62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4008 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4008  gas vesicle synthesis-like protein  100 
 
 		 143 aa  278  2e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1006  gas vesicle synthesis-like protein  69.93 
 
 		 143 aa  199  9.999999999999999e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4706  gas vesicle protein GVPa  53.6 
 
 		 138 aa  118  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.783958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6855  hypothetical protein  62.37 
 
 		 137 aa  110  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.479937  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2356  gas vesicle protein GVPa  45.32 
 
 		 137 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0939575 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2375  gas vesicle synthesis-like protein  55.56 
 
 		 139 aa  108  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.721458  normal  0.751022 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2381  gas vesicle synthesis-like protein  55.56 
 
 		 139 aa  108  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.528325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2334  gas vesicle synthesis-like protein  55.56 
 
 		 139 aa  108  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3382  gas vesicle protein GVPa  55.24 
 
 		 133 aa  106  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0355765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0327  gas vesicle synthesis protein GvpA  53.62 
 
 		 76 aa  84  7e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.516569 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0326  gas vesicle synthesis protein GvpA  53.62 
 
 		 76 aa  84  7e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.52791 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0328  gas vesicle synthesis protein GvpA  53.62 
 
 		 76 aa  84  7e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.518273 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2374  gas vesicle protein GVPa  58.06 
 
 		 96 aa  80.9  0.000000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1253  gas vesicle synthesis protein GvpA  64.91 
 
 		 72 aa  80.5  0.000000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.13379 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0078  gas vesicle synthesis protein GvpA  66.67 
 
 		 71 aa  80.1  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00750449  normal  0.0121047 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2325  gas vesicle synthesis protein GvpA  64.91 
 
 		 72 aa  79.7  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740835  unclonable  0.0000203995 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0079  gas vesicle synthesis protein GvpA  64.91 
 
 		 71 aa  79.3  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0130989  normal  0.0117948 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3114  gas vesicle protein GVPa  55.74 
 
 		 94 aa  78.6  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1748  gas vesicle synthesis protein GvpA  63.16 
 
 		 72 aa  79.3  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2324  gas vesicle synthesis protein GvpA  61.4 
 
 		 75 aa  79  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0000000112837  hitchhiker  0.000242369 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0334  gas vesicle protein GVPa  57.38 
 
 		 95 aa  77.8  0.00000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0060  gas vesicle synthesis protein GvpA  50 
 
 		 76 aa  77  0.00000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.537884  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0061  gas vesicle synthesis protein GvpA  56.67 
 
 		 74 aa  76.6  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0062  gas vesicle synthesis protein GvpA  56.67 
 
 		 74 aa  76.6  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0063  gas vesicle synthesis protein GvpA  56.67 
 
 		 74 aa  76.6  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2404  gas vesicle protein GVPa  67.31 
 
 		 98 aa  75.5  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0689  gas vesicle synthesis protein GvpA  62.26 
 
 		 68 aa  74.7  0.0000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.021084  normal  0.764349 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0688  gas vesicle synthesis protein GvpA  62.26 
 
 		 68 aa  74.7  0.0000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0200953  normal  0.76733 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1818  gas vesicle synthesis protein GvpA  62.26 
 
 		 68 aa  74.7  0.0000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0025131  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1819  gas vesicle synthesis protein GvpA  62.26 
 
 		 68 aa  74.7  0.0000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00075778  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1821  gas vesicle synthesis protein GvpA  62.26 
 
 		 68 aa  74.7  0.0000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00228865  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1820  gas vesicle synthesis protein GvpA  62.26 
 
 		 68 aa  74.7  0.0000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000245848  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2839  gas vesicle synthesis protein GvpA  57.89 
 
 		 72 aa  73.9  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0686  gas vesicle synthesis protein GvpA  60.38 
 
 		 68 aa  73.6  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0189096  normal  0.509379 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3016  gas vesicle protein GVPa  63.46 
 
 		 71 aa  72.4  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1499  gas vesicle protein GVPa  53.73 
 
 		 76 aa  69.3  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1498  gas vesicle protein GVPa  55.38 
 
 		 75 aa  69.7  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.921273  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3255  gas vesicle synthesis protein GvpA  50 
 
 		 70 aa  68.2  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0851861 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3573  gas vesicle synthesis protein GvpA  50 
 
 		 70 aa  68.2  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.862983  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2323  gas vesicle protein GVPa  61.36 
 
 		 54 aa  62.4  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.0000151045  hitchhiker  0.000256299 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4702  gas vesicle protein GVPa  55.77 
 
 		 114 aa  60.1  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3264  gas vesicle protein GVPa  50.94 
 
 		 104 aa  54.3  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.800769  normal  0.701046 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2379  gas vesicle protein GVPa  56.25 
 
 		 126 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2338  gas vesicle protein GVPa  56.25 
 
 		 126 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2385  gas vesicle protein GVPa  56.25 
 
 		 126 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.14946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3580  gas vesicle protein GVPa  49.06 
 
 		 104 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3386  gas vesicle protein GVPa  40 
 
 		 134 aa  50.8  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.128813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6859  hypothetical protein  50 
 
 		 178 aa  50.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.330028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2405  gas vesicle protein GVPa  49.06 
 
 		 119 aa  48.9  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1262  gas vesicle protein GVPa  42 
 
 		 101 aa  49.3  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.026389  normal  0.71927 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1813  gas vesicle protein GVPa  48 
 
 		 99 aa  48.5  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2351  gas vesicle protein GVPa  51.16 
 
 		 147 aa  48.9  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.152283 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0694  putative gas vesicle synthesis protein  46 
 
 		 97 aa  47.8  0.00006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.783723 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2828  gas vesicle protein GVPa  44.44 
 
 		 121 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3025  gas vesicle protein GVPa  43.48 
 
 		 123 aa  45.4  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.749024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0335  hypothetical protein  40.43 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.942024 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2330  gas vesicle protein GVPa  48.84 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00032613 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0070  gas vesicle protein GVPa  42.55 
 
 		 126 aa  42.7  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.471557  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0075  gas vesicle protein GVPa  48.84 
 
 		 148 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0645865  decreased coverage  0.000500428 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0339  gas vesicle protein GVPa  37.14 
 
 		 152 aa  42  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2335  gas vesicle protein GVPa  50 
 
 		 104 aa  41.2  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00675738 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0071  gas vesicle protein GVPa  37.5 
 
 		 230 aa  40.4  0.009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0463018  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>