39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0427 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0427  hypothetical protein  100 
 
 		 83 aa  160  6e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0219  hypothetical protein  37.35 
 
 		 82 aa  55.1  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2053  hypothetical protein  45.07 
 
 		 62 aa  53.9  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.920599  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0231  hypothetical protein  50 
 
 		 67 aa  52  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1846  hypothetical protein  39.73 
 
 		 72 aa  51.2  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.27595  normal  0.211162 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1159  hypothetical protein  41.1 
 
 		 64 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.136303 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0336  hypothetical protein  43.66 
 
 		 62 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6176  hypothetical protein  35.14 
 
 		 71 aa  50.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.727452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3731  hypothetical protein  42.25 
 
 		 62 aa  49.7  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1064  hypothetical protein  44.12 
 
 		 63 aa  50.1  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.710613  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1359  hypothetical protein  43.28 
 
 		 65 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1868  hypothetical protein  41.18 
 
 		 72 aa  49.7  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2598  hypothetical protein  38.24 
 
 		 73 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.275443 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0054  hypothetical protein  36.62 
 
 		 91 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0301503  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2585  hypothetical protein  40.85 
 
 		 65 aa  47  0.00008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00246477 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1499  hypothetical protein  38.03 
 
 		 68 aa  47  0.00008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0981  hypothetical protein  41.43 
 
 		 61 aa  46.6  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.995934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1281  conserved hypothetical secreted protein  43.66 
 
 		 62 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3714  hypothetical protein  41.33 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0621408 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1190  hypothetical protein  42.86 
 
 		 64 aa  45.1  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1784  hypothetical protein  44.78 
 
 		 64 aa  44.3  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.727128 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2965  hypothetical protein  39.44 
 
 		 64 aa  44.3  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.568379 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2705  hypothetical protein  35.53 
 
 		 77 aa  44.3  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000000328169  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4192  hypothetical protein  35.21 
 
 		 72 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.187436  hitchhiker  0.00134494 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3689  hypothetical protein  39.44 
 
 		 67 aa  43.9  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.188444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4705  putative transmembrane protein  44.78 
 
 		 67 aa  43.5  0.0009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.529381  normal  0.288258 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0021  hypothetical protein  36.99 
 
 		 65 aa  43.5  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0459  hypothetical protein  41.54 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000162501  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4302  hypothetical protein  39.44 
 
 		 63 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.386167  normal  0.0304485 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2520  hypothetical protein  38.89 
 
 		 70 aa  42.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0347554 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0407  hypothetical protein  36.62 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1261  hypothetical protein  40.85 
 
 		 63 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.56018 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3417  hypothetical protein  41.18 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.0064901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2751  hypothetical protein  41.18 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0347  hypothetical protein  30.99 
 
 		 62 aa  41.2  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1457  hypothetical protein  39.13 
 
 		 65 aa  41.6  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.101741  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0204  hypothetical protein  42.65 
 
 		 64 aa  41.6  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.160358 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2751  hypothetical protein  30.67 
 
 		 303 aa  41.2  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3267  hypothetical protein  39.44 
 
 		 63 aa  40.8  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>