More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0264 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0264  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  100 
 
 		 332 aa  650    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.825688 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6571  alcohol dehydrogenase zinc-binding type 2  77.75 
 
 		 358 aa  523  1e-147  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2709  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  68.28 
 
 		 334 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3073  alcohol dehydrogenase  71.08 
 
 		 333 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.341638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4103  putative alcohol dehydrogenase  70.69 
 
 		 332 aa  429  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.409258  normal  0.240324 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11890  alcohol dehydrogenase adhA  65.18 
 
 		 346 aa  429  1e-119  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.594038 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0343  alcohol dehydrogenase  65.76 
 
 		 333 aa  416  9.999999999999999e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0138  alcohol dehydrogenase  64.58 
 
 		 337 aa  411  1e-114  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3343  alcohol dehydrogenase  68.28 
 
 		 332 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0866379 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1124  alcohol dehydrogenase  65.06 
 
 		 338 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1096  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  65.06 
 
 		 338 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59136  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1113  alcohol dehydrogenase  65.06 
 
 		 338 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2022  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  65.66 
 
 		 332 aa  393  1e-108  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000478739  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1805  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  63.03 
 
 		 332 aa  386  1e-106  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.352435  normal  0.0674921 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3529  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  61.18 
 
 		 323 aa  375  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1330  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  54.82 
 
 		 380 aa  371  1e-102  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1535  zinc-binding alcohol dehydrogenase  52.11 
 
 		 348 aa  355  6.999999999999999e-97  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0829  alcohol dehydrogenase  51.06 
 
 		 332 aa  337  9.999999999999999e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1192  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  52.57 
 
 		 332 aa  328  9e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0121  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  52.4 
 
 		 338 aa  316  4e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0056  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  53.75 
 
 		 329 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1418  zinc-binding alcohol dehydrogenase  54.19 
 
 		 327 aa  311  7.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2529  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  54.79 
 
 		 327 aa  311  7.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.199316  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0046  alcohol dehydrogenase zinc-binding type 2  52.25 
 
 		 336 aa  311  1e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.173418  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0116  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  51.81 
 
 		 327 aa  309  2.9999999999999997e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2088  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  52.35 
 
 		 335 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1744  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  52.35 
 
 		 335 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0255685 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0778  alcohol dehydrogenase  49.85 
 
 		 333 aa  305  7e-82  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2442  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  54.01 
 
 		 327 aa  304  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0303  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  46.36 
 
 		 332 aa  301  8.000000000000001e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4206  alcohol dehydrogenase  52.66 
 
 		 327 aa  301  1e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.773596  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00880  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  52.35 
 
 		 327 aa  299  4e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2439  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  49.38 
 
 		 332 aa  299  5e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00520029 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1844  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  50.78 
 
 		 328 aa  298  6e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.364019  normal  0.792239 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4279  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  52.5 
 
 		 329 aa  297  2e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0922746 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3850  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  48.29 
 
 		 324 aa  295  5e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6316  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  50.62 
 
 		 328 aa  295  1e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4437  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  50.94 
 
 		 336 aa  295  1e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4570  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  50.94 
 
 		 336 aa  295  1e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0690283  normal  0.180174 
 
 
-
 
NC_004310  BR1061  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  47.9 
 
 		 327 aa  293  2e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.215754  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1026  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  47.9 
 
 		 327 aa  293  2e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1412  alcohol dehydrogenase  49.7 
 
 		 338 aa  292  4e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.498942 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3811  alcohol dehydrogenase  51.88 
 
 		 329 aa  292  6e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.367901  normal  0.601812 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0573  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  50.16 
 
 		 330 aa  291  9e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.526868  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5905  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  51.56 
 
 		 329 aa  291  1e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.22496 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0909  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  49.53 
 
 		 328 aa  291  1e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.543563  normal  0.200442 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4129  alcohol dehydrogenase zinc-binding type 2  53.13 
 
 		 328 aa  288  7e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140099 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2263  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  48.75 
 
 		 328 aa  286  2.9999999999999996e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4710  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  51.6 
 
 		 331 aa  286  4e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.525688  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5774  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  51.59 
 
 		 328 aa  286  4e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5710  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  45.45 
 
 		 328 aa  285  5e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1505  alcohol dehydrogenase-like oxidoreductase protein  52.68 
 
 		 334 aa  285  5.999999999999999e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3463  alcohol dehydrogenase  49.7 
 
 		 334 aa  285  8e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5373  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  50.6 
 
 		 331 aa  285  9e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1118  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  50.78 
 
 		 329 aa  285  1.0000000000000001e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.439125 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1937  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  49.67 
 
 		 344 aa  283  2.0000000000000002e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.601892  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3411  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  48.8 
 
 		 341 aa  281  8.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0749603  normal  0.0972256 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3003  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  47.17 
 
 		 347 aa  281  9e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.410653  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0378  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  48.2 
 
 		 327 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474885  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0459  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  52.68 
 
 		 328 aa  280  2e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1916  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  46.41 
 
 		 327 aa  280  4e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.317656  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4482  alcohol dehydrogenase  44.74 
 
 		 328 aa  277  1e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2010  alcohol dehydrogenase zinc-binding type 2  49.04 
 
 		 327 aa  276  3e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2449  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  52.37 
 
 		 331 aa  275  7e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.185569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1426  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  48.28 
 
 		 332 aa  273  2.0000000000000002e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2558  hypothetical protein  43.22 
 
 		 328 aa  273  3e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2605  putative oxidoreductase  52.05 
 
 		 328 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1333  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  52.05 
 
 		 328 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0163  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  52.05 
 
 		 328 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1018  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  52.05 
 
 		 328 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2748  putative oxidoreductase  52.05 
 
 		 328 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.186396  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0189  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  52.05 
 
 		 328 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2413  hypothetical protein  42.59 
 
 		 328 aa  271  1e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5755  putative alcohol dehydrogenase  47.6 
 
 		 329 aa  271  2e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.667662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2296  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  48.07 
 
 		 345 aa  265  1e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0277676  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2299  alcohol dehydrogenase  46.48 
 
 		 334 aa  264  1e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.795546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1201  putative alcohol dehydrogenase-like oxidoreductase protein  46.89 
 
 		 329 aa  258  9e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478337  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0775  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  44.54 
 
 		 342 aa  257  2e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0630  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  39.88 
 
 		 344 aa  252  5.000000000000001e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0165  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  49.3 
 
 		 304 aa  252  7e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0426  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  46.71 
 
 		 327 aa  252  7e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.921896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2614  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  46.73 
 
 		 327 aa  252  8.000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.988218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0352  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.92 
 
 		 338 aa  241  9e-63  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1084  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  43.69 
 
 		 342 aa  232  6e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.31  normal  0.438887 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6106  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  46.71 
 
 		 326 aa  231  1e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0306533 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5387  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  45.14 
 
 		 326 aa  222  7e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07960  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  38.62 
 
 		 342 aa  206  6e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3130  putative propanol-preferring alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  39.09 
 
 		 341 aa  200  3e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.320516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3540  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.54 
 
 		 337 aa  196  3e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6215  alcohol dehydrogenase  38.89 
 
 		 342 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.508121  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71630  alcohol dehydrogenase  38.34 
 
 		 342 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.689289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0428  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  38.48 
 
 		 341 aa  195  9e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.364327  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1193  alcohol dehydrogenase  34.77 
 
 		 344 aa  195  9e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2784  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  38.79 
 
 		 341 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95808  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1046  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  38.79 
 
 		 341 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3322  alcohol dehydrogenase  35.29 
 
 		 338 aa  194  2e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.596213  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0203  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  36.09 
 
 		 344 aa  193  3e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2868  alcohol dehydrogenase  37.23 
 
 		 342 aa  193  3e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0455356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2642  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  38.48 
 
 		 357 aa  193  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0311111  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1872  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  38.46 
 
 		 341 aa  193  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>