122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_1817 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_1817  electron transport complex protein RnfG  100 
 
 
206 aa  425  1e-118  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0386367  decreased coverage  0.000324023 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01601  electron transport complex protein RnfG  77.18 
 
 
206 aa  337  1e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00338935  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1998  electron transport complex protein RnfG  77.18 
 
 
206 aa  337  1e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0210205  normal  0.220533 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01591  hypothetical protein  77.18 
 
 
206 aa  337  1e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00493917  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1568  electron transport complex protein RnfG  77.18 
 
 
206 aa  336  2e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.172689  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1565  electron transport complex protein RnfG  76.7 
 
 
206 aa  333  9e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.896563  normal  0.099042 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1719  electron transport complex protein RnfG  76.7 
 
 
206 aa  333  9e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.275661  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1887  electron transport complex protein RnfG  76.7 
 
 
206 aa  333  9e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.169724  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2010  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  76.21 
 
 
206 aa  333  1e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00233582  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1839  electron transport complex protein RnfG  76.21 
 
 
206 aa  333  1e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00239547  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1820  electron transport complex protein RnfG  76.21 
 
 
206 aa  333  1e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.953623  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1625  electron transport complex protein RnfG  76.21 
 
 
206 aa  333  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.469993 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1553  electron transport complex protein RnfG  76.21 
 
 
206 aa  332  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.86084  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2343  electron transport complex protein RnfG  76.21 
 
 
206 aa  332  3e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0100314  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1707  electron transport complex protein RnfG  76.21 
 
 
206 aa  332  3e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.116117  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2249  electron transport complex protein RnfG  66.18 
 
 
209 aa  290  1e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000657737  normal  0.472384 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2011  electron transport complex protein RnfG  66.18 
 
 
209 aa  290  1e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000172244  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2236  electron transport complex protein RnfG  67.32 
 
 
209 aa  289  2e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  3.12896e-06 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1899  electron transport complex protein RnfG  66.18 
 
 
209 aa  289  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00381532  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1920  electron transport complex protein RnfG  63.9 
 
 
211 aa  281  4e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2021  electron transport complex protein RnfG  62.8 
 
 
209 aa  279  2e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2321  electron transport complex protein RnfG  62.8 
 
 
209 aa  277  1e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2158  electron transport complex protein RnfG  61.95 
 
 
210 aa  270  1e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.915166  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02968  electron transport complex protein RnfG  49.03 
 
 
212 aa  197  1e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002945  electron transport complex protein RnfG  45.89 
 
 
210 aa  188  5e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.564885  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1063  electron transport complex protein RnfG  48.99 
 
 
207 aa  182  3e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.137113  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2176  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  47.55 
 
 
215 aa  181  1e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.193841  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2560  electron transport complex protein RnfG  47.55 
 
 
208 aa  180  1e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0486766 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2070  electron transport complex protein RnfG  47.6 
 
 
212 aa  179  2e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02733  electron transport complex protein RnfG  47.44 
 
 
257 aa  179  2e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0534  electron transport complex protein RnfG  47.34 
 
 
209 aa  177  8e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  7.202e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1846  electron transport complex protein RnfG  48.53 
 
 
208 aa  176  2e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  3.0729e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1868  electron transport complex protein RnfG  45.67 
 
 
210 aa  176  2e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.803831  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2969  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  45.88 
 
 
215 aa  175  5e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1834  electron transport complex protein RnfG  45.83 
 
 
215 aa  173  2e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.856968  normal  0.105681 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1867  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  44.97 
 
 
217 aa  172  4e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2040  electron transport complex protein RnfG  45.59 
 
 
208 aa  172  4e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.8254  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2277  electron transport complex protein RnfG  44.71 
 
 
212 aa  172  4e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.050891  normal  0.93229 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2263  electron transport complex protein RnfG  45.1 
 
 
208 aa  171  6e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00083065  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2108  electron transport complex protein RnfG  45.1 
 
 
208 aa  171  6e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.220327  normal 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4549  electron transport complex protein RnfG  45.1 
 
 
208 aa  171  6e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1541  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  44.27 
 
 
205 aa  171  9e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.174651 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2061  electron transport complex protein RnfG  44.61 
 
 
208 aa  169  2e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  4.06522e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2512  electron transport complex protein RnfG  47.17 
 
 
212 aa  169  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2195  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  45.99 
 
 
259 aa  168  6e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.648995  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2172  electron transport complex protein RnfG  46.15 
 
 
208 aa  167  1e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.179108  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1907  electron transport complex protein RnfG  46.15 
 
 
208 aa  167  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2068  electron transport complex protein RnfG  46.15 
 
 
208 aa  167  1e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00132342  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2357  electron transport complex protein RnfG  46.57 
 
 
207 aa  164  7e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0734  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  43.75 
 
 
211 aa  162  3e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.35811  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0934  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  47.34 
 
 
233 aa  162  4e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1400  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  43.9 
 
 
211 aa  162  5e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.50013 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18900  hypothetical protein  45.26 
 
 
214 aa  157  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0705821  normal  0.0432187 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1636  hypothetical protein  43.46 
 
 
213 aa  156  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2019  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  47.31 
 
 
216 aa  152  4e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2630  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  43.37 
 
 
233 aa  149  3e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19230  Electron transport complex, subunit G  42.25 
 
 
208 aa  148  5e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1032  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  42.33 
 
 
217 aa  147  8e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  4.80333e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2404  electron transport complex protein RnfG  41.09 
 
 
215 aa  147  1e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.59015  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2897  electron transport complex, G subunit  44.89 
 
 
212 aa  145  3e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.432539  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0812  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  43.33 
 
 
220 aa  144  1e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.151893  normal  0.42525 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2820  electron transport complex, G subunit  47.47 
 
 
230 aa  142  3e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1171  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  40.53 
 
 
210 aa  141  7e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1159  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  39.9 
 
 
222 aa  133  2e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3196  RnfA-Nqr electron transport subunit  39.29 
 
 
220 aa  133  2e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.401599  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3236  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  42.19 
 
 
222 aa  131  6e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.556232  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1794  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  45.75 
 
 
222 aa  126  2e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.956584  hitchhiker  0.000880554 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0722  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  39.04 
 
 
224 aa  126  3e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.271576  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0686  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  41.4 
 
 
211 aa  125  5e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.320236  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50940  Electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  42.37 
 
 
229 aa  125  5e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0444757  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3196  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  40.61 
 
 
219 aa  123  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.314001  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3935  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  40.61 
 
 
219 aa  123  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00699897  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0287  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  41.21 
 
 
222 aa  115  4e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0817829  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1489  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  39.89 
 
 
229 aa  114  1e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.753633 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2993  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  39.11 
 
 
218 aa  113  2e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1783  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  50.89 
 
 
256 aa  109  2e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4511  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  36.51 
 
 
201 aa  98.6  6e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000304258 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0261  NADH:ubiquinone oxidoreductase, RnfG subunit-like  35 
 
 
201 aa  84.7  8e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1531  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  33.91 
 
 
181 aa  84.7  8e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00374795  normal  0.943593 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1094  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  36.81 
 
 
200 aa  84.7  1e-15  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1134  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  36.81 
 
 
200 aa  83.2  3e-15  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0306  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  31.89 
 
 
215 aa  81.6  8e-15  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1123  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  28.88 
 
 
200 aa  80.5  2e-14  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4318  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  31.68 
 
 
200 aa  76.3  3e-13  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1312  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  28.49 
 
 
181 aa  69.7  3e-11  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.777604  normal  0.23386 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1093  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  28.88 
 
 
178 aa  66.6  2e-10  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.997884  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0986  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  30.43 
 
 
181 aa  65.9  5e-10  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.625397  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1083  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  32.14 
 
 
368 aa  63.9  2e-09  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0590058 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0496  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  26.84 
 
 
177 aa  60.8  1e-08  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00037002  hitchhiker  0.000327646 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1958  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  37.93 
 
 
193 aa  59.7  3e-08  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.537285  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2432  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  26.34 
 
 
197 aa  57.4  1e-07  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  7.44665e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1318  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  28.93 
 
 
344 aa  56.6  3e-07  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0617616  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1157  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  27.84 
 
 
181 aa  55.8  4e-07  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.40861 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0063  FMN-binding domain-containing protein  32.5 
 
 
230 aa  55.5  5e-07  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.650559  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0652  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  25.81 
 
 
580 aa  55.5  6e-07  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.200112  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0081  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  29.69 
 
 
193 aa  55.1  7e-07  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0628211  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14330  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  27.51 
 
 
186 aa  53.5  2e-06  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  3.78736e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2828  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  36.17 
 
 
196 aa  53.5  2e-06  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.061366  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0520  FMN-binding domain-containing protein  34.38 
 
 
191 aa  53.1  3e-06  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.273649 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0308  FMN-binding domain-containing protein  34.78 
 
 
199 aa  52.4  5e-06  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0470915  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>