20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2023 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2023  hypothetical protein  100 
 
 		 467 aa  924    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.898641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1013  hypothetical protein  51.66 
 
 		 451 aa  377  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0868  hypothetical protein  38.44 
 
 		 497 aa  239  1e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0851  hypothetical protein  38.44 
 
 		 429 aa  239  1e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0857  hypothetical protein  38.1 
 
 		 497 aa  238  2e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.610845  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2598  hypothetical protein  44.05 
 
 		 440 aa  218  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00331203  normal  0.0245461 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5887  hypothetical protein  38.01 
 
 		 430 aa  212  1e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67395 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1052  hypothetical protein  37.43 
 
 		 371 aa  177  4e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.244959  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3339  hypothetical protein  34.96 
 
 		 245 aa  92.4  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0934778  normal  0.651768 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3599  hypothetical protein  32.63 
 
 		 256 aa  85.9  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0516  hypothetical protein  35.06 
 
 		 250 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1141  hypothetical protein  38.27 
 
 		 258 aa  77.8  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.586693  normal  0.011116 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0152  hypothetical protein  32.77 
 
 		 271 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0298803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10185  hypothetical protein  31.98 
 
 		 249 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0151  hypothetical protein  33.73 
 
 		 249 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0142  hypothetical protein  33.73 
 
 		 249 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.413859  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0132  hypothetical protein  33.13 
 
 		 249 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410301  normal  0.411543 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1118  hypothetical protein  30.69 
 
 		 276 aa  64.7  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00125104  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0746  hypothetical protein  31.87 
 
 		 273 aa  57.8  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.981571  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0094  hypothetical protein  28.71 
 
 		 285 aa  47.8  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000060167  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>