More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2307 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2807  amidophosphoribosyltransferase  83.62 
 
 		 462 aa  825    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3212  amidophosphoribosyltransferase  69.62 
 
 		 463 aa  678    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.903412  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0321  amidophosphoribosyltransferase  70.13 
 
 		 461 aa  694    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0334  amidophosphoribosyltransferase  75.43 
 
 		 462 aa  735    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.708549  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2307  amidophosphoribosyltransferase  100 
 
 		 467 aa  967    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0008  amidophosphoribosyltransferase  67.99 
 
 		 467 aa  618  1e-176  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0007  amidophosphoribosyltransferase  58.68 
 
 		 487 aa  539  9.999999999999999e-153  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2329  amidophosphoribosyltransferase  53.69 
 
 		 477 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.64237  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2068  amidophosphoribosyltransferase  53.47 
 
 		 474 aa  513  1e-144  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.286768  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1891  amidophosphoribosyltransferase  53.69 
 
 		 477 aa  514  1e-144  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1939  amidophosphoribosyltransferase  53.47 
 
 		 466 aa  507  9.999999999999999e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0122  amidophosphoribosyltransferase  56.22 
 
 		 467 aa  505  9.999999999999999e-143  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1326  amidophosphoribosyltransferase  51.56 
 
 		 468 aa  501  1e-140  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1636  amidophosphoribosyltransferase  53.01 
 
 		 467 aa  497  1e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2702  amidophosphoribosyltransferase  52.91 
 
 		 475 aa  496  1e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1153  amidophosphoribosyltransferase  52.35 
 
 		 474 aa  489  1e-137  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4621  amidophosphoribosyltransferase  51.65 
 
 		 482 aa  481  1e-134  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.059877  normal  0.48412 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1632  amidophosphoribosyltransferase  49.67 
 
 		 469 aa  478  1e-133  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1102  amidophosphoribosyltransferase  51.31 
 
 		 466 aa  475  1e-133  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2184  amidophosphoribosyltransferase  49.46 
 
 		 487 aa  475  1e-133  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3588  amidophosphoribosyltransferase  51.85 
 
 		 503 aa  472  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.51846 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5556  amidophosphoribosyltransferase  53.66 
 
 		 511 aa  472  1e-132  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.564803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4217  amidophosphoribosyltransferase  52.43 
 
 		 494 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4178  amidophosphoribosyltransferase  52.43 
 
 		 494 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1249  amidophosphoribosyltransferase  48.71 
 
 		 488 aa  469  1.0000000000000001e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.917797  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2064  amidophosphoribosyltransferase  51.53 
 
 		 475 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2047  amidophosphoribosyltransferase  52.22 
 
 		 465 aa  470  1.0000000000000001e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.330153 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1722  amidophosphoribosyltransferase  51.53 
 
 		 481 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.56305  normal  0.196104 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4318  amidophosphoribosyltransferase  51.99 
 
 		 496 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4206  amidophosphoribosyltransferase  51.09 
 
 		 485 aa  466  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.975393  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2400  amidophosphoribosyltransferase  49.23 
 
 		 514 aa  467  9.999999999999999e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.453817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0404  amidophosphoribosyltransferase  48.14 
 
 		 488 aa  463  1e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.305555  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4338  amidophosphoribosyltransferase  50.65 
 
 		 485 aa  463  1e-129  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4629  amidophosphoribosyltransferase  49.02 
 
 		 500 aa  462  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.691036  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4361  amidophosphoribosyltransferase  50.65 
 
 		 485 aa  462  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1136  amidophosphoribosyltransferase  49.89 
 
 		 470 aa  464  1e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3396  amidophosphoribosyltransferase  50.88 
 
 		 492 aa  464  1e-129  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22120  amidophosphoribosyltransferase  49.78 
 
 		 480 aa  463  1e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.357347  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1032  amidophosphoribosyltransferase  48.8 
 
 		 495 aa  461  9.999999999999999e-129  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0324  amidophosphoribosyltransferase  48.89 
 
 		 471 aa  458  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2878  amidophosphoribosyltransferase  48.48 
 
 		 517 aa  461  9.999999999999999e-129  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.116336 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0274  amidophosphoribosyltransferase  50 
 
 		 471 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0004  amidophosphoribosyltransferase  49.56 
 
 		 493 aa  459  9.999999999999999e-129  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.645305  normal  0.0907172 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0368  amidophosphoribosyltransferase  49.12 
 
 		 471 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0265  amidophosphoribosyltransferase  50.22 
 
 		 476 aa  460  9.999999999999999e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3501  amidophosphoribosyltransferase  47.69 
 
 		 509 aa  457  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0282  amidophosphoribosyltransferase  48.89 
 
 		 471 aa  457  1e-127  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0267  amidophosphoribosyltransferase  48.89 
 
 		 471 aa  457  1e-127  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0270  amidophosphoribosyltransferase  48.89 
 
 		 471 aa  457  1e-127  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1475  amidophosphoribosyltransferase  49.56 
 
 		 472 aa  456  1e-127  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2599  amidophosphoribosyltransferase  48.58 
 
 		 499 aa  457  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0391838  normal  0.218764 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0295  amidophosphoribosyltransferase  48.89 
 
 		 471 aa  457  1e-127  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.312701  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1871  amidophosphoribosyltransferase  50.78 
 
 		 451 aa  456  1e-127  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.10696  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2997  amidophosphoribosyltransferase  47.92 
 
 		 514 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.807987  normal  0.439972 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4979  amidophosphoribosyltransferase  48.67 
 
 		 471 aa  455  1e-127  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3699  amidophosphoribosyltransferase  50.88 
 
 		 493 aa  457  1e-127  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.549743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0731  amidophosphoribosyltransferase  49.22 
 
 		 478 aa  456  1e-127  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1778  hypothetical protein  48.23 
 
 		 475 aa  458  1e-127  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000929805  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0341  amidophosphoribosyltransferase  48.67 
 
 		 471 aa  455  1e-127  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0327  amidophosphoribosyltransferase  48.89 
 
 		 471 aa  457  1e-127  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2502  amidophosphoribosyltransferase  49.34 
 
 		 500 aa  452  1.0000000000000001e-126  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0276  amidophosphoribosyltransferase  48.89 
 
 		 471 aa  455  1.0000000000000001e-126  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4354  amidophosphoribosyltransferase  50 
 
 		 484 aa  453  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.463043 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2365  amidophosphoribosyltransferase  50.78 
 
 		 474 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0405  amidophosphoribosyltransferase  49.24 
 
 		 493 aa  452  1.0000000000000001e-126  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3932  amidophosphoribosyltransferase  47.69 
 
 		 491 aa  451  1e-125  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.961822  normal  0.0894126 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3487  amidophosphoribosyltransferase  46.84 
 
 		 503 aa  451  1e-125  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.746658  normal  0.621078 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4300  amidophosphoribosyltransferase  47.69 
 
 		 491 aa  451  1e-125  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.182299  normal  0.0484415 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3637  amidophosphoribosyltransferase  50 
 
 		 499 aa  449  1e-125  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.811729 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0522  amidophosphoribosyltransferase  48.34 
 
 		 465 aa  451  1e-125  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1448  amidophosphoribosyltransferase  49.01 
 
 		 474 aa  449  1e-125  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0260  amidophosphoribosyltransferase  47.78 
 
 		 470 aa  450  1e-125  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4407  amidophosphoribosyltransferase  47.25 
 
 		 491 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.972374 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3787  amidophosphoribosyltransferase  49.01 
 
 		 510 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0878  glutamine phosphoribosylpyrophosphate amidotransferase  47.25 
 
 		 503 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.141495  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1137  amidophosphoribosyltransferase  49.44 
 
 		 445 aa  445  1.0000000000000001e-124  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2072  amidophosphoribosyltransferase  48.7 
 
 		 506 aa  445  1.0000000000000001e-124  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0292  amidophosphoribosyltransferase  46.99 
 
 		 459 aa  442  1e-123  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.95663  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0578  amidophosphoribosyltransferase  46.81 
 
 		 486 aa  443  1e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2452  amidophosphoribosyltransferase  48.14 
 
 		 514 aa  444  1e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.729356 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2282  amidophosphoribosyltransferase  47.93 
 
 		 503 aa  442  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.235461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1147  amidophosphoribosyltransferase  47.84 
 
 		 478 aa  443  1e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.218005  normal  0.314166 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3894  amidophosphoribosyltransferase  46.81 
 
 		 491 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.065306 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0396  amidophosphoribosyltransferase  46.65 
 
 		 459 aa  440  9.999999999999999e-123  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0398  amidophosphoribosyltransferase  48.23 
 
 		 480 aa  437  1e-121  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0468  amidophosphoribosyltransferase  46.65 
 
 		 456 aa  436  1e-121  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.350158  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2017  amidophosphoribosyltransferase  48.9 
 
 		 504 aa  437  1e-121  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0439  amidophosphoribosyltransferase  46.43 
 
 		 459 aa  435  1e-121  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1541  amidophosphoribosyltransferase  46.37 
 
 		 502 aa  436  1e-121  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.267372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0997  amidophosphoribosyltransferase  46.92 
 
 		 482 aa  436  1e-121  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.421996  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1222  amidophosphoribosyltransferase  48.34 
 
 		 472 aa  438  1e-121  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.433131  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1205  amidophosphoribosyltransferase  47.69 
 
 		 493 aa  437  1e-121  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0174  amidophosphoribosyltransferase  46.76 
 
 		 445 aa  437  1e-121  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.838457  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1196  amidophosphoribosyltransferase  48.56 
 
 		 472 aa  437  1e-121  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0299  amidophosphoribosyltransferase  46.98 
 
 		 446 aa  437  1e-121  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0026  amidophosphoribosyltransferase  45.92 
 
 		 484 aa  434  1e-120  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1062  amidophosphoribosyltransferase  46.42 
 
 		 486 aa  432  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.739126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1523  amidophosphoribosyltransferase  46.43 
 
 		 459 aa  434  1e-120  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0119394  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2293  amidophosphoribosyltransferase  47.93 
 
 		 504 aa  434  1e-120  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0051  amidophosphoribosyltransferase  46.58 
 
 		 479 aa  433  1e-120  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>