252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4211 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4211  transposase, IS4  100 
 
 		 310 aa  610  1e-173  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0300  transposase, IS4  72.16 
 
 		 409 aa  389  1e-107  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.563968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0672  transposase, IS4  72.16 
 
 		 433 aa  390  1e-107  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.093907 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1189  transposase, IS4  72.16 
 
 		 433 aa  390  1e-107  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.944159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1776  transposase, IS4  72.16 
 
 		 433 aa  390  1e-107  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.248758 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1962  transposase, IS4  72.16 
 
 		 433 aa  390  1e-107  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.762246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2052  transposase, IS4  72.16 
 
 		 433 aa  390  1e-107  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.460189  normal  0.19863 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2330  transposase, IS4  72.16 
 
 		 433 aa  390  1e-107  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.886555  normal  0.852173 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2481  transposase, IS4  72.16 
 
 		 433 aa  390  1e-107  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.650246  normal  0.0882495 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2704  transposase, IS4  72.16 
 
 		 433 aa  390  1e-107  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.789983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2799  transposase, IS4  72.16 
 
 		 433 aa  390  1e-107  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2941  transposase, IS4  72.16 
 
 		 433 aa  390  1e-107  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3313  transposase, IS4  72.16 
 
 		 433 aa  390  1e-107  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.10941 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4115  transposase, IS4  72.16 
 
 		 433 aa  390  1e-107  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4218  transposase, IS4  72.16 
 
 		 433 aa  390  1e-107  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.378092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4220  transposase, IS4  72.16 
 
 		 433 aa  390  1e-107  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.537293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0994  transposase, IS4 family protein  39.26 
 
 		 395 aa  152  8.999999999999999e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0392  transposase, IS4  40.08 
 
 		 390 aa  142  7e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1119  transposase, IS4  40.08 
 
 		 390 aa  142  7e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2121  transposase, IS4  40.08 
 
 		 390 aa  142  7e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.682362 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0122  transposase, IS4  38.49 
 
 		 396 aa  139  8.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2708  transposase, IS4  38.49 
 
 		 396 aa  139  8.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2712  transposase, IS4  38.49 
 
 		 396 aa  139  8.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4067  transposase, IS4  38.49 
 
 		 396 aa  139  8.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4155  transposase, IS4  38.49 
 
 		 396 aa  139  8.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.915026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3990  transposase, IS4  38.49 
 
 		 396 aa  138  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5320  hypothetical protein  38.35 
 
 		 437 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.621577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1108  transposase, IS4  36.11 
 
 		 404 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.280026  normal  0.277743 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2810  transposase IS4 family protein  35.77 
 
 		 395 aa  122  5e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6377  transposase IS4 family protein  35.38 
 
 		 395 aa  119  6e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.222017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5311  putative transposase  34.77 
 
 		 415 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3073  transposase IS4 family protein  35.56 
 
 		 367 aa  109  6e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4120  transposase, IS4  31.37 
 
 		 390 aa  99  9e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0626  transposase IS4 family protein  30.91 
 
 		 366 aa  97.4  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1183  transposase IS4 family protein  30.91 
 
 		 366 aa  97.4  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0292  transposase IS4 family protein  30.91 
 
 		 366 aa  97.4  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3614  transposase IS4 family protein  30.91 
 
 		 366 aa  97.4  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4179  transposase IS4 family protein  30.91 
 
 		 366 aa  97.4  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0594  transposase IS4 family protein  30.91 
 
 		 366 aa  97.4  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4156  transposase IS4 family protein  30.91 
 
 		 366 aa  97.4  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0550  transposase IS4 family protein  30.91 
 
 		 366 aa  97.4  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0621  transposase IS4 family protein  30.91 
 
 		 366 aa  97.4  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.232742 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1595  transposase IS4 family protein  30.91 
 
 		 366 aa  97.4  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.137693 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1656  transposase IS4 family protein  30.91 
 
 		 366 aa  97.4  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.882664  normal  0.0664777 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01923  transposase  31.34 
 
 		 367 aa  94  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3805  transposase IS4 family protein  29.44 
 
 		 372 aa  90.9  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0486  transposase IS4 family protein  29.03 
 
 		 372 aa  90.5  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3151  transposase IS4 family protein  29.03 
 
 		 372 aa  90.5  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.683111  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1595  transposase IS4 family protein  33.05 
 
 		 483 aa  89.7  5e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1061  ISPg6, transposase  29.18 
 
 		 362 aa  89  1e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.179104 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2703  transposase IS4 family protein  31.98 
 
 		 381 aa  88.2  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3781  transposase IS4 family protein  29.44 
 
 		 372 aa  87.8  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2901  transposase IS4 family protein  31.98 
 
 		 381 aa  88.2  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.180142  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0027  transposase IS4 family protein  31.98 
 
 		 381 aa  88.2  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5660  transposase ISAs1 family protein  27.64 
 
 		 333 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.315532 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0593  transposase IS4 family protein  30.08 
 
 		 287 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.778481 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1950  transposase, IS4  28.43 
 
 		 401 aa  82.8  0.000000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.143043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2467  transposase, IS4  28.43 
 
 		 401 aa  82.8  0.000000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0435731 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3866  transposase IS4 family protein  29.27 
 
 		 369 aa  82.4  0.000000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000448202 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0603  transposase IS4 family protein  29.27 
 
 		 369 aa  82.4  0.000000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0296  transposase IS4 family protein  29.27 
 
 		 369 aa  82.4  0.000000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0443  transposase IS4 family protein  29.27 
 
 		 369 aa  82.4  0.000000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0569  transposase IS4 family protein  29.27 
 
 		 369 aa  82.4  0.000000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.228181  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0572  transposase IS4 family protein  29.27 
 
 		 369 aa  82.4  0.000000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0597  transposase IS4 family protein  29.27 
 
 		 369 aa  82.4  0.000000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.818291 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2564  transposase IS4 family protein  29.27 
 
 		 369 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000012164  hitchhiker  0.000000684165 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4172  transposase IS4 family protein  29.27 
 
 		 369 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3256  transposase IS4 family protein  29.27 
 
 		 369 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0156341 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3606  transposase IS4 family protein  29.27 
 
 		 369 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3220  transposase IS4 family protein  29.27 
 
 		 369 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3592  transposase IS4 family protein  29.27 
 
 		 369 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3394  transposase IS4 family protein  29.27 
 
 		 369 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.750621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1271  transposase IS4 family protein  29.27 
 
 		 369 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00393062 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1300  transposase IS4 family protein  29.27 
 
 		 369 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.406544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1398  transposase IS4 family protein  29.27 
 
 		 369 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0101  transposase IS4 family protein  29.27 
 
 		 369 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2329  transposase IS4 family protein  29.27 
 
 		 369 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0102713  hitchhiker  0.000965394 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4087  transposase IS4 family protein  29.27 
 
 		 369 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0643  transposase IS4 family protein  29.27 
 
 		 369 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1228  transposase IS4 family protein  29.27 
 
 		 369 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000142924 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0766  transposase IS4 family protein  29.27 
 
 		 369 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.799607  normal  0.310535 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4396  transposase IS4 family protein  29.27 
 
 		 369 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000348998  normal  0.0139807 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3014  transposase IS4 family protein  29.27 
 
 		 369 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.137978 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2609  transposase IS4 family protein  29.27 
 
 		 369 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.720943  hitchhiker  0.00290124 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0172  transposase IS4 family protein  29.27 
 
 		 369 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4106  transposase IS4 family protein  29.27 
 
 		 369 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0548  transposase IS4 family protein  29.27 
 
 		 369 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0564  transposase IS4 family protein  29.27 
 
 		 369 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.561014  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0630  transposase IS4 family protein  29.27 
 
 		 369 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0595  transposase IS4 family protein  29.27 
 
 		 369 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2785  transposase IS4 family protein  29.27 
 
 		 369 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.738177  normal  0.743727 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0098  transposase IS4 family protein  29.27 
 
 		 369 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0170  transposase IS4 family protein  29.27 
 
 		 369 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0589  transposase IS4 family protein  29.27 
 
 		 369 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.900163 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0994  transposase IS4 family protein  29.27 
 
 		 369 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.416705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5528  transposase ISAs1 family protein  24.92 
 
 		 377 aa  80.9  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0898729 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3911  transposase ISAs1 family protein  24.92 
 
 		 377 aa  80.9  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0767  transposase, IS4 family protein  27.6 
 
 		 374 aa  80.5  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.179756 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5802  transposase ISAs1 family protein  24.92 
 
 		 377 aa  80.9  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0805  transposase, IS4 family protein  27.2 
 
 		 374 aa  80.5  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0028853 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>