More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3485 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_2161  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  75.34 
 
 
439 aa  685    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3485  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  100 
 
 
482 aa  976    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0183  putative lipoprotein  68.51 
 
 
435 aa  630  1e-179  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3988  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  71.08 
 
 
409 aa  584  1.0000000000000001e-165  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0573  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  62.59 
 
 
441 aa  570  1e-161  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4081  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  68.87 
 
 
409 aa  566  1e-160  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0412  LysM domain-containing protein  51.18 
 
 
434 aa  403  1e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0717  hypothetical protein  43.49 
 
 
332 aa  233  7.000000000000001e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000000298888  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2300  hypothetical protein  42.41 
 
 
323 aa  223  4e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00744329  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27180  hypothetical protein  42.07 
 
 
323 aa  224  4e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000208157  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2556  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  43.59 
 
 
318 aa  223  8e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000497106  hitchhiker  9.91148e-17 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2070  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  41.08 
 
 
321 aa  219  7.999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00392784  normal  0.0533041 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2270  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.02 
 
 
321 aa  218  1e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0010326  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1584  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  43.48 
 
 
329 aa  218  2e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.310939  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1758  hypothetical protein  43.82 
 
 
424 aa  216  5e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1566  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  43.97 
 
 
387 aa  216  9e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00819943  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2320  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.97 
 
 
325 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00187329  hitchhiker  0.0000416474 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4012  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  40 
 
 
323 aa  212  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000167491  normal  0.572357 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3449  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.61 
 
 
325 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000148197  hitchhiker  0.0000281321 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1762  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  42.12 
 
 
325 aa  211  3e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00000230902  hitchhiker  0.000000000000707546 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23090  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  38.89 
 
 
317 aa  209  7e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00352469  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1763  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.18 
 
 
314 aa  209  7e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1922  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.61 
 
 
325 aa  209  8e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000395353  unclonable  2.80385e-16 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0411  hypothetical protein  40.81 
 
 
314 aa  209  1e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0855  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.73 
 
 
361 aa  208  2e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.840952  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0382  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  39.41 
 
 
347 aa  207  3e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00597114  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0552  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  39.41 
 
 
347 aa  207  3e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.00000000599381  hitchhiker  0.00134587 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0114  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  39.7 
 
 
355 aa  205  1e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0493  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.96 
 
 
362 aa  192  1e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0116  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.65 
 
 
349 aa  191  2.9999999999999997e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.259654  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2289  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG like protein  42.18 
 
 
285 aa  186  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.156844  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2980  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  38.2 
 
 
300 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1662  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.45 
 
 
285 aa  182  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001253  hypothetical protein  39.05 
 
 
308 aa  180  4e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4076  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  39.56 
 
 
292 aa  180  4.999999999999999e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000400018  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2026  hypothetical protein  38.69 
 
 
303 aa  179  1e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000198404  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1006  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.09 
 
 
313 aa  177  4e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000114472  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0969  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.43 
 
 
303 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000011509  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2202  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.27 
 
 
361 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000136827  normal  0.042221 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2572  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.27 
 
 
348 aa  175  1.9999999999999998e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0079  hypothetical protein  35.74 
 
 
306 aa  172  1e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135684  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1662  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  44.6 
 
 
327 aa  172  1e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000134968  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2997  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  38.58 
 
 
282 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05123  hypothetical protein  40.53 
 
 
308 aa  172  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1163  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.8 
 
 
301 aa  170  6e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000106835  normal  0.0179239 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1082  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.11 
 
 
333 aa  169  1e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000431634  normal  0.0168034 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1700  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  43.72 
 
 
333 aa  169  1e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000219984  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0726  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  46.67 
 
 
304 aa  169  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2911  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  38.52 
 
 
284 aa  167  4e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.514235  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0476  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  38.25 
 
 
321 aa  167  4e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000432617  unclonable  0.00000802452 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3103  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.63 
 
 
282 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0971  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.03 
 
 
307 aa  164  3e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1553  hypothetical protein  39.91 
 
 
244 aa  163  5.0000000000000005e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2588  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  39.77 
 
 
339 aa  163  7e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.424492  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01899  conserved protein with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  39.91 
 
 
310 aa  162  1e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0183339  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1666  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  39.91 
 
 
311 aa  162  1e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00191568  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2237  hypothetical protein  36.62 
 
 
309 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.485694  normal  0.208005 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1747  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  39.77 
 
 
354 aa  162  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000920948  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2137  hypothetical protein  36.62 
 
 
309 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2191  hypothetical protein  36.62 
 
 
309 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1853  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  39.77 
 
 
354 aa  162  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000197997  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01888  hypothetical protein  39.91 
 
 
310 aa  162  1e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.014746  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2184  hypothetical protein  36.62 
 
 
309 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.295088  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1430  hypothetical protein  38.97 
 
 
244 aa  161  2e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2350  hypothetical protein  36.62 
 
 
309 aa  161  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00214407  hitchhiker  0.00290758 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3289  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.19 
 
 
307 aa  161  3e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1638  hypothetical protein  39.47 
 
 
307 aa  160  5e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.383508  hitchhiker  0.0042534 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0844  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.38 
 
 
304 aa  160  6e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000408528  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00786  hypothetical protein  38.53 
 
 
306 aa  160  7e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2823  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  38.53 
 
 
306 aa  160  7e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0876  hypothetical protein  38.53 
 
 
306 aa  160  7e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2824  hypothetical protein  38.53 
 
 
306 aa  160  7e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00803  hypothetical protein  38.53 
 
 
306 aa  160  7e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0968  hypothetical protein  38.7 
 
 
304 aa  159  7e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.495532  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0843  hypothetical protein  38.53 
 
 
306 aa  160  7e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2529  hypothetical protein  38.53 
 
 
306 aa  160  7e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.990181  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0889  hypothetical protein  38.53 
 
 
306 aa  160  7e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.479275  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2622  peptidoglycan-binding LysM:ErfK/YbiS/YcfS/YnhG protein  35.77 
 
 
322 aa  159  9e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0580662  normal  0.781551 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3074  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  44.6 
 
 
304 aa  159  1e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000373361  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2272  hypothetical protein  39.47 
 
 
310 aa  159  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000409269  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0968  hypothetical protein  39.47 
 
 
310 aa  159  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000162984  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1134  hypothetical protein  39.47 
 
 
310 aa  159  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000258795  hitchhiker  0.0000968229 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2835  hypothetical protein  39.47 
 
 
311 aa  159  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000168176  normal  0.833391 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1586  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.47 
 
 
284 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0989  hypothetical protein  38.1 
 
 
306 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.800938  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2113  hypothetical protein  39.47 
 
 
310 aa  158  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.00781e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0877  hypothetical protein  38.1 
 
 
306 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0905  hypothetical protein  38.1 
 
 
306 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3091  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40 
 
 
304 aa  158  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000280887  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0935  hypothetical protein  38.26 
 
 
306 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0968  hypothetical protein  38.1 
 
 
306 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0881  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.07 
 
 
304 aa  157  4e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000038242  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3255  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.05 
 
 
305 aa  157  4e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3748  LysM domain-containing protein  39.39 
 
 
304 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1310  hypothetical protein  38.63 
 
 
306 aa  157  5.0000000000000005e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2444  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  42.13 
 
 
340 aa  155  1e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.0013268  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0707  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  41.03 
 
 
304 aa  155  1e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000409779  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2746  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  42.13 
 
 
340 aa  154  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000362064  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3357  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  38.91 
 
 
358 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0930  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  39.48 
 
 
357 aa  153  7e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>