269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_1592 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010468  EcolC_1576  deoxycytidine triphosphate deaminase  99.48 
 
 
193 aa  390  1e-108  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0207853  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1592  deoxycytidine triphosphate deaminase  100 
 
 
193 aa  391  1e-108  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00335404  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2358  deoxycytidine triphosphate deaminase  99.48 
 
 
193 aa  390  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2205  deoxycytidine triphosphate deaminase  99.48 
 
 
193 aa  390  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1167  deoxycytidine triphosphate deaminase  99.48 
 
 
193 aa  390  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3002  deoxycytidine triphosphate deaminase  98.96 
 
 
193 aa  388  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.304986 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0995  deoxycytidine triphosphate deaminase  98.96 
 
 
193 aa  388  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01971  deoxycytidine triphosphate deaminase  98.96 
 
 
193 aa  388  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01960  hypothetical protein  98.96 
 
 
193 aa  388  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2355  deoxycytidine triphosphate deaminase  95.85 
 
 
193 aa  377  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.506622  normal  0.430961 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2248  deoxycytidine triphosphate deaminase  95.85 
 
 
193 aa  377  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2304  deoxycytidine triphosphate deaminase  95.85 
 
 
193 aa  377  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2462  deoxycytidine triphosphate deaminase  95.85 
 
 
193 aa  377  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.417752 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2348  deoxycytidine triphosphate deaminase  95.85 
 
 
193 aa  377  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2679  deoxycytidine triphosphate deaminase  92.75 
 
 
193 aa  366  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.386804 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1198  deoxycytidine triphosphate deaminase  91.19 
 
 
194 aa  360  6e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1577  deoxycytidine triphosphate deaminase  91.19 
 
 
193 aa  357  5e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.600323 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2870  deoxycytidine triphosphate deaminase  89.12 
 
 
193 aa  356  1e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3194  deoxycytidine triphosphate deaminase  90.67 
 
 
193 aa  356  1e-97  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.075679  hitchhiker  0.00258596 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2452  deoxycytidine triphosphate deaminase  90.67 
 
 
193 aa  356  1e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2551  deoxycytidine triphosphate deaminase  90.67 
 
 
193 aa  356  1e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1290  deoxycytidine triphosphate deaminase  90.16 
 
 
193 aa  355  2e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3041  deoxycytidine triphosphate deaminase  89.64 
 
 
193 aa  355  3e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0645  deoxycytidine triphosphate deaminase  75.65 
 
 
194 aa  309  2e-83  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000193078  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0395  2-deoxycytidine 5-triphosphate deaminase  73.06 
 
 
193 aa  299  2e-80  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.610625  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2046  deoxycytidine triphosphate deaminase  75.13 
 
 
194 aa  297  6e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.416857  normal  0.66664 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0756  deoxycytidine triphosphate deaminase  72.02 
 
 
194 aa  296  1e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01987  deoxycytidine triphosphate deaminase  74.09 
 
 
197 aa  294  5e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.303345  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2837  deoxycytidine triphosphate deaminase  70.47 
 
 
198 aa  292  2e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.114909  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1576  deoxycytidine triphosphate deaminase  73.06 
 
 
194 aa  292  2e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1658  deoxycytidine triphosphate deaminase  73.58 
 
 
193 aa  289  1e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.190488  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1763  deoxycytidine triphosphate deaminase  73.58 
 
 
193 aa  289  1e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0121906  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1733  deoxycytidine triphosphate deaminase  73.58 
 
 
193 aa  288  3e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00151185  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2616  deoxycytidine triphosphate deaminase  73.58 
 
 
193 aa  288  3e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1899  deoxycytidine triphosphate deaminase  71.5 
 
 
199 aa  288  3e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.234563  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2217  deoxycytidine triphosphate deaminase  73.06 
 
 
193 aa  288  3e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2243  deoxycytidine triphosphate deaminase  69.95 
 
 
194 aa  282  3e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2455  deoxycytidine triphosphate deaminase  71.5 
 
 
193 aa  280  7e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  2.33187e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2462  deoxycytidine triphosphate deaminase  71.5 
 
 
193 aa  280  7e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  2.65475e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1889  deoxycytidine triphosphate deaminase  71.5 
 
 
193 aa  280  7e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  9.32331e-05  normal  0.0428491 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2575  deoxycytidine triphosphate deaminase  71.5 
 
 
193 aa  280  7e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.109993  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1043  deoxycytidine triphosphate deaminase  66.32 
 
 
207 aa  272  2e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000608448  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1548  deoxycytidine triphosphate deaminase  65.79 
 
 
194 aa  263  8e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.140824  hitchhiker  2.37389e-05 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2794  dCTP deaminase  49.74 
 
 
195 aa  190  9e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0052  deoxycytidine triphosphate deaminase  43.37 
 
 
194 aa  162  4e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.767695  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5912  deoxycytidine triphosphate deaminase  47.89 
 
 
196 aa  156  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35480  dCTP deaminase  45.79 
 
 
191 aa  154  8e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0993  deoxycytidine triphosphate deaminase  43.46 
 
 
185 aa  152  2e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18990  deoxycytidine triphosphate deaminase  45.88 
 
 
193 aa  149  2e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.27567  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1090  deoxycytidine triphosphate deaminase  44.15 
 
 
192 aa  146  2e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2441  deoxycytidine triphosphate deaminase  43.09 
 
 
194 aa  145  4e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.145517 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2714  deoxycytidine triphosphate deaminase  44.33 
 
 
195 aa  144  6e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.106296  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0459  deoxycytidine triphosphate deaminase  45.26 
 
 
189 aa  144  8e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.552653  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0417  deoxycytidine triphosphate deaminase  44.74 
 
 
190 aa  143  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.429119 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0440  deoxycytidine triphosphate deaminase  44.74 
 
 
190 aa  143  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0355073 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0430  deoxycytidine triphosphate deaminase  44.74 
 
 
190 aa  143  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3823  deoxycytidine triphosphate deaminase  43.68 
 
 
192 aa  142  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4348  deoxycytidine triphosphate deaminase  44.74 
 
 
191 aa  142  4e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00886723  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0291  deoxycytidine triphosphate deaminase  44.21 
 
 
190 aa  142  4e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18819  normal  0.0282083 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3877  deoxycytidine triphosphate deaminase  43.62 
 
 
193 aa  141  6e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0589  deoxycytidine triphosphate deaminase  44.21 
 
 
190 aa  141  7e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00611749  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3189  deoxycytidine triphosphate deaminase  42.63 
 
 
191 aa  140  9e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25230  deoxycytidine triphosphate deaminase  44.21 
 
 
197 aa  140  1e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.493678  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3664  deoxycytidine triphosphate deaminase  42.63 
 
 
191 aa  140  1e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2412  deoxycytidine triphosphate deaminase  41.75 
 
 
200 aa  139  2e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10326  deoxycytidine triphosphate deaminase  43.16 
 
 
190 aa  139  4e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0147  deoxycytidine triphosphate deaminase  41.49 
 
 
194 aa  137  7e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0302964 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2932  deoxycytidine triphosphate deaminase  42.93 
 
 
196 aa  137  7e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0239  deoxycytidine triphosphate deaminase  43.59 
 
 
201 aa  137  8e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.588762 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0890  deoxycytidine triphosphate deaminase  43.46 
 
 
191 aa  137  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0052  deoxycytidine triphosphate deaminase  40.21 
 
 
201 aa  137  1e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4541  deoxycytidine triphosphate deaminase  41.24 
 
 
196 aa  136  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0445  deoxycytidine triphosphate deaminase  42.78 
 
 
203 aa  135  3e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.272127  normal  0.513401 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4349  deoxycytidine triphosphate deaminase  42.56 
 
 
199 aa  134  9e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.756279  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0056  deoxycytidine triphosphate deaminase  41.58 
 
 
192 aa  134  9e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.18705  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1470  deoxycytidine triphosphate deaminase  41.75 
 
 
199 aa  134  1e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8794  deoxycytidine triphosphate deaminase  42.11 
 
 
216 aa  134  1e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.022766  normal  0.413078 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38680  deoxycytidine triphosphate deaminase  41.15 
 
 
195 aa  133  1e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2112  deoxycytidine triphosphate deaminase  43.46 
 
 
191 aa  133  1e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.24843 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0244  deoxycytidine triphosphate deaminase  41.58 
 
 
191 aa  134  1e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0448  deoxycytidine triphosphate deaminase  41.05 
 
 
191 aa  132  2e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.468429  normal  0.993437 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0061  deoxycytidine triphosphate deaminase  41.58 
 
 
192 aa  133  2e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.767795  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4412  deoxycytidine triphosphate deaminase  41.36 
 
 
191 aa  133  2e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.491521  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4811  deoxycytidine triphosphate deaminase  41.58 
 
 
196 aa  132  3e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0021  deoxycytidine triphosphate deaminase  39.69 
 
 
196 aa  132  4e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.324355  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0084  deoxycytidine triphosphate deaminase  42.86 
 
 
200 aa  131  5e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5267  deoxycytidine triphosphate deaminase  40 
 
 
193 aa  130  9e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26270  deoxycytidine triphosphate deaminase  40.41 
 
 
194 aa  130  9e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.175156 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1478  deoxycytidine triphosphate deaminase  40 
 
 
193 aa  128  5e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4243  deoxycytidine triphosphate deaminase  41.05 
 
 
191 aa  128  5e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1348  dCTP deaminase  39.47 
 
 
193 aa  128  5e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.58691e-05 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6959  deoxycytidine triphosphate deaminase  41.8 
 
 
211 aa  127  8e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.504327  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1249  deoxycytidine triphosphate deaminase  38.34 
 
 
179 aa  114  7e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0827  deoxycytidine triphosphate deaminase  36.92 
 
 
180 aa  114  8e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  1.19841e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0543  dCTP deaminase  35.75 
 
 
187 aa  110  1e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.14508  normal  0.0728196 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1008  deoxycytidine triphosphate deaminase  36.79 
 
 
185 aa  110  1e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.216038  normal  0.0369519 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0327  deoxycytidine triphosphate deaminase  36.97 
 
 
184 aa  108  5e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.809814  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1477  dCTP deaminase  34.72 
 
 
178 aa  106  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0767  deoxycytidine triphosphate deaminase  38.14 
 
 
187 aa  104  8e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0102509  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1302  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.68 
 
 
186 aa  97.8  8e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>