16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0180 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0180  membrane protein  100 
 
 
380 aa  763  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  4.62081e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1332  hypothetical protein  67.93 
 
 
374 aa  505  1e-142  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.13452  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06390  hypothetical protein  50.13 
 
 
395 aa  370  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2325  hypothetical protein  51.69 
 
 
381 aa  343  3e-93  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.655913  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0327  hypothetical protein  48.95 
 
 
384 aa  331  1e-89  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1716  hypothetical protein  46.33 
 
 
379 aa  305  1e-81  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1392  nucleoside recognition domain-containing protein  24.62 
 
 
463 aa  50.8  3e-05  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1037  nucleoside recognition  21.35 
 
 
452 aa  48.9  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2790  nucleoside recognition domain-containing protein  23.04 
 
 
451 aa  47.8  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.727752  normal  0.835537 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3024  nucleoside recognition domain-containing protein  26.11 
 
 
451 aa  48.1  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.86222  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1012  nucleoside recognition domain-containing protein  26.11 
 
 
450 aa  47  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2910  nucleoside recognition domain-containing protein  25.24 
 
 
449 aa  45.8  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  2.09711e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3353  nucleoside recognition domain-containing protein  22.78 
 
 
461 aa  45.1  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.854  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0994  hypothetical protein  25.54 
 
 
452 aa  45.1  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2588  nucleoside recognition domain-containing protein  25.54 
 
 
449 aa  44.3  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  3.62431e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1950  nucleoside recognition domain-containing protein  23.53 
 
 
435 aa  43.5  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.113243  normal  0.0269854 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>