19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0197 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0197  hypothetical protein  100 
 
 		 555 aa  1140    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2025  hypothetical protein  68.3 
 
 		 554 aa  763    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0121  hypothetical protein  55.64 
 
 		 558 aa  580  1e-164  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2324  FG-GAP repeat protein  46.68 
 
 		 561 aa  491  1e-137  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000100122  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0311  hypothetical protein  40.66 
 
 		 535 aa  413  1e-114  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000410606  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1882  hypothetical protein  41.16 
 
 		 552 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785906 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1746  hypothetical protein  26.37 
 
 		 614 aa  169  1e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000631337  hitchhiker  0.00120069 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0012  integrin-like repeat-containing protein  24.33 
 
 		 565 aa  158  2e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257714  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0939  FG-GAP repeat protein  26.78 
 
 		 568 aa  96.3  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.659758  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3253  hypothetical protein  20.89 
 
 		 510 aa  69.3  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000436664  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3256  hypothetical protein  21.75 
 
 		 510 aa  62  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000373547  hitchhiker  9.15864e-19 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2185  hypothetical protein  21.73 
 
 		 498 aa  61.2  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000017001  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3306  hypothetical protein  20.99 
 
 		 505 aa  60.1  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00244316  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2231  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.83 
 
 		 892 aa  55.1  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1310  hypothetical protein  23.39 
 
 		 376 aa  54.3  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0891  surface antigen (D15)  29.58 
 
 		 896 aa  49.7  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2996  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  33.33 
 
 		 895 aa  48.1  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3381  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  30 
 
 		 895 aa  46.2  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0660  hypothetical protein  20.09 
 
 		 492 aa  43.9  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00298688  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>