19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1083 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1083  hypothetical protein  100 
 
 		 422 aa  806    Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000423957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3976  hypothetical protein  56.5 
 
 		 427 aa  371  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.667235  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1492  hypothetical protein  54.41 
 
 		 398 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.113639  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0488  hypothetical protein  59.04 
 
 		 427 aa  353  2e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0113931 
 
 
-
 
NC_003296  RS03693  hypothetical protein  48.35 
 
 		 416 aa  295  1e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.657787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0539  hypothetical protein  45.86 
 
 		 412 aa  254  2.0000000000000002e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3862  hypothetical protein  40.55 
 
 		 402 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2870  hypothetical protein  38.06 
 
 		 405 aa  173  3.9999999999999995e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.628183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2801  hypothetical protein  38.35 
 
 		 405 aa  169  6e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.936301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0169  hypothetical protein  37.54 
 
 		 466 aa  122  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0630  hypothetical protein  29.75 
 
 		 414 aa  107  5e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0870  hypothetical protein  32.93 
 
 		 389 aa  99.4  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.536869  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2670  hypothetical protein  30.21 
 
 		 402 aa  71.2  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2613  hypothetical protein  27.61 
 
 		 480 aa  70.1  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0259384  normal  0.0522719 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5501  hypothetical protein  27.19 
 
 		 465 aa  67  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000679714  hitchhiker  0.00404063 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5098  hypothetical protein  30.07 
 
 		 464 aa  59.3  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0121004  normal  0.708615 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0301  hypothetical protein  24.69 
 
 		 388 aa  57  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1179  hypothetical protein  24.14 
 
 		 398 aa  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1073  hypothetical protein  30.82 
 
 		 435 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>