21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0685 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_0685  hypothetical protein  100 
 
 		 60 aa  122  1e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.056491  normal  0.511838 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0079  gas vesicle synthesis protein GvpA  83.33 
 
 		 71 aa  50.8  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0130989  normal  0.0117948 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1821  gas vesicle synthesis protein GvpA  75 
 
 		 68 aa  50.8  0.000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00228865  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0688  gas vesicle synthesis protein GvpA  75 
 
 		 68 aa  50.4  0.000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0200953  normal  0.76733 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0689  gas vesicle synthesis protein GvpA  75 
 
 		 68 aa  50.4  0.000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.021084  normal  0.764349 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1820  gas vesicle synthesis protein GvpA  75 
 
 		 68 aa  50.8  0.000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000245848  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1819  gas vesicle synthesis protein GvpA  75 
 
 		 68 aa  50.8  0.000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00075778  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1818  gas vesicle synthesis protein GvpA  75 
 
 		 68 aa  50.8  0.000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0025131  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0686  gas vesicle synthesis protein GvpA  75 
 
 		 68 aa  50.4  0.000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0189096  normal  0.509379 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0078  gas vesicle synthesis protein GvpA  80 
 
 		 71 aa  50.4  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00750449  normal  0.0121047 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2324  gas vesicle synthesis protein GvpA  77.42 
 
 		 75 aa  50.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0000000112837  hitchhiker  0.000242369 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1253  gas vesicle synthesis protein GvpA  70.97 
 
 		 72 aa  48.9  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.13379 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1748  gas vesicle synthesis protein GvpA  70.97 
 
 		 72 aa  48.9  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2325  gas vesicle synthesis protein GvpA  74.19 
 
 		 72 aa  48.9  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740835  unclonable  0.0000203995 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2839  gas vesicle synthesis protein GvpA  76.67 
 
 		 72 aa  48.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3255  gas vesicle synthesis protein GvpA  75 
 
 		 70 aa  47.8  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0851861 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3573  gas vesicle synthesis protein GvpA  75 
 
 		 70 aa  47.8  0.00006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.862983  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3016  gas vesicle protein GVPa  73.33 
 
 		 71 aa  47  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2404  gas vesicle protein GVPa  73.33 
 
 		 98 aa  47  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1498  gas vesicle protein GVPa  65.52 
 
 		 75 aa  41.2  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.921273  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1499  gas vesicle protein GVPa  65.52 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>