23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2963 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_2963  hypothetical protein  100 
 
 
369 aa  773    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0734649  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2569  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  29.2 
 
 
371 aa  157  4e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000262106  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1604  hypothetical protein  28.15 
 
 
414 aa  146  7.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000195543  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1314  hypothetical protein  26.88 
 
 
438 aa  137  3.0000000000000003e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.42967 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0386  hypothetical protein  26.77 
 
 
389 aa  124  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.33173  normal  0.334793 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1317  hypothetical protein  25.92 
 
 
390 aa  110  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.600188 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2932  hypothetical protein  23.16 
 
 
397 aa  108  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1040  hypothetical protein  24.48 
 
 
418 aa  103  3e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.582207  normal  0.497226 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0534  hypothetical protein  23.04 
 
 
393 aa  71.6  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1836  hypothetical protein  22.7 
 
 
388 aa  65.5  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0417  uroporphyrinogen decarboxylase  28.72 
 
 
357 aa  60.8  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3885  hypothetical protein  23.54 
 
 
381 aa  59.7  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00209227  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2785  MtaA/CmuA family methyltransferase  27.32 
 
 
372 aa  58.2  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.271038  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0721  hypothetical protein  21.71 
 
 
391 aa  56.6  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1833  hypothetical protein  23.88 
 
 
381 aa  52  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2369  hypothetical protein  25.57 
 
 
388 aa  50.8  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0598  uroporphyrinogen decarboxylase  25.77 
 
 
335 aa  50.1  0.00007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0062  uroporphyrinogen decarboxylase  24.44 
 
 
386 aa  49.7  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.629057  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2344  uroporphyrinogen decarboxylase  27.19 
 
 
352 aa  49.3  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.198374 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1714  uroporphyrinogen decarboxylase  25.29 
 
 
354 aa  45.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.451104  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1430  uroporphyrinogen decarboxylase  21.49 
 
 
345 aa  43.9  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000852244  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2957  uroporphyrinogen-III decarboxylase-like protein  29.01 
 
 
408 aa  43.1  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0076  uroporphyrinogen decarboxylase  19.73 
 
 
363 aa  43.1  0.009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.541731  normal  0.38624 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>