63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1256 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1256  protein of unknown function DUF342  100 
 
 		 378 aa  778    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.912515  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0251  protein of unknown function DUF342  46.47 
 
 		 381 aa  342  7e-93  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0226778 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1631  hypothetical protein  46.47 
 
 		 378 aa  326  3e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.83823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1718  hypothetical protein  41.98 
 
 		 371 aa  289  7e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0679747  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0879  hypothetical protein  27.2 
 
 		 467 aa  116  5e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00425584  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2318  hypothetical protein  29.48 
 
 		 371 aa  116  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575561 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16620  predicted polymerase, contains PALM domain, HD hydrolase domain and Zn-ribbon domain  28.12 
 
 		 611 aa  113  5e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1305  protein of unknown function DUF342  27.86 
 
 		 530 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.431943  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0176  protein of unknown function DUF342  27.47 
 
 		 660 aa  106  8e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000513292  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0498  hypothetical protein  28.77 
 
 		 542 aa  106  8e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.578621  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2021  protein of unknown function DUF342  29.43 
 
 		 463 aa  102  7e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2143  protein of unknown function DUF342  29.77 
 
 		 461 aa  100  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0160634  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1663  hypothetical protein  28.07 
 
 		 459 aa  97.8  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000175912  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0473  hypothetical protein  25.74 
 
 		 467 aa  95.5  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1423  protein of unknown function DUF342  25.82 
 
 		 622 aa  92.8  9e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000579847  normal  0.370296 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2684  hypothetical protein  26.11 
 
 		 532 aa  90.5  4e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2682  hypothetical protein  24.28 
 
 		 656 aa  89.4  1e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.254687  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0671  protein of unknown function DUF342  26.3 
 
 		 545 aa  86.7  7e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.38243e-32 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1361  polymerase  26.26 
 
 		 653 aa  84  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2978  hypothetical protein  24.07 
 
 		 555 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0539  hypothetical protein  26.49 
 
 		 555 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0568  hypothetical protein  24.93 
 
 		 556 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.235837 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0512  hypothetical protein  26.27 
 
 		 546 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3025  hypothetical protein  25.07 
 
 		 546 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.487513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4141  hypothetical protein  24.1 
 
 		 556 aa  79.3  0.00000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.5265 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3642  hypothetical protein  26.28 
 
 		 544 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000393022  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3451  hypothetical protein  23.31 
 
 		 563 aa  77  0.0000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0113855 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0674  hypothetical protein  23.31 
 
 		 563 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0199689 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3273  hypothetical protein  23.31 
 
 		 563 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00316716 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3979  hypothetical protein  22.59 
 
 		 556 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1709  hypothetical protein  25.07 
 
 		 534 aa  74.3  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0826  hypothetical protein  23.43 
 
 		 563 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1511  hypothetical protein  26.11 
 
 		 527 aa  72.4  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0872  hypothetical protein  24.35 
 
 		 541 aa  71.6  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0262539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3165  hypothetical protein  23.81 
 
 		 562 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0805  hypothetical protein  24.15 
 
 		 562 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3231  hypothetical protein  23.26 
 
 		 556 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0596  hypothetical protein  22.88 
 
 		 554 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0830  protein of unknown function DUF342  23.81 
 
 		 562 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000204321 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0837  hypothetical protein  23.81 
 
 		 562 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0219  protein of unknown function DUF342  26.04 
 
 		 501 aa  67.4  0.0000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.102298  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3531  hypothetical protein  23.47 
 
 		 562 aa  66.6  0.0000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0657  hypothetical protein  28.89 
 
 		 509 aa  65.9  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1231  hypothetical protein  22.57 
 
 		 462 aa  64.7  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2455  hypothetical protein  23.89 
 
 		 538 aa  63.5  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0194  hypothetical protein  27.95 
 
 		 455 aa  63.2  0.000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0273  hypothetical protein  24.48 
 
 		 634 aa  63.2  0.000000008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1534  polymerase  24.57 
 
 		 629 aa  61.6  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.451593  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1534  hypothetical protein  22.33 
 
 		 456 aa  61.2  0.00000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.196772  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0389  protein of unknown function DUF342  20.77 
 
 		 578 aa  58.9  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0010  hypothetical protein  22.08 
 
 		 547 aa  56.6  0.0000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.736924  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0881  hypothetical protein  22.71 
 
 		 462 aa  54.7  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000540176  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3684  hypothetical protein  24.82 
 
 		 562 aa  55.1  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2410  hypothetical protein  26.96 
 
 		 530 aa  53.9  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2234  hypothetical protein  24.38 
 
 		 484 aa  54.3  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.260747  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0192  hypothetical protein  28.33 
 
 		 455 aa  53.9  0.000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0158  hypothetical protein  29.55 
 
 		 556 aa  52  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3178  hypothetical protein  23.83 
 
 		 529 aa  52  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2246  protein of unknown function DUF342  24.1 
 
 		 520 aa  50.8  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02406  hypothetical protein  21.74 
 
 		 551 aa  50.8  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.122562  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2173  hypothetical protein  21.94 
 
 		 552 aa  48.1  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.819375  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0028  protein of unknown function DUF342  20.28 
 
 		 525 aa  47  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0090  protein of unknown function DUF342  26.63 
 
 		 565 aa  46.2  0.0008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>