10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0080 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0080  putative ATP/GTP binding protein  100 
 
 		 131 aa  260  4.999999999999999e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4630  TIR protein  30.11 
 
 		 291 aa  52  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.788158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2632  hypothetical protein  25 
 
 		 292 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.801014 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3804  TIR protein  28.12 
 
 		 374 aa  44.7  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.213149  normal  0.0124229 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2375  hypothetical protein  24.19 
 
 		 303 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000173875  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1565  restriction endonuclease  25.78 
 
 		 290 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.380893 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0257  hypothetical protein  30.99 
 
 		 404 aa  41.2  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.32081  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3012  hypothetical protein  31.91 
 
 		 314 aa  40.4  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3920  helix-turn-helix, AraC type  25.38 
 
 		 367 aa  40.4  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.597723 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1808  TIR protein  37.84 
 
 		 500 aa  40  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211372 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>