68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0335 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0335  hypothetical protein  100 
 
 		 138 aa  284  2.9999999999999996e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.942024 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1489  gas vesicle protein GVPa  53.78 
 
 		 126 aa  133  9e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.510909  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0070  gas vesicle protein GVPa  57.01 
 
 		 126 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.471557  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2828  gas vesicle protein GVPa  53.15 
 
 		 121 aa  126  9.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3025  gas vesicle protein GVPa  59.22 
 
 		 123 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.749024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0339  gas vesicle protein GVPa  50 
 
 		 152 aa  86.7  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2369  gas vesicle protein GVPa  62.3 
 
 		 201 aa  85.9  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3022  gas vesicle protein GVPa  53.85 
 
 		 78 aa  62.4  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0071  gas vesicle protein GVPa  54 
 
 		 230 aa  62  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0463018  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2330  gas vesicle protein GVPa  46.15 
 
 		 103 aa  60.8  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00032613 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2335  gas vesicle protein GVPa  46.03 
 
 		 104 aa  58.9  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00675738 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1253  gas vesicle synthesis protein GvpA  43.06 
 
 		 72 aa  57.4  0.00000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.13379 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1485  gas vesicle protein GVPa  46.48 
 
 		 116 aa  57  0.00000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0249757  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2825  gas vesicle protein GVPa  52.08 
 
 		 75 aa  56.6  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0339  hypothetical protein  38.89 
 
 		 181 aa  54.7  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.881514  normal  0.486472 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0075  gas vesicle protein GVPa  42.86 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0645865  decreased coverage  0.000500428 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1748  gas vesicle synthesis protein GvpA  40.28 
 
 		 72 aa  54.3  0.0000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4702  gas vesicle protein GVPa  47.06 
 
 		 114 aa  53.9  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2366  gas vesicle protein GVPa  54.17 
 
 		 142 aa  53.5  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3255  gas vesicle synthesis protein GvpA  48 
 
 		 70 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0851861 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3573  gas vesicle synthesis protein GvpA  48 
 
 		 70 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.862983  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3264  gas vesicle protein GVPa  45.1 
 
 		 104 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.800769  normal  0.701046 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2405  gas vesicle protein GVPa  40.32 
 
 		 119 aa  51.6  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0078  gas vesicle synthesis protein GvpA  50 
 
 		 71 aa  51.2  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00750449  normal  0.0121047 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0079  gas vesicle synthesis protein GvpA  50 
 
 		 71 aa  50.8  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0130989  normal  0.0117948 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1813  gas vesicle protein GVPa  40 
 
 		 99 aa  50.8  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2381  gas vesicle synthesis-like protein  50 
 
 		 139 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.528325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2375  gas vesicle synthesis-like protein  50 
 
 		 139 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.721458  normal  0.751022 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2334  gas vesicle synthesis-like protein  50 
 
 		 139 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0694  putative gas vesicle synthesis protein  43.14 
 
 		 97 aa  50.4  0.000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.783723 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3580  gas vesicle protein GVPa  44 
 
 		 104 aa  50.4  0.000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2324  gas vesicle synthesis protein GvpA  49.06 
 
 		 75 aa  49.7  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0000000112837  hitchhiker  0.000242369 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1818  gas vesicle synthesis protein GvpA  48 
 
 		 68 aa  48.9  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0025131  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1819  gas vesicle synthesis protein GvpA  48 
 
 		 68 aa  48.9  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00075778  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1820  gas vesicle synthesis protein GvpA  48 
 
 		 68 aa  48.9  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000245848  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1821  gas vesicle synthesis protein GvpA  48 
 
 		 68 aa  48.9  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00228865  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2351  gas vesicle protein GVPa  39.34 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.152283 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2325  gas vesicle synthesis protein GvpA  47.17 
 
 		 72 aa  49.3  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740835  unclonable  0.0000203995 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0688  gas vesicle synthesis protein GvpA  48 
 
 		 68 aa  48.9  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0200953  normal  0.76733 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0689  gas vesicle synthesis protein GvpA  48 
 
 		 68 aa  48.9  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.021084  normal  0.764349 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4706  gas vesicle protein GVPa  48.94 
 
 		 138 aa  48.5  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.783958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2379  gas vesicle protein GVPa  38.1 
 
 		 126 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2338  gas vesicle protein GVPa  38.1 
 
 		 126 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2385  gas vesicle protein GVPa  38.1 
 
 		 126 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.14946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1498  gas vesicle protein GVPa  43.14 
 
 		 75 aa  47.8  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.921273  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1499  gas vesicle protein GVPa  43.14 
 
 		 76 aa  47.8  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0686  gas vesicle synthesis protein GvpA  46 
 
 		 68 aa  47.4  0.00006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0189096  normal  0.509379 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3386  gas vesicle protein GVPa  38 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.128813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6859  hypothetical protein  38 
 
 		 178 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.330028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2404  gas vesicle protein GVPa  42.59 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6855  hypothetical protein  47.27 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.479937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0334  gas vesicle protein GVPa  40.74 
 
 		 95 aa  45.4  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2374  gas vesicle protein GVPa  40.74 
 
 		 96 aa  45.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3114  gas vesicle protein GVPa  38.89 
 
 		 94 aa  44.7  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3016  gas vesicle protein GVPa  44 
 
 		 71 aa  44.3  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0326  gas vesicle synthesis protein GvpA  37.31 
 
 		 76 aa  44.7  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.52791 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0328  gas vesicle synthesis protein GvpA  37.31 
 
 		 76 aa  44.7  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.518273 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0327  gas vesicle synthesis protein GvpA  37.31 
 
 		 76 aa  44.7  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.516569 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1262  gas vesicle protein GVPa  36 
 
 		 101 aa  43.9  0.0007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.026389  normal  0.71927 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0342  gas vesicle protein GVPa  48.78 
 
 		 126 aa  43.9  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.842156  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0061  gas vesicle synthesis protein GvpA  40.74 
 
 		 74 aa  43.5  0.0009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0062  gas vesicle synthesis protein GvpA  40.74 
 
 		 74 aa  43.5  0.0009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0063  gas vesicle synthesis protein GvpA  40.74 
 
 		 74 aa  43.5  0.0009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0704  hypothetical protein  42.22 
 
 		 69 aa  43.5  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0060  gas vesicle synthesis protein GvpA  40.74 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.537884  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4008  gas vesicle synthesis-like protein  40.43 
 
 		 143 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2839  gas vesicle synthesis protein GvpA  44 
 
 		 72 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3382  gas vesicle protein GVPa  45.28 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0355765  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>