69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0090 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_0090  hypothetical protein  100 
 
 
304 aa  600  1.0000000000000001e-171  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7214  sulfotransferase  43.99 
 
 
350 aa  204  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1380  sulfotransferase  46.81 
 
 
303 aa  191  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0376199  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4937  sulfotransferase  37.08 
 
 
311 aa  182  5.0000000000000004e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.202416  normal  0.410057 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2395  sulfotransferase  44.26 
 
 
311 aa  181  1e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.009967  normal  0.0858519 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4033  putative deacetylase sulfotransferase  38.41 
 
 
328 aa  180  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180689  normal  0.0350502 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4384  sulfotransferase  38.87 
 
 
316 aa  171  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.754558  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2236  sulfotransferase  40.25 
 
 
327 aa  139  4.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.410983  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0327  sulfotransferase  26.14 
 
 
309 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.866715 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4269  sulfotransferase  30.64 
 
 
338 aa  102  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.19629 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1765  sulfotransferase  26.97 
 
 
312 aa  98.6  1e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.968461  normal  0.0845328 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3798  sulfotransferase  27.2 
 
 
306 aa  93.6  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.274052 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0328  sulfotransferase  24.47 
 
 
303 aa  88.2  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1936  sulfotransferase  33.07 
 
 
295 aa  89  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.412049  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1953  sulfotransferase  28.63 
 
 
288 aa  86.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.298171 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0891  sulfotransferase  25.37 
 
 
298 aa  86.3  5e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.229512  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1971  hypothetical protein  29.39 
 
 
324 aa  85.9  7e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.987274  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1766  sulfotransferase  26.02 
 
 
300 aa  85.5  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.805148  normal  0.0849812 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4202  sulfotransferase  21.65 
 
 
288 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5381  sulfotransferase  27.69 
 
 
281 aa  83.2  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4075  sulfotransferase  31.96 
 
 
260 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0470564  normal  0.231356 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0638  sulfotransferase  25.97 
 
 
308 aa  81.6  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6521  sulfotransferase domain protein  27.87 
 
 
288 aa  80.9  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3846  putative deacetylase sulfotransferase  31.62 
 
 
260 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4005  sulfotransferase  37.93 
 
 
256 aa  79.3  0.00000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1095  sulfotransferase  26.76 
 
 
316 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01341  hypothetical protein  27.76 
 
 
272 aa  77.8  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1817  sulfotransferase domain protein  27.71 
 
 
320 aa  77  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1494  sulfotransferase  27.71 
 
 
320 aa  77  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.750776  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1837  sulfotransferase  33.17 
 
 
304 aa  75.9  0.0000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.786413  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1358  sulfotransferase  31.33 
 
 
247 aa  75.9  0.0000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1012  sulfotransferase  35.71 
 
 
289 aa  74.7  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1946  sulfotransferase  24.33 
 
 
285 aa  73.2  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.497008 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2859  sulfotransferase  29.33 
 
 
832 aa  73.2  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.398491 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2863  sulfotransferase  28.65 
 
 
623 aa  72.8  0.000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.211639  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4200  sulfotransferase  21.34 
 
 
289 aa  72.4  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.986754 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1828  sulfotransferase  31.2 
 
 
300 aa  71.2  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.436215  normal  0.012003 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3141  sulfotransferase  35.52 
 
 
284 aa  71.6  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138672  normal  0.540594 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3100  sulfotransferase  27.59 
 
 
252 aa  70.9  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4735  sulfotransferase  23.33 
 
 
273 aa  69.7  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1419  sulfotransferase  25.11 
 
 
295 aa  68.2  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520974  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4203  sulfotransferase  21.14 
 
 
293 aa  65.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1180  sulfotransferase  25.76 
 
 
271 aa  65.1  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.572064  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0946  sulfotransferase  31.72 
 
 
293 aa  64.7  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.186902  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3309  sulfotransferase  24.19 
 
 
253 aa  64.3  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.816579  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0722  sulfotransferase  27.16 
 
 
235 aa  64.3  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0351676  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  25.93 
 
 
681 aa  63.9  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  22.64 
 
 
676 aa  63.2  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3772  sulfotransferase  22.41 
 
 
292 aa  62.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.16227  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3720  sulfotransferase  22.41 
 
 
292 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3970  sulfotransferase  34.06 
 
 
293 aa  62.4  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0330664  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0128  hypothetical protein  24.15 
 
 
271 aa  62  0.00000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.044474  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8593  putative deacetylase sulfotransferase  34.87 
 
 
285 aa  62  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4576  sulfotransferase  33.78 
 
 
279 aa  61.6  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302501  normal  0.723483 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0120  sulfotransferase  20.33 
 
 
281 aa  61.6  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520974  normal  0.327991 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4099  sulfotransferase  19.74 
 
 
294 aa  59.7  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.215935 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3223  hypothetical protein  30.61 
 
 
260 aa  59.7  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0426372  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4736  sulfotransferase  24.24 
 
 
274 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0561  sulfotransferase  21.49 
 
 
275 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.693676 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4767  sulfotransferase  20.95 
 
 
682 aa  52.4  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.287127 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0282  hypothetical protein  30.83 
 
 
289 aa  52  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.497354  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0166  sulfotransferase  19.12 
 
 
295 aa  51.6  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000309117 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  22.76 
 
 
887 aa  50.4  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2009  sulfotransferase  26.53 
 
 
285 aa  49.3  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0778  sulfotransferase  28.46 
 
 
302 aa  49.3  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1310  hypothetical protein  31.87 
 
 
292 aa  46.2  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0329016  normal  0.0607944 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2764  hypothetical protein  20.33 
 
 
282 aa  45.8  0.0009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.162315  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3864  sulfotransferase  24.17 
 
 
259 aa  45.4  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.752029  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2900  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
538 aa  42.4  0.009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>