25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1348 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1348  hypothetical protein  100 
 
 		 306 aa  627  1e-179  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000776472  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0004  hypothetical protein  29.72 
 
 		 240 aa  72.4  0.000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.766809  normal  0.6832 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0654  hypothetical protein  27.63 
 
 		 376 aa  67.4  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000103467  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4041  hypothetical protein  24.91 
 
 		 328 aa  59.3  0.00000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3334  hypothetical protein  23.11 
 
 		 323 aa  55.8  0.0000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0113403  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3565  hypothetical protein  20.88 
 
 		 323 aa  55.8  0.0000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000398757  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0772  hypothetical protein  20 
 
 		 323 aa  53.9  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000918011 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0542  hypothetical protein  22.16 
 
 		 323 aa  53.5  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00442686  normal  0.62984 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3238  hypothetical protein  22.22 
 
 		 322 aa  52.4  0.000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000115985  hitchhiker  0.0000123678 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0751  hypothetical protein  22.22 
 
 		 322 aa  52.4  0.000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000282854  normal  0.0187498 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0723  hypothetical protein  22.22 
 
 		 322 aa  52.4  0.000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000352049  hitchhiker  0.00201119 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03592  hypothetical protein  23.08 
 
 		 330 aa  52.4  0.000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.374945  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3906  hypothetical protein  22.42 
 
 		 322 aa  51.6  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06990  hypothetical protein  24.47 
 
 		 349 aa  50.4  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.481755  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2137  hypothetical protein  22.64 
 
 		 370 aa  49.7  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.363757  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0779  hypothetical protein  21.4 
 
 		 322 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000716166  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0811  hypothetical protein  21.4 
 
 		 322 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000176131  normal  0.246096 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0804  hypothetical protein  21.4 
 
 		 322 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000289618  hitchhiker  0.0000000000814721 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4197  hypothetical protein  20.25 
 
 		 323 aa  48.1  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000155191  hitchhiker  0.000366362 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0766  hypothetical protein  20.62 
 
 		 322 aa  47.4  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000559534  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3050  hypothetical protein  22.18 
 
 		 323 aa  46.6  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0197818  normal  0.708166 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4601  hypothetical protein  24 
 
 		 355 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0841825 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0603  hypothetical protein  24 
 
 		 355 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0609  hypothetical protein  24 
 
 		 355 aa  43.5  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0757448 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0564  hypothetical protein  24 
 
 		 362 aa  43.5  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0688358  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>