  53.57 
 
 		 126 aa  64.7  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.471557  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0335  hypothetical protein  54 
 
 		 138 aa  62  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.942024 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1489  gas vesicle protein GVPa  58.33 
 
 		 126 aa  60.8  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.510909  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3025  gas vesicle protein GVPa  47.46 
 
 		 123 aa  60.5  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.749024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2828  gas vesicle protein GVPa  47.06 
 
 		 121 aa  56.2  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0339  gas vesicle protein GVPa  36.47 
 
 		 152 aa  54.7  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0704  hypothetical protein  58.14 
 
 		 69 aa  53.1  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1803  gas vesicle protein GVPa  53.33 
 
 		 66 aa  52  0.000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2369  gas vesicle protein GVPa  42 
 
 		 201 aa  51.6  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1253  gas vesicle synthesis protein GvpA  42 
 
 		 72 aa  49.7  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.13379 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1748  gas vesicle synthesis protein GvpA  42 
 
 		 72 aa  49.3  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1260  gas vesicle protein GVPa  40.38 
 
 		 74 aa  48.5  0.00008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.128453  normal  0.705808 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3255  gas vesicle synthesis protein GvpA  38.89 
 
 		 70 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0851861 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3573  gas vesicle synthesis protein GvpA  38.89 
 
 		 70 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.862983  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4702  gas vesicle protein GVPa  45.28 
 
 		 114 aa  46.6  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1813  gas vesicle protein GVPa  35.8 
 
 		 99 aa  46.2  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4706  gas vesicle protein GVPa  37.74 
 
 		 138 aa  46.2  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.783958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1819  gas vesicle synthesis protein GvpA  41.38 
 
 		 68 aa  45.8  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00075778  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1818  gas vesicle synthesis protein GvpA  41.38 
 
 		 68 aa  45.8  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0025131  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1820  gas vesicle synthesis protein GvpA  41.38 
 
 		 68 aa  45.8  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000245848  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1821  gas vesicle synthesis protein GvpA  41.38 
 
 		 68 aa  45.8  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00228865  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2404  gas vesicle protein GVPa  43.86 
 
 		 98 aa  45.8  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0689  gas vesicle synthesis protein GvpA  44 
 
 		 68 aa  45.4  0.0006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.021084  normal  0.764349 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0688  gas vesicle synthesis protein GvpA  44 
 
 		 68 aa  45.4  0.0006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0200953  normal  0.76733 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3016  gas vesicle protein GVPa  38 
 
 		 71 aa  45.4  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2381  gas vesicle protein GVPa  44.44 
 
 		 64 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.817742  normal  0.389389 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2387  gas vesicle protein GVPa  44.44 
 
 		 64 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.237755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2340  gas vesicle protein GVPa  44.44 
 
 		 64 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0686  gas vesicle synthesis protein GvpA  44 
 
 		 68 aa  45.1  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0189096  normal  0.509379 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0078  gas vesicle synthesis protein GvpA  39.22 
 
 		 71 aa  44.7  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00750449  normal  0.0121047 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2408  gas vesicle protein GVPa  48.84 
 
 		 85 aa  44.7  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0694  putative gas vesicle synthesis protein  36.71 
 
 		 97 aa  44.7  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.783723 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0079  gas vesicle synthesis protein GvpA  39.22 
 
 		 71 aa  44.3  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0130989  normal  0.0117948 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3388  gas vesicle protein GVPa  51.22 
 
 		 87 aa  43.9  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.185348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3114  gas vesicle protein GVPa  39.62 
 
 		 94 aa  43.9  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1499  gas vesicle protein GVPa  38.78 
 
 		 76 aa  43.5  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2349  gas vesicle protein GVPa  51.22 
 
 		 104 aa  43.5  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.364276 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2325  gas vesicle synthesis protein GvpA  41.18 
 
 		 72 aa  43.5  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740835  unclonable  0.0000203995 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0075  gas vesicle protein GVPa  27.03 
 
 		 148 aa  43.5  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0645865  decreased coverage  0.000500428 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4700  gas vesicle protein GVPa  48.84 
 
 		 65 aa  42.7  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0334  gas vesicle protein GVPa  39.62 
 
 		 95 aa  43.1  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2374  gas vesicle protein GVPa  37.74 
 
 		 96 aa  42.7  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2405  gas vesicle protein GVPa  38.33 
 
 		 119 aa  42.4  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2330  gas vesicle protein GVPa  38.78 
 
 		 103 aa  42.4  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00032613 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2839  gas vesicle synthesis protein GvpA  41.51 
 
 		 72 aa  42.4  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2375  gas vesicle synthesis-like protein  42.55 
 
 		 139 aa  42.4  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.721458  normal  0.751022 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2334  gas vesicle synthesis-like protein  42.55 
 
 		 139 aa  42.4  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2324  gas vesicle synthesis protein GvpA  37.93 
 
 		 75 aa  42.4  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0000000112837  hitchhiker  0.000242369 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2381  gas vesicle synthesis-like protein  42.55 
 
 		 139 aa  42.4  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.528325  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2351  gas vesicle protein GVPa  36.84 
 
 		 147 aa  42  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.152283 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1262  gas vesicle protein GVPa  40 
 
 		 101 aa  41.6  0.01  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.026389  normal  0.71927 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>