More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A1990 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A1450  putative electron transfer flavoprotein YdiQ  99.21 
 
 
254 aa  507  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.970254  normal  0.335905 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1990  putative electron transfer flavoprotein YdiQ  100 
 
 
254 aa  509  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.100268  normal  0.0115553 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1818  putative electron transfer flavoprotein YdiQ  99.21 
 
 
254 aa  507  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1484  putative electron transfer flavoprotein YdiQ  100 
 
 
254 aa  509  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0299245 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1466  putative electron transfer flavoprotein YdiQ  98.82 
 
 
254 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.2749 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1945  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  80.31 
 
 
254 aa  421  1e-117  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.186501  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1914  putative electron transfer flavoprotein YdiQ  80.31 
 
 
254 aa  421  1e-117  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1934  putative electron transfer flavoprotein YdiQ  80.71 
 
 
254 aa  421  1e-117  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0145817 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01666  hypothetical protein  80.31 
 
 
254 aa  420  1e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1900  putative electron transfer flavoprotein YdiQ  80.31 
 
 
254 aa  420  1e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1498  putative electron transfer flavoprotein YdiQ  79.53 
 
 
254 aa  419  1e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.143654 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01655  hypothetical protein  80.31 
 
 
254 aa  420  1e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2414  putative electron transfer flavoprotein YdiQ  80.31 
 
 
254 aa  420  1e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1395  putative electron transfer flavoprotein YdiQ  74.8 
 
 
254 aa  371  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.239881  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3230  putative electron transfer flavoprotein FixA  53.1 
 
 
257 aa  261  6e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.789005  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4039  putative electron transfer flavoprotein FixA  52.92 
 
 
257 aa  258  5.0000000000000005e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4606  putative electron transfer flavoprotein YdiQ  52.16 
 
 
256 aa  249  2e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1019  putative electron transfer flavoprotein YdiQ  49.41 
 
 
256 aa  248  5e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0045  putative electron transfer flavoprotein FixA  54.51 
 
 
277 aa  246  2e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00045  predicted electron transfer flavoprotein subunit, ETFP adenine nucleotide-binding domain protein  54.51 
 
 
256 aa  246  3e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3558  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  54.51 
 
 
256 aa  246  3e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0047  putative electron transfer flavoprotein FixA  54.51 
 
 
256 aa  246  3e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0084  putative electron transfer flavoprotein FixA  52.55 
 
 
256 aa  246  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0081  putative electron transfer flavoprotein FixA  52.55 
 
 
256 aa  246  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00044  hypothetical protein  54.51 
 
 
256 aa  246  3e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3614  putative electron transfer flavoprotein FixA  54.51 
 
 
256 aa  246  3e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0641152 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0043  putative electron transfer flavoprotein FixA  54.51 
 
 
256 aa  246  3e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.570899  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0045  putative electron transfer flavoprotein FixA  54.51 
 
 
256 aa  246  3e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2677  putative electron transfer flavoprotein FixA  50.58 
 
 
257 aa  245  6e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0085  putative electron transfer flavoprotein FixA  52.94 
 
 
256 aa  244  8e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.586579 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0081  putative electron transfer flavoprotein FixA  52.16 
 
 
256 aa  242  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0082  putative electron transfer flavoprotein FixA  52.16 
 
 
256 aa  241  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.902486  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0311  putative electron transfer flavoprotein YdiQ  49.41 
 
 
256 aa  237  1e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0104646  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0572  putative electron transfer flavoprotein YdiQ  46.67 
 
 
256 aa  226  3e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.118411  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2873  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  44.71 
 
 
255 aa  198  7e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1824  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  42.97 
 
 
252 aa  160  2e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.096879  normal  0.191041 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0267  electron transfer flavoprotein beta subunit-like protein  42 
 
 
258 aa  149  4e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3930  electron transfer flavoprotein beta-subunit  37.74 
 
 
257 aa  144  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.315122 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1841  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  39.66 
 
 
256 aa  136  3.0000000000000003e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.349047  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09230  electron transfer flavoprotein, beta subunit  41.18 
 
 
251 aa  135  4e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.265854 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02670  electron transfer flavoprotein, beta subunit  35.15 
 
 
256 aa  127  1.0000000000000001e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.842204 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3104  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  37.39 
 
 
252 aa  125  5e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000268097 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08790  electron transfer flavoprotein, beta subunit  39 
 
 
247 aa  115  7.999999999999999e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.515982 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2122  hypothetical protein  36.68 
 
 
251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0331  electron transfer flavoprotein beta-subunit  33.47 
 
 
240 aa  107  2e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0756  electron transfer flavoprotein beta-subunit  33.8 
 
 
256 aa  107  2e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.480219 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2006  electron transfer flavoprotein beta-subunit  34.11 
 
 
278 aa  106  4e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.249867 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0914  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  33.18 
 
 
257 aa  102  9e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0862811 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0635  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  32.1 
 
 
610 aa  101  1e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.3535  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2213  electron transfer flavoprotein beta-subunit  33.18 
 
 
256 aa  100  2e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0185334  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0577  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  30.74 
 
 
242 aa  100  3e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.417576  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1372  electron transfer flavoprotein beta-subunit  29.89 
 
 
263 aa  98.6  8e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.505758  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2354  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  34.72 
 
 
259 aa  96.7  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4535  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  28.12 
 
 
260 aa  95.5  7e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0741133  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0256  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  35.98 
 
 
259 aa  94  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0672629  normal  0.0851543 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09600  electron transfer flavoprotein, beta subunit  33.33 
 
 
262 aa  92.8  4e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0670453  normal  0.0687461 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1608  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  29.39 
 
 
263 aa  93.2  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6051  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  35.07 
 
 
259 aa  92.8  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28260  electron transfer flavoprotein, beta subunit  33.61 
 
 
261 aa  91.7  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0593  electron transfer flavoprotein, beta subunit  35.29 
 
 
259 aa  90.9  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1815  electron transfer flavoprotein beta-subunit  33.46 
 
 
266 aa  90.9  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.48954  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1297  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  33.66 
 
 
259 aa  90.1  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2846  electron transfer flavoprotein subunits alpha/beta  30.48 
 
 
259 aa  89  7e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2583  electron transfer flavoprotein, beta subunit/FixA family protein  29.67 
 
 
259 aa  87  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4640  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  31.7 
 
 
263 aa  87.8  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0673923 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2285  electron transfer flavoprotein beta-subunit  29.67 
 
 
259 aa  87  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8114  electron transfer flavoprotein beta-subunit  32.84 
 
 
259 aa  86.7  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.673435 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1315  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  27.2 
 
 
262 aa  86.3  5e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.820816  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0640  electron transfer flavoprotein beta-subunit  33.46 
 
 
266 aa  85.5  7e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1102  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  31.52 
 
 
264 aa  85.5  8e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.275648  hitchhiker  0.00234643 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1432  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  28.97 
 
 
255 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135949  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3575  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  31.33 
 
 
259 aa  85.1  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0138442  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1438  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  33 
 
 
260 aa  84  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0597474  normal  0.920137 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1248  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  27.76 
 
 
601 aa  82.4  0.000000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0584  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  30.35 
 
 
260 aa  82.4  0.000000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0308  electron transfer flavoprotein, beta subunit/FixA family protein  28.3 
 
 
262 aa  82  0.000000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1545  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  26.32 
 
 
261 aa  81.6  0.00000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1103  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  31.63 
 
 
259 aa  81.6  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0274897  normal  0.0559611 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0412  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  29.02 
 
 
259 aa  80.5  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.80435  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3648  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  28.7 
 
 
257 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0440  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  28.31 
 
 
262 aa  81.3  0.00000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2742  electron transfer flavoprotein beta-subunit  32.79 
 
 
270 aa  80.5  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1383  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  27.41 
 
 
260 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1210  electron transfer flavoprotein beta-subunit  31.16 
 
 
259 aa  80.1  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0655  electron transfer flavoprotein, alpha/beta-subunit-like protein  29.35 
 
 
259 aa  80.1  0.00000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.894194  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1835  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  28.38 
 
 
257 aa  79.7  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.163048  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3166  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  28.46 
 
 
258 aa  79.7  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.478956  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3223  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  30.65 
 
 
257 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3300  electron transfer flavoprotein subunit beta  31.19 
 
 
258 aa  78.6  0.00000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0367  electron transfer flavoprotein beta-subunit  26.32 
 
 
262 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.969021  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1880  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  29.11 
 
 
262 aa  77.4  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.190196 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4351  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  30.5 
 
 
257 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4270  electron transfer flavoprotein, beta subunit (beta-ETF)  30.5 
 
 
257 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0058  electron transfer flavoprotein subunit beta  28.64 
 
 
267 aa  77.4  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001045 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4651  electron transfer flavoprotein, beta subunit  30.5 
 
 
257 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2830  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  29.27 
 
 
260 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4635  electron transfer flavoprotein, beta subunit  30.5 
 
 
257 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4419  electron transfer flavoprotein subunit beta  30 
 
 
257 aa  77  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3038  electron transfer flavoprotein beta-subunit  26.67 
 
 
286 aa  77  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4760  electron transfer flavoprotein subunit beta  30 
 
 
257 aa  77  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>