More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_0043 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_0043  putative electron transfer flavoprotein FixA  100 
 
 
256 aa  511  1e-144  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.570899  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00045  predicted electron transfer flavoprotein subunit, ETFP adenine nucleotide-binding domain protein  99.61 
 
 
256 aa  508  1e-143  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0045  putative electron transfer flavoprotein FixA  99.61 
 
 
277 aa  509  1e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0047  putative electron transfer flavoprotein FixA  99.61 
 
 
256 aa  508  1e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00044  hypothetical protein  99.61 
 
 
256 aa  508  1e-143  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3614  putative electron transfer flavoprotein FixA  99.61 
 
 
256 aa  508  1e-143  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0641152 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3558  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  99.61 
 
 
256 aa  508  1e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0045  putative electron transfer flavoprotein FixA  99.61 
 
 
256 aa  508  1e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0082  putative electron transfer flavoprotein FixA  87.5 
 
 
256 aa  448  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.902486  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0084  putative electron transfer flavoprotein FixA  88.28 
 
 
256 aa  450  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0081  putative electron transfer flavoprotein FixA  88.28 
 
 
256 aa  450  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0081  putative electron transfer flavoprotein FixA  87.5 
 
 
256 aa  446  1e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0085  putative electron transfer flavoprotein FixA  86.72 
 
 
256 aa  444  1e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.586579 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3230  putative electron transfer flavoprotein FixA  61.09 
 
 
257 aa  308  8e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.789005  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2677  putative electron transfer flavoprotein FixA  61.09 
 
 
257 aa  304  9e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4039  putative electron transfer flavoprotein FixA  62.26 
 
 
257 aa  303  2e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1934  putative electron transfer flavoprotein YdiQ  55.64 
 
 
254 aa  272  3e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0145817 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1498  putative electron transfer flavoprotein YdiQ  55.25 
 
 
254 aa  272  3e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.143654 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2414  putative electron transfer flavoprotein YdiQ  55.64 
 
 
254 aa  271  6e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1945  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  55.64 
 
 
254 aa  269  3e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.186501  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1914  putative electron transfer flavoprotein YdiQ  55.64 
 
 
254 aa  269  3e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1900  putative electron transfer flavoprotein YdiQ  55.25 
 
 
254 aa  267  1e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01655  hypothetical protein  55.25 
 
 
254 aa  267  1e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01666  hypothetical protein  55.25 
 
 
254 aa  267  1e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1818  putative electron transfer flavoprotein YdiQ  54.69 
 
 
254 aa  266  3e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1450  putative electron transfer flavoprotein YdiQ  54.69 
 
 
254 aa  266  3e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.970254  normal  0.335905 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1395  putative electron transfer flavoprotein YdiQ  57.98 
 
 
254 aa  265  6e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.239881  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1990  putative electron transfer flavoprotein YdiQ  54.51 
 
 
254 aa  265  7e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.100268  normal  0.0115553 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1484  putative electron transfer flavoprotein YdiQ  54.51 
 
 
254 aa  265  7e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0299245 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1466  putative electron transfer flavoprotein YdiQ  54.3 
 
 
254 aa  262  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.2749 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4606  putative electron transfer flavoprotein YdiQ  51.95 
 
 
256 aa  246  3e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1019  putative electron transfer flavoprotein YdiQ  50.78 
 
 
256 aa  236  2e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0311  putative electron transfer flavoprotein YdiQ  45.35 
 
 
256 aa  214  7e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0104646  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0572  putative electron transfer flavoprotein YdiQ  47.24 
 
 
256 aa  209  4e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.118411  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2873  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  46.09 
 
 
255 aa  203  3e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3930  electron transfer flavoprotein beta-subunit  42.8 
 
 
257 aa  174  2e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.315122 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1824  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  45.28 
 
 
252 aa  172  4e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.096879  normal  0.191041 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0267  electron transfer flavoprotein beta subunit-like protein  48.28 
 
 
258 aa  166  5e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09230  electron transfer flavoprotein, beta subunit  51.43 
 
 
251 aa  159  4e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.265854 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1841  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  44.9 
 
 
256 aa  150  2e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.349047  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08790  electron transfer flavoprotein, beta subunit  45.63 
 
 
247 aa  145  8e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.515982 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02670  electron transfer flavoprotein, beta subunit  41.23 
 
 
256 aa  137  2e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.842204 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3104  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  41.88 
 
 
252 aa  133  4e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000268097 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2122  hypothetical protein  35.43 
 
 
251 aa  126  4e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2354  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  34.38 
 
 
259 aa  124  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6051  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  34.38 
 
 
259 aa  121  1e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1103  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  33.2 
 
 
259 aa  120  2e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0274897  normal  0.0559611 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28260  electron transfer flavoprotein, beta subunit  34.51 
 
 
261 aa  120  2e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0684  electron transfer flavoprotein beta-subunit  33.85 
 
 
260 aa  120  2e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.965438 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4092  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  35.16 
 
 
259 aa  118  9e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1210  electron transfer flavoprotein beta-subunit  33.07 
 
 
259 aa  117  2e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1815  electron transfer flavoprotein beta-subunit  33.99 
 
 
266 aa  115  1e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.48954  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1608  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  31.44 
 
 
263 aa  113  3e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1383  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  33.06 
 
 
260 aa  113  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3679  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  33.59 
 
 
262 aa  113  3e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1102  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  33.59 
 
 
264 aa  113  3e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.275648  hitchhiker  0.00234643 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3575  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  32.03 
 
 
259 aa  112  5e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0138442  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2846  electron transfer flavoprotein subunits alpha/beta  32.42 
 
 
259 aa  112  6e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1372  electron transfer flavoprotein beta-subunit  29.06 
 
 
263 aa  111  1e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.505758  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0308  electron transfer flavoprotein, beta subunit/FixA family protein  32.2 
 
 
262 aa  110  2e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2830  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  32.13 
 
 
260 aa  110  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0756  electron transfer flavoprotein beta-subunit  31.4 
 
 
256 aa  108  7e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.480219 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09600  electron transfer flavoprotein, beta subunit  33.46 
 
 
262 aa  108  8e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0670453  normal  0.0687461 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4535  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  29.84 
 
 
260 aa  108  9e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0741133  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1438  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  32.28 
 
 
260 aa  108  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0597474  normal  0.920137 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0640  electron transfer flavoprotein beta-subunit  32.81 
 
 
266 aa  108  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0256  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  33.98 
 
 
259 aa  107  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0672629  normal  0.0851543 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0593  electron transfer flavoprotein, beta subunit  32.42 
 
 
259 aa  106  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2006  electron transfer flavoprotein beta-subunit  31.68 
 
 
278 aa  106  3e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.249867 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0914  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  33.2 
 
 
257 aa  106  4e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0862811 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2213  electron transfer flavoprotein beta-subunit  32.95 
 
 
256 aa  105  9e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0185334  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3260  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  30.98 
 
 
261 aa  104  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0130  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  28.91 
 
 
263 aa  104  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.999111  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0577  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  31.93 
 
 
242 aa  103  2e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.417576  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0303  electron transfer flavoprotein, beta subunit  30.93 
 
 
262 aa  104  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13045  electron transfer flavoprotein beta subunit fixA  31.66 
 
 
266 aa  103  3e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.26772e-05  hitchhiker  0.00331196 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0440  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  30.7 
 
 
262 aa  102  5e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8114  electron transfer flavoprotein beta-subunit  30.86 
 
 
259 aa  102  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.673435 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1315  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  26.62 
 
 
262 aa  101  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.820816  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0331  electron transfer flavoprotein beta-subunit  30.04 
 
 
240 aa  100  2e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3038  electron transfer flavoprotein beta-subunit  31.84 
 
 
286 aa  100  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3648  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  29.96 
 
 
257 aa  100  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4640  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  30.97 
 
 
263 aa  99.4  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0673923 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2099  electron transfer flavoprotein beta-subunit  31.25 
 
 
263 aa  99.4  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4259  electron transfer flavoprotein beta-subunit  31.25 
 
 
263 aa  99.4  5e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2917  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  32.3 
 
 
261 aa  99  6e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0846128  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2285  electron transfer flavoprotein beta-subunit  33.65 
 
 
259 aa  99  7e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1880  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  28.57 
 
 
262 aa  98.6  8e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.190196 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2583  electron transfer flavoprotein, beta subunit/FixA family protein  33.65 
 
 
259 aa  98.6  8e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1850  electron transfer flavoprotein beta-subunit  30.5 
 
 
266 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0584  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  32.71 
 
 
260 aa  98.2  1e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1916  electron transfer flavoprotein beta-subunit  30.5 
 
 
266 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0359178  normal  0.444862 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1935  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  30.45 
 
 
266 aa  98.2  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.988046  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1870  electron transfer flavoprotein beta-subunit  30.5 
 
 
266 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.244311  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0353  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  32.55 
 
 
251 aa  97.4  2e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1713  electron transfer flavoprotein subunit beta  32.93 
 
 
258 aa  96.7  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3300  electron transfer flavoprotein subunit beta  33.18 
 
 
258 aa  95.9  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1835  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  28.63 
 
 
257 aa  95.9  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.163048  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2057  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  32.78 
 
 
245 aa  94.4  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0288858 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1545  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  31.19 
 
 
261 aa  93.6  3e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>