More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3230 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_3230  putative electron transfer flavoprotein FixA  100 
 
 
257 aa  508  1e-143  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.789005  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4039  putative electron transfer flavoprotein FixA  80.16 
 
 
257 aa  417  1e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2677  putative electron transfer flavoprotein FixA  75.49 
 
 
257 aa  393  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0081  putative electron transfer flavoprotein FixA  60.78 
 
 
256 aa  300  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0084  putative electron transfer flavoprotein FixA  60.78 
 
 
256 aa  300  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0085  putative electron transfer flavoprotein FixA  60 
 
 
256 aa  294  8e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.586579 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0082  putative electron transfer flavoprotein FixA  60 
 
 
256 aa  293  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.902486  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0081  putative electron transfer flavoprotein FixA  60 
 
 
256 aa  291  6e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0045  putative electron transfer flavoprotein FixA  61.09 
 
 
277 aa  287  1e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00045  predicted electron transfer flavoprotein subunit, ETFP adenine nucleotide-binding domain protein  61.09 
 
 
256 aa  286  2e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3558  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  61.09 
 
 
256 aa  286  2e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00044  hypothetical protein  61.09 
 
 
256 aa  286  2e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0045  putative electron transfer flavoprotein FixA  61.09 
 
 
256 aa  286  2e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0047  putative electron transfer flavoprotein FixA  61.09 
 
 
256 aa  286  2e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3614  putative electron transfer flavoprotein FixA  61.09 
 
 
256 aa  286  2e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0641152 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0043  putative electron transfer flavoprotein FixA  61.09 
 
 
256 aa  286  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.570899  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1945  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  54.09 
 
 
254 aa  269  4e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.186501  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1914  putative electron transfer flavoprotein YdiQ  54.09 
 
 
254 aa  269  4e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01666  hypothetical protein  54.09 
 
 
254 aa  267  1e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01655  hypothetical protein  54.09 
 
 
254 aa  267  1e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4606  putative electron transfer flavoprotein YdiQ  55.25 
 
 
256 aa  266  2e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1900  putative electron transfer flavoprotein YdiQ  53.7 
 
 
254 aa  266  2e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1498  putative electron transfer flavoprotein YdiQ  53.31 
 
 
254 aa  266  2e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.143654 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1934  putative electron transfer flavoprotein YdiQ  53.31 
 
 
254 aa  265  4e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0145817 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2414  putative electron transfer flavoprotein YdiQ  53.31 
 
 
254 aa  265  7e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1484  putative electron transfer flavoprotein YdiQ  53.1 
 
 
254 aa  261  6.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0299245 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1990  putative electron transfer flavoprotein YdiQ  53.1 
 
 
254 aa  261  6.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.100268  normal  0.0115553 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1019  putative electron transfer flavoprotein YdiQ  55.38 
 
 
256 aa  260  1e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1450  putative electron transfer flavoprotein YdiQ  52.9 
 
 
254 aa  259  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.970254  normal  0.335905 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1818  putative electron transfer flavoprotein YdiQ  52.9 
 
 
254 aa  259  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1466  putative electron transfer flavoprotein YdiQ  52.51 
 
 
254 aa  254  7e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.2749 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1395  putative electron transfer flavoprotein YdiQ  57.53 
 
 
254 aa  251  7e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.239881  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0572  putative electron transfer flavoprotein YdiQ  51.94 
 
 
256 aa  236  2e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.118411  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0311  putative electron transfer flavoprotein YdiQ  44.96 
 
 
256 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0104646  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2873  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  46.3 
 
 
255 aa  208  9e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1824  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  43.58 
 
 
252 aa  177  1e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.096879  normal  0.191041 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09230  electron transfer flavoprotein, beta subunit  44.44 
 
 
251 aa  159  6e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.265854 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1841  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  43.1 
 
 
256 aa  152  4e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.349047  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0267  electron transfer flavoprotein beta subunit-like protein  40.83 
 
 
258 aa  149  3e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3930  electron transfer flavoprotein beta-subunit  40.08 
 
 
257 aa  146  3e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.315122 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02670  electron transfer flavoprotein, beta subunit  37.5 
 
 
256 aa  139  3e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.842204 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3104  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  40 
 
 
252 aa  134  9.999999999999999e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000268097 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08790  electron transfer flavoprotein, beta subunit  43.2 
 
 
247 aa  134  9.999999999999999e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.515982 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2122  hypothetical protein  36.72 
 
 
251 aa  120  3e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0756  electron transfer flavoprotein beta-subunit  32.6 
 
 
256 aa  107  3e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.480219 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3679  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  36.02 
 
 
262 aa  105  9e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2354  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  31.52 
 
 
259 aa  104  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1608  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  31.72 
 
 
263 aa  104  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2006  electron transfer flavoprotein beta-subunit  33.04 
 
 
278 aa  103  3e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.249867 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0914  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  32.61 
 
 
257 aa  102  5e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0862811 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0308  electron transfer flavoprotein, beta subunit/FixA family protein  32.87 
 
 
262 aa  102  6e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1372  electron transfer flavoprotein beta-subunit  29.77 
 
 
263 aa  102  8e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.505758  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0130  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  30.7 
 
 
263 aa  101  1e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.999111  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0303  electron transfer flavoprotein, beta subunit  32.41 
 
 
262 aa  100  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2830  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  32.67 
 
 
260 aa  98.2  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1103  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  33.2 
 
 
259 aa  97.8  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0274897  normal  0.0559611 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0684  electron transfer flavoprotein beta-subunit  33.59 
 
 
260 aa  98.2  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.965438 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6051  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  35.27 
 
 
259 aa  97.4  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2213  electron transfer flavoprotein beta-subunit  31.72 
 
 
256 aa  97.1  3e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0185334  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1210  electron transfer flavoprotein beta-subunit  32.42 
 
 
259 aa  96.3  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3038  electron transfer flavoprotein beta-subunit  32.18 
 
 
286 aa  96.7  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1383  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  32.67 
 
 
260 aa  95.9  6e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1713  electron transfer flavoprotein subunit beta  30.92 
 
 
258 aa  95.9  6e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1315  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  27.38 
 
 
262 aa  95.5  8e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.820816  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28260  electron transfer flavoprotein, beta subunit  35.17 
 
 
261 aa  94.7  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4092  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  34.88 
 
 
259 aa  93.6  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2846  electron transfer flavoprotein subunits alpha/beta  33.85 
 
 
259 aa  93.6  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4535  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  31.15 
 
 
260 aa  93.6  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0741133  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2299  electron transfer flavoprotein beta-subunit  34.11 
 
 
258 aa  92.8  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.613535  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3166  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  31.4 
 
 
258 aa  92  7e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.478956  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1835  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  29.91 
 
 
257 aa  92  8e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.163048  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0331  electron transfer flavoprotein beta-subunit  30.83 
 
 
240 aa  92  9e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3575  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  36.29 
 
 
259 aa  91.3  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0138442  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0440  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  29.06 
 
 
262 aa  91.3  1e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0593  electron transfer flavoprotein, beta subunit  38.1 
 
 
259 aa  90.5  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8114  electron transfer flavoprotein beta-subunit  34.5 
 
 
259 aa  90.9  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.673435 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0429  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  29.88 
 
 
249 aa  89.4  5e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0572448  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1601  electron transfer flavoprotein beta-subunit  29.5 
 
 
258 aa  89.4  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09600  electron transfer flavoprotein, beta subunit  32.31 
 
 
262 aa  88.6  9e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0670453  normal  0.0687461 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2099  electron transfer flavoprotein beta-subunit  33.07 
 
 
263 aa  88.6  9e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3648  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  28.63 
 
 
257 aa  87.8  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1102  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  34.4 
 
 
264 aa  87.4  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.275648  hitchhiker  0.00234643 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1591  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  31.44 
 
 
252 aa  86.3  4e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2153  electron transfer flavoprotein subunit beta  29.89 
 
 
258 aa  86.3  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000153596  normal  0.854717 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02780  electron transfer flavoprotein, beta subunit  29.3 
 
 
260 aa  85.9  5e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0256  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  33.72 
 
 
259 aa  86.3  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0672629  normal  0.0851543 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2784  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  30.04 
 
 
258 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0655  electron transfer flavoprotein, alpha/beta-subunit-like protein  31.9 
 
 
259 aa  84  0.000000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.894194  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0367  electron transfer flavoprotein beta-subunit  30.84 
 
 
262 aa  84  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.969021  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4830  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  28.23 
 
 
263 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0830  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  28.63 
 
 
258 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1880  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  30.37 
 
 
262 aa  84.3  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.190196 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1469  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  29.28 
 
 
258 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1935  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  29 
 
 
266 aa  82.8  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.988046  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1297  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  33.97 
 
 
259 aa  83.2  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1538  electron transfer flavoprotein beta-subunit  33.03 
 
 
265 aa  82.8  0.000000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.374456  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2950  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  31.6 
 
 
258 aa  82.4  0.000000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2626  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  29.44 
 
 
257 aa  82.4  0.000000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000104264  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3300  electron transfer flavoprotein subunit beta  29.36 
 
 
258 aa  82  0.000000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1870  electron transfer flavoprotein beta-subunit  32.95 
 
 
266 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.244311  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>