59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0060 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0060  gas vesicle synthesis protein GvpA  100 
 
 		 76 aa  147  4e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.537884  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0061  gas vesicle synthesis protein GvpA  98.63 
 
 		 74 aa  140  8e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0062  gas vesicle synthesis protein GvpA  98.63 
 
 		 74 aa  140  8e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0063  gas vesicle synthesis protein GvpA  98.63 
 
 		 74 aa  140  8e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0326  gas vesicle synthesis protein GvpA  77.63 
 
 		 76 aa  116  9e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.52791 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0328  gas vesicle synthesis protein GvpA  77.63 
 
 		 76 aa  116  9e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.518273 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0327  gas vesicle synthesis protein GvpA  77.63 
 
 		 76 aa  116  9e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.516569 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3114  gas vesicle protein GVPa  86.89 
 
 		 94 aa  112  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2374  gas vesicle protein GVPa  88.52 
 
 		 96 aa  112  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0334  gas vesicle protein GVPa  86.89 
 
 		 95 aa  112  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0079  gas vesicle synthesis protein GvpA  65.22 
 
 		 71 aa  89  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0130989  normal  0.0117948 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0078  gas vesicle synthesis protein GvpA  63.77 
 
 		 71 aa  88.6  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00750449  normal  0.0121047 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3016  gas vesicle protein GVPa  69.84 
 
 		 71 aa  87  8e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2839  gas vesicle synthesis protein GvpA  73.68 
 
 		 72 aa  87  8e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0688  gas vesicle synthesis protein GvpA  65.15 
 
 		 68 aa  85.1  3e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0200953  normal  0.76733 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0689  gas vesicle synthesis protein GvpA  65.15 
 
 		 68 aa  85.1  3e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.021084  normal  0.764349 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1820  gas vesicle synthesis protein GvpA  65.15 
 
 		 68 aa  84.7  4e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000245848  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1818  gas vesicle synthesis protein GvpA  65.15 
 
 		 68 aa  84.7  4e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0025131  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1819  gas vesicle synthesis protein GvpA  65.15 
 
 		 68 aa  84.7  4e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00075778  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1821  gas vesicle synthesis protein GvpA  65.15 
 
 		 68 aa  84.7  4e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00228865  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1253  gas vesicle synthesis protein GvpA  62.12 
 
 		 72 aa  84.3  5e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.13379 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2324  gas vesicle synthesis protein GvpA  70.18 
 
 		 75 aa  84  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0000000112837  hitchhiker  0.000242369 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2325  gas vesicle synthesis protein GvpA  68.42 
 
 		 72 aa  84  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740835  unclonable  0.0000203995 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0686  gas vesicle synthesis protein GvpA  63.64 
 
 		 68 aa  84  7e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0189096  normal  0.509379 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1499  gas vesicle protein GVPa  66.67 
 
 		 76 aa  82.8  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1006  gas vesicle synthesis-like protein  50.67 
 
 		 143 aa  83.2  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1498  gas vesicle protein GVPa  66.67 
 
 		 75 aa  82.4  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.921273  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1748  gas vesicle synthesis protein GvpA  59.09 
 
 		 72 aa  80.9  0.000000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2404  gas vesicle protein GVPa  68.63 
 
 		 98 aa  77.8  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2334  gas vesicle synthesis-like protein  62.07 
 
 		 139 aa  77.8  0.00000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2375  gas vesicle synthesis-like protein  62.07 
 
 		 139 aa  77.8  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.721458  normal  0.751022 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2381  gas vesicle synthesis-like protein  62.07 
 
 		 139 aa  77.8  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.528325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4008  gas vesicle synthesis-like protein  50 
 
 		 143 aa  77  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2356  gas vesicle protein GVPa  56.06 
 
 		 137 aa  76.3  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0939575 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4706  gas vesicle protein GVPa  54.24 
 
 		 138 aa  73.2  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.783958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6855  hypothetical protein  52.31 
 
 		 137 aa  72.8  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.479937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3255  gas vesicle synthesis protein GvpA  62.75 
 
 		 70 aa  70.5  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0851861 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3573  gas vesicle synthesis protein GvpA  62.75 
 
 		 70 aa  70.5  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.862983  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3382  gas vesicle protein GVPa  57.69 
 
 		 133 aa  67.8  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0355765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2323  gas vesicle protein GVPa  56.52 
 
 		 54 aa  60.8  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.0000151045  hitchhiker  0.000256299 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2379  gas vesicle protein GVPa  48.98 
 
 		 126 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2338  gas vesicle protein GVPa  48.98 
 
 		 126 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2385  gas vesicle protein GVPa  48.98 
 
 		 126 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.14946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1262  gas vesicle protein GVPa  50 
 
 		 101 aa  48.9  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.026389  normal  0.71927 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3580  gas vesicle protein GVPa  61.9 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4702  gas vesicle protein GVPa  45.1 
 
 		 114 aa  48.5  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3264  gas vesicle protein GVPa  59.52 
 
 		 104 aa  47.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.800769  normal  0.701046 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2828  gas vesicle protein GVPa  45.1 
 
 		 121 aa  47.4  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2351  gas vesicle protein GVPa  52.27 
 
 		 147 aa  46.2  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.152283 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3025  gas vesicle protein GVPa  45.83 
 
 		 123 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.749024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6859  hypothetical protein  46.67 
 
 		 178 aa  45.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.330028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2405  gas vesicle protein GVPa  47.73 
 
 		 119 aa  45.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3386  gas vesicle protein GVPa  44.44 
 
 		 134 aa  45.4  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.128813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0070  gas vesicle protein GVPa  40.98 
 
 		 126 aa  43.5  0.0009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.471557  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0335  hypothetical protein  40.74 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.942024 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2825  gas vesicle protein GVPa  36 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1489  gas vesicle protein GVPa  37.04 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.510909  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0694  putative gas vesicle synthesis protein  42.22 
 
 		 97 aa  42  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.783723 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1813  gas vesicle protein GVPa  40 
 
 		 99 aa  41.6  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>