More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3865 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_3865  phosphate transporter  100 
 
 
333 aa  655    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3781  phosphate transporter  96.7 
 
 
333 aa  641    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.843739  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4135  phosphate transporter  83.48 
 
 
333 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0161666  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0389  phosphate transporter, putative  78.08 
 
 
333 aa  538  9.999999999999999e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.214855  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3131  phosphate transporter  77.18 
 
 
333 aa  530  1e-149  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00242659  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0587  phosphate transporter  74.4 
 
 
332 aa  510  1e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.527473  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3585  phosphate transporter  74.17 
 
 
333 aa  496  1e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0121636  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2385  phosphate transporter  55.49 
 
 
332 aa  355  5e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.15597  normal  0.883996 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1646  phosphate transporter  52.29 
 
 
329 aa  348  6e-95  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1485  phosphate transporter  59.21 
 
 
332 aa  347  2e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000164623  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3185  phosphate transporter  54.63 
 
 
336 aa  338  5e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.987096 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0129  phosphate transporter  53.48 
 
 
338 aa  338  5.9999999999999996e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0892  phosphate transporter  55.35 
 
 
334 aa  338  9.999999999999999e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2275  phosphate transporter  57.33 
 
 
337 aa  336  2.9999999999999997e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.265898  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0952  phosphate transporter  54.13 
 
 
336 aa  329  3e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.775195  normal  0.447908 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4358  phosphate transporter  54.97 
 
 
335 aa  328  8e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000836516  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2027  phosphate transporter  51.65 
 
 
333 aa  320  3e-86  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2117  phosphate transporter  53.16 
 
 
332 aa  317  2e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0147275  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1960  phosphate transporter  55.99 
 
 
334 aa  316  4e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2876  phosphate transporter  50.15 
 
 
332 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000456437  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2658  phosphate transporter  51.38 
 
 
332 aa  312  4.999999999999999e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0703  phosphate transporter  52.02 
 
 
335 aa  310  2e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000147408  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0688  phosphate transporter  52.02 
 
 
335 aa  310  2e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000897538  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1237  phosphate transporter  51.74 
 
 
326 aa  310  2.9999999999999997e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2626  phosphate transporter  53.29 
 
 
327 aa  308  5.9999999999999995e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3021  phosphate transporter  49.85 
 
 
332 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0563  phosphate transporter family protein  51.53 
 
 
332 aa  303  2.0000000000000002e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2000  phosphate transporter  49.69 
 
 
335 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0450  phosphate transporter  53.07 
 
 
333 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.275833  normal  0.360764 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0549  phosphate permease  51.23 
 
 
332 aa  303  4.0000000000000003e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1576  phosphate transporter family protein  54.32 
 
 
332 aa  300  3e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000371851  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1614  phosphate transporter family protein  54.32 
 
 
332 aa  300  3e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000923139  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1376  phosphate transporter  54.32 
 
 
332 aa  299  4e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000403006  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1083  phosphate transporter  50 
 
 
336 aa  298  9e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3837  phosphate transporter family protein  54.01 
 
 
332 aa  298  1e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0211808  hitchhiker  0.000000000133014 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2706  phosphate transporter  49.84 
 
 
336 aa  298  1e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.906266  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3358  phosphate transporter  49.84 
 
 
336 aa  298  1e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.450825 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1508  phosphate transporter family protein  54.32 
 
 
332 aa  297  2e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0297003  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1361  phosphate transporter family protein  54.32 
 
 
332 aa  297  2e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000679914  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1335  phosphate transporter  54.32 
 
 
332 aa  297  2e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000375914  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1334  phosphate transporter  54.32 
 
 
332 aa  297  2e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000421375  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1471  phosphate transporter family protein  54.32 
 
 
332 aa  297  2e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.466845  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1545  phosphate transporter family protein  54.32 
 
 
332 aa  297  2e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000352137 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3015  putative low-affinity phosphate transporter lipoprotein transmembrane  48.31 
 
 
336 aa  295  5e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.360288  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1406  phosphate transporter  48.11 
 
 
336 aa  295  6e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.596183  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1178  phosphate transporter  53.09 
 
 
332 aa  295  7e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010062  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1973  phosphate transporter  49.06 
 
 
336 aa  295  9e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137015  normal  0.10663 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1777  phosphate transporter  47.8 
 
 
336 aa  293  2e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0043  phosphate transporter  48.9 
 
 
331 aa  293  2e-78  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1805  phosphate transporter  47.8 
 
 
336 aa  293  2e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.3367  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3761  putative low-affinity phosphate transport protein  47.69 
 
 
336 aa  293  3e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.253043  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1188  phosphate transporter  47.6 
 
 
336 aa  292  5e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.198901  normal  0.0620893 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1249  phosphate transporter  47.6 
 
 
336 aa  292  5e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0366515  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0843  phosphate transporter  46.39 
 
 
332 aa  292  6e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.240506  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4384  phosphate transporter  48.06 
 
 
352 aa  292  6e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.622735  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5168  phosphate transporter  47.48 
 
 
336 aa  292  7e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0592  phosphate transporter  47.48 
 
 
336 aa  291  8e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0678  phosphate transporter  48.62 
 
 
336 aa  291  8e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0326  phosphate transporter  49.11 
 
 
334 aa  291  1e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000822129 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1123  phosphate transporter  47.47 
 
 
335 aa  291  1e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000161634  normal  0.936007 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1470  phosphate transporter  47.09 
 
 
336 aa  291  1e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4361  phosphate transporter  47.76 
 
 
352 aa  290  3e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1678  phosphate transporter  49.53 
 
 
334 aa  290  3e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.397083  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2552  phosphate transporter  48.33 
 
 
354 aa  289  6e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.729981  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4378  phosphate transporter  46.65 
 
 
353 aa  288  6e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0749407 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0317  phosphate transporter family protein  51.36 
 
 
336 aa  288  7e-77  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.178517  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2499  phosphate transporter  48.46 
 
 
346 aa  288  1e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.617445  normal  0.993356 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2031  phosphate transporter  50.16 
 
 
334 aa  288  1e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.357489  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0589  phosphate transporter  51.44 
 
 
385 aa  288  1e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4228  phosphate transporter  48.02 
 
 
352 aa  287  1e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3421  phosphate transporter  50.31 
 
 
337 aa  288  1e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1313  inorganic phosphate transporter  45.91 
 
 
336 aa  287  2e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0043  phosphate transporter  47.4 
 
 
331 aa  287  2e-76  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1748  phosphate transporter  51.4 
 
 
332 aa  286  2e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0493657 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2887  phosphate transporter  48.01 
 
 
370 aa  286  2.9999999999999996e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1398  phosphate transporter family protein  50 
 
 
336 aa  286  4e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.476301  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2284  phosphate transporter family protein  50 
 
 
336 aa  286  4e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2410  phosphate transporter family protein  50 
 
 
354 aa  286  4e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.201685  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2185  phosphate transporter family protein  50 
 
 
354 aa  286  4e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.552455  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2245  phosphate transporter family protein  50 
 
 
336 aa  286  4e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.513907  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1161  phosphate transporter family protein  50 
 
 
336 aa  286  4e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1888  phosphate transporter family protein  50 
 
 
336 aa  286  4e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.527303  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2217  phosphate transporter  49.22 
 
 
427 aa  286  4e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.493936 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0008  phosphate transporter family protein  50 
 
 
336 aa  286  4e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0756499  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0241  phosphate transporter  50.9 
 
 
334 aa  285  9e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0871  phosphate transporter  50.94 
 
 
330 aa  284  1.0000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.217038  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5449  phosphate transporter  49.38 
 
 
386 aa  285  1.0000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0370554  normal  0.318098 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1891  phosphate transporter  48.01 
 
 
336 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00123921  hitchhiker  0.0000000789991 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6211  phosphate transporter  48.01 
 
 
336 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.450178  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1868  phosphate transporter  48.01 
 
 
336 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2523  phosphate transporter  49.53 
 
 
338 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0983692  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0283  phosphate transporter  48.59 
 
 
334 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0849813 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1881  phosphate transporter  47.09 
 
 
336 aa  283  3.0000000000000004e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2817  phosphate transporter  49.24 
 
 
334 aa  282  7.000000000000001e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.011171 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2335  phosphate transporter  48.6 
 
 
336 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.90978  normal  0.624995 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1399  phosphate transporter  45.95 
 
 
336 aa  280  2e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1687  phosphate transporter  46.79 
 
 
336 aa  280  2e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2946  phosphate transporter  48.92 
 
 
334 aa  278  6e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.747547  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0917  phosphate transporter  48.68 
 
 
336 aa  277  2e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  normal  0.295731 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0300  phosphate transporter  52.63 
 
 
332 aa  277  2e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.942291  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>