16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0180 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0180  membrane protein  100 
 
 		 380 aa  763    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00000462081  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1332  hypothetical protein  67.93 
 
 		 374 aa  505  9.999999999999999e-143  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.13452  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06390  hypothetical protein  50.13 
 
 		 395 aa  370  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2325  hypothetical protein  51.69 
 
 		 381 aa  343  2.9999999999999997e-93  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.655913  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0327  hypothetical protein  48.95 
 
 		 384 aa  331  1e-89  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1716  hypothetical protein  46.33 
 
 		 379 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1392  nucleoside recognition domain-containing protein  24.62 
 
 		 463 aa  50.8  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1037  nucleoside recognition  21.35 
 
 		 452 aa  48.9  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2790  nucleoside recognition domain-containing protein  23.04 
 
 		 451 aa  47.8  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.727752  normal  0.835537 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3024  nucleoside recognition domain-containing protein  26.11 
 
 		 451 aa  48.1  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.86222  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1012  nucleoside recognition domain-containing protein  26.11 
 
 		 450 aa  47  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2910  nucleoside recognition domain-containing protein  25.24 
 
 		 449 aa  45.8  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000209711  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0994  hypothetical protein  25.54 
 
 		 452 aa  45.1  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3353  nucleoside recognition domain-containing protein  22.78 
 
 		 461 aa  45.1  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2588  nucleoside recognition domain-containing protein  25.54 
 
 		 449 aa  44.3  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000362431  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1950  nucleoside recognition domain-containing protein  23.53 
 
 		 435 aa  43.5  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.113243  normal  0.0269854 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>