16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2366 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_2366  gas vesicle protein GVPa  100 
 
 
142 aa  280  7.000000000000001e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0342  gas vesicle protein GVPa  67.57 
 
 
126 aa  84.7  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.842156  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2825  gas vesicle protein GVPa  59.38 
 
 
75 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3022  gas vesicle protein GVPa  56.72 
 
 
78 aa  77  0.00000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0339  hypothetical protein  48.72 
 
 
181 aa  76.3  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.881514  normal  0.486472 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0071  gas vesicle protein GVPa  53.73 
 
 
230 aa  75.5  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0463018  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1485  gas vesicle protein GVPa  48.61 
 
 
116 aa  66.2  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0249757  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1489  gas vesicle protein GVPa  49.15 
 
 
126 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.510909  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0335  hypothetical protein  54.17 
 
 
138 aa  53.5  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.942024 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3025  gas vesicle protein GVPa  46.94 
 
 
123 aa  52  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.749024  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2369  gas vesicle protein GVPa  32.26 
 
 
201 aa  52  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0339  gas vesicle protein GVPa  40.35 
 
 
152 aa  51.6  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0070  gas vesicle protein GVPa  46.43 
 
 
126 aa  48.9  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.471557  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2828  gas vesicle protein GVPa  40.38 
 
 
121 aa  44.3  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0704  hypothetical protein  45.65 
 
 
69 aa  42  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2408  gas vesicle protein GVPa  38.3 
 
 
85 aa  40.4  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440406  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>