57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2356 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2356  gas vesicle protein GVPa  100 
 
 		 137 aa  269  8.000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0939575 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4706  gas vesicle protein GVPa  55.65 
 
 		 138 aa  128  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.783958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6855  hypothetical protein  61.7 
 
 		 137 aa  117  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.479937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1006  gas vesicle synthesis-like protein  48.8 
 
 		 143 aa  111  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4008  gas vesicle synthesis-like protein  45.32 
 
 		 143 aa  111  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2375  gas vesicle synthesis-like protein  44.35 
 
 		 139 aa  102  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.721458  normal  0.751022 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2381  gas vesicle synthesis-like protein  44.35 
 
 		 139 aa  102  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.528325  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3382  gas vesicle protein GVPa  54.46 
 
 		 133 aa  102  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0355765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2334  gas vesicle synthesis-like protein  44.35 
 
 		 139 aa  102  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2374  gas vesicle protein GVPa  56.16 
 
 		 96 aa  84  6e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3114  gas vesicle protein GVPa  49.41 
 
 		 94 aa  82.8  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0334  gas vesicle protein GVPa  61.4 
 
 		 95 aa  78.6  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0060  gas vesicle synthesis protein GvpA  55.88 
 
 		 76 aa  77.8  0.00000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.537884  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0327  gas vesicle synthesis protein GvpA  55 
 
 		 76 aa  75.1  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.516569 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0063  gas vesicle synthesis protein GvpA  61.4 
 
 		 74 aa  75.1  0.0000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0062  gas vesicle synthesis protein GvpA  61.4 
 
 		 74 aa  75.1  0.0000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0061  gas vesicle synthesis protein GvpA  61.4 
 
 		 74 aa  75.1  0.0000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0326  gas vesicle synthesis protein GvpA  55 
 
 		 76 aa  75.1  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.52791 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0328  gas vesicle synthesis protein GvpA  55 
 
 		 76 aa  75.1  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.518273 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0079  gas vesicle synthesis protein GvpA  58.82 
 
 		 71 aa  75.1  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0130989  normal  0.0117948 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2325  gas vesicle synthesis protein GvpA  55.38 
 
 		 72 aa  74.7  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740835  unclonable  0.0000203995 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0078  gas vesicle synthesis protein GvpA  57.35 
 
 		 71 aa  74.7  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00750449  normal  0.0121047 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2839  gas vesicle synthesis protein GvpA  56.92 
 
 		 72 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2324  gas vesicle synthesis protein GvpA  64.81 
 
 		 75 aa  73.2  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0000000112837  hitchhiker  0.000242369 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3016  gas vesicle protein GVPa  62.96 
 
 		 71 aa  73.2  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1253  gas vesicle synthesis protein GvpA  57.14 
 
 		 72 aa  72.4  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.13379 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1819  gas vesicle synthesis protein GvpA  62.26 
 
 		 68 aa  71.6  0.000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00075778  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1821  gas vesicle synthesis protein GvpA  62.26 
 
 		 68 aa  71.6  0.000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00228865  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1820  gas vesicle synthesis protein GvpA  62.26 
 
 		 68 aa  71.6  0.000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000245848  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1818  gas vesicle synthesis protein GvpA  62.26 
 
 		 68 aa  71.6  0.000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0025131  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0689  gas vesicle synthesis protein GvpA  62.26 
 
 		 68 aa  71.6  0.000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.021084  normal  0.764349 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0688  gas vesicle synthesis protein GvpA  62.26 
 
 		 68 aa  71.6  0.000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0200953  normal  0.76733 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1748  gas vesicle synthesis protein GvpA  55.56 
 
 		 72 aa  70.9  0.000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3255  gas vesicle synthesis protein GvpA  59.26 
 
 		 70 aa  70.5  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0851861 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3573  gas vesicle synthesis protein GvpA  59.26 
 
 		 70 aa  70.5  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.862983  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0686  gas vesicle synthesis protein GvpA  60.38 
 
 		 68 aa  70.1  0.000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0189096  normal  0.509379 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2404  gas vesicle protein GVPa  50 
 
 		 98 aa  69.3  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1499  gas vesicle protein GVPa  51.79 
 
 		 76 aa  63.5  0.0000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1498  gas vesicle protein GVPa  48.44 
 
 		 75 aa  63.5  0.0000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.921273  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2323  gas vesicle protein GVPa  53.33 
 
 		 54 aa  56.2  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.0000151045  hitchhiker  0.000256299 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2351  gas vesicle protein GVPa  52.83 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.152283 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2405  gas vesicle protein GVPa  56.82 
 
 		 119 aa  51.2  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6859  hypothetical protein  54.35 
 
 		 178 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.330028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3025  gas vesicle protein GVPa  42.62 
 
 		 123 aa  48.9  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.749024  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3386  gas vesicle protein GVPa  51.92 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.128813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2385  gas vesicle protein GVPa  50 
 
 		 126 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.14946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2338  gas vesicle protein GVPa  50 
 
 		 126 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2379  gas vesicle protein GVPa  50 
 
 		 126 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3580  gas vesicle protein GVPa  42.86 
 
 		 104 aa  47.4  0.00008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4702  gas vesicle protein GVPa  47.06 
 
 		 114 aa  45.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3264  gas vesicle protein GVPa  43.42 
 
 		 104 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.800769  normal  0.701046 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2828  gas vesicle protein GVPa  40.74 
 
 		 121 aa  45.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1262  gas vesicle protein GVPa  42.31 
 
 		 101 aa  43.9  0.0007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.026389  normal  0.71927 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0335  hypothetical protein  41.18 
 
 		 138 aa  42.7  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.942024 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2369  gas vesicle protein GVPa  37.25 
 
 		 201 aa  41.6  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1489  gas vesicle protein GVPa  39.22 
 
 		 126 aa  40.8  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.510909  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0339  gas vesicle protein GVPa  29.59 
 
 		 152 aa  40.4  0.008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>