12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0331 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



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Replicon accession

Locus tag

Product

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Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

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E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007799  ECH_0331  RDD family protein  100 
 
 
163 aa  325  2.0000000000000001e-88  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0674  RDD  77.3 
 
 
163 aa  255  2e-67  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1602  hypothetical protein  33.03 
 
 
152 aa  49.3  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0171  RDD domain-containing protein  24.19 
 
 
140 aa  47.8  0.00006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000652856  decreased coverage  0.0096302 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3590  RDD domain containing protein  21.97 
 
 
310 aa  45.4  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1261  RDD domain containing protein  26.5 
 
 
152 aa  45.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.295928 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1128  RDD domain-containing protein  25 
 
 
152 aa  44.7  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1148  RDD domain containing protein  21.3 
 
 
185 aa  44.3  0.0007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00101829  hitchhiker  0.000000000000525817 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0075  RDD domain-containing protein  21.26 
 
 
185 aa  43.9  0.0008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0306278  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1112  RDD domain containing protein  25.64 
 
 
152 aa  43.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4654  RDD domain-containing protein  29.1 
 
 
264 aa  42.4  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.807388  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2608  RDD domain-containing protein  26.4 
 
 
456 aa  41.2  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.107491 
 
 
-
 
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